MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 87478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017046	AAC	2	6	805333	805338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383495525
15002	NC_017046	TAC	2	6	805382	805387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495525
15003	NC_017046	GAA	2	6	805401	805406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495525
15004	NC_017046	GGC	2	6	805461	805466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495525
15005	NC_017046	GCGG	2	8	805476	805483	0 %	0 %	75 %	25 %	383495525
15006	NC_017046	GTA	2	6	805491	805496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495525
15007	NC_017046	AGA	2	6	805505	805510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495525
15008	NC_017046	CTGG	2	8	805532	805539	0 %	25 %	50 %	25 %	383495525
15009	NC_017046	GCG	2	6	805605	805610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495525
15010	NC_017046	TCG	2	6	805661	805666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495525
15011	NC_017046	GGA	2	6	805718	805723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383495525
15012	NC_017046	GCA	2	6	805829	805834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495525
15013	NC_017046	GCAG	2	8	806036	806043	25 %	0 %	50 %	25 %	383495525
15014	NC_017046	GAACT	2	10	806052	806061	40 %	20 %	20 %	20 %	383495525
15015	NC_017046	GGC	2	6	806145	806150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495525
15016	NC_017046	GCG	3	9	806176	806184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495525
15017	NC_017046	CGG	2	6	806264	806269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495525
15018	NC_017046	ATC	2	6	806301	806306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495525
15019	NC_017046	GAA	2	6	806316	806321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495525
15020	NC_017046	GGT	3	9	806339	806347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495525
15021	NC_017046	CAA	2	6	806360	806365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383495525
15022	NC_017046	GAA	2	6	806381	806386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495525
15023	NC_017046	ATT	2	6	806409	806414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495525
15024	NC_017046	CAG	2	6	806442	806447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495525
15025	NC_017046	GTT	2	6	806448	806453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495525
15026	NC_017046	AAT	2	6	806470	806475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495525
15027	NC_017046	TAAT	2	8	806484	806491	50 %	50 %	0 %	0 %	383495526
15028	NC_017046	TGG	2	6	806577	806582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495526
15029	NC_017046	GCG	2	6	806583	806588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495526
15030	NC_017046	GGC	2	6	806603	806608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495526
15031	NC_017046	ATCACC	2	12	806753	806764	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383495526
15032	NC_017046	CAT	2	6	806881	806886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495526
15033	NC_017046	ACC	2	6	806966	806971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495526
15034	NC_017046	CGG	2	6	807007	807012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495526
15035	NC_017046	TGA	2	6	807087	807092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495526
15036	NC_017046	CGG	2	6	807103	807108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495526
15037	NC_017046	AGA	3	9	807115	807123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495526
15038	NC_017046	GCG	2	6	807125	807130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495526
15039	NC_017046	GTT	2	6	807161	807166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495526
15040	NC_017046	CAT	2	6	807223	807228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495526
15041	NC_017046	GGT	2	6	807233	807238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495526
15042	NC_017046	TAAAA	2	10	807336	807345	80 %	20 %	0 %	0 %	383495526
15043	NC_017046	ATG	2	6	808923	808928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495527
15044	NC_017046	CTG	2	6	809019	809024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495527
15045	NC_017046	GTT	2	6	809096	809101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495527
15046	NC_017046	TAC	2	6	809172	809177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495527
15047	NC_017046	CTT	2	6	809234	809239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495527
15048	NC_017046	TTC	3	9	809265	809273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495527
15049	NC_017046	CTGG	2	8	809315	809322	0 %	25 %	50 %	25 %	383495527
15050	NC_017046	TAC	2	6	809538	809543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495527
15051	NC_017046	GCC	2	6	809592	809597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495527
15052	NC_017046	CGA	2	6	809639	809644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495527
15053	NC_017046	CCT	2	6	809725	809730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383495527
15054	NC_017046	TAT	2	6	809804	809809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495527
15055	NC_017046	CTG	2	6	809904	809909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495527
15056	NC_017046	AGC	2	6	809911	809916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495527
15057	NC_017046	GC	3	6	809918	809923	0 %	0 %	50 %	50 %	383495527
15058	NC_017046	GAA	2	6	809966	809971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495527
15059	NC_017046	CTG	3	9	809988	809996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495527
