MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 87478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017046	GCC	2	6	238392	238397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495025
4502	NC_017046	CGC	2	6	238430	238435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495025
4503	NC_017046	CGC	2	6	238745	238750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495026
4504	NC_017046	GGC	2	6	238767	238772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495026
4505	NC_017046	GC	3	6	238850	238855	0 %	0 %	50 %	50 %	383495026
4506	NC_017046	CGG	2	6	238965	238970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495026
4507	NC_017046	GGA	2	6	239001	239006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383495026
4508	NC_017046	TGG	2	6	239023	239028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495026
4509	NC_017046	CGG	2	6	239052	239057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495026
4510	NC_017046	CGGCG	2	10	239193	239202	0 %	0 %	60 %	40 %	383495026
4511	NC_017046	CT	3	6	239209	239214	0 %	50 %	0 %	50 %	383495026
4512	NC_017046	GCG	2	6	239215	239220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495