15060	NC_017046	TGAC	2	8	810016	810023	25 %	25 %	25 %	25 %	383495527
15061	NC_017046	CGA	2	6	810049	810054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495527
15062	NC_017046	ATTCC	2	10	810058	810067	20 %	40 %	0 %	40 %	383495527
15063	NC_017046	TGG	2	6	810103	810108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495527
15064	NC_017046	CTG	3	9	810120	810128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495527
15065	NC_017046	ATC	2	6	810132	810137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495527
15066	NC_017046	A	6	6	810180	810185	100 %	0 %	0 %	0 %	383495527
15067	NC_017046	GC	3	6	810194	810199	0 %	0 %	50 %	50 %	383495527
15068	NC_017046	GGTT	2	8	810243	810250	0 %	50 %	50 %	0 %	383495527
15069	NC_017046	GTC	2	6	810265	810270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495527
15070	NC_017046	CTG	2	6	810336	810341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495527
15071	NC_017046	TGG	2	6	810382	810387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495527
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15074	NC_017046	TGG	2	6	810540	810545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495528
15075	NC_017046	CTG	2	6	810546	810551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495528
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15085	NC_017046	CTG	2	6	811017	811022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495528
15086	NC_017046	GAT	2	6	811043	811048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495528
15087	NC_017046	GC	6	12	811103	811114	0 %	0 %	50 %	50 %	383495528
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15089	NC_017046	GGCG	2	8	811160	811167	0 %	0 %	75 %	25 %	383495528
15090	NC_017046	ATC	2	6	811216	811221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495528
15091	NC_017046	GCC	2	6	811224	811229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495528
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15094	NC_017046	TAA	2	6	811286	811291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495528
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15099	NC_017046	GAT	2	6	811466	811471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495528
15100	NC_017046	CCAG	2	8	811504	811511	25 %	0 %	25 %	50 %	383495528
15101	NC_017046	TGA	2	6	811525	811530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495528
15102	NC_017046	GCG	2	6	811539	811544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495528
15103	NC_017046	CT	3	6	811637	811642	0 %	50 %	0 %	50 %	383495528
15104	NC_017046	TAAG	2	8	811647	811654	50 %	25 %	25 %	0 %	383495528
15105	NC_017046	CTT	2	6	811694	811699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495529
15106	NC_017046	AAG	2	6	811764	811769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495529
15107	NC_017046	ATGT	2	8	811991	811998	25 %	50 %	25 %	0 %	383495530
15108	NC_017046	GCC	2	6	812019	812024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495530
15109	NC_017046	ATT	2	6	812054	812059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495530
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15111	NC_017046	TCG	2	6	812167	812172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495530
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15114	NC_017046	TGC	2	6	812539	812544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495531
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15117	NC_017046	ACGCA	2	10	812700	812709	40 %	0 %	20 %	40 %	383495531
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15119	NC_017046	TGAC	2	8	812826	812833	25 %	25 %	25 %	25 %	383495531
15120	NC_017046	TTGATT	2	12	812888	812899	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383495532
15121	NC_017046	CAT	2	6	812923	812928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495532
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15233	NC_017046	GCA	2	6	820283	820288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495539
15234	NC_017046	GC	3	6	820354	820359	0 %	0 %	50 %	50 %	383495539
15235	NC_017046	GGCGC	2	10	820419	820428	0 %	0 %	60 %	40 %	383495539
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15479	NC_017046	CGG	2	6	830304	830309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495550
15480	NC_017046	CGGC	2	8	830460	830467	0 %	0 %	50 %	50 %	383495550
15481	NC_017046	GCCGGT	2	12	830494	830505	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383495550
15482	NC_017046	CGC	2	6	830509	830514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495550
15483	NC_017046	GCC	2	6	830556	830561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495550
15484	NC_017046	CGG	2	6	830562	830567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495550
15485	NC_017046	GCTG	2	8	830584	830591	0 %	25 %	50 %	25 %	383495550
15486	NC_017046	GAC	2	6	830657	830662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495550
15487	NC_017046	CGG	2	6	830724	830729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495550
15488	NC_017046	GTGGAA	2	12	830810	830821	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383495550
15489	NC_017046	CGG	2	6	830851	830856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495550
15490	NC_017046	CAGC	2	8	830863	830870	25 %	0 %	25 %	50 %	383495550
15491	NC_017046	CGC	2	6	830949	830954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495550
15492	NC_017046	TGC	2	6	831015	831020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495550
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15499	NC_017046	TGGC	2	8	831254	831261	0 %	25 %	50 %	25 %	383495551
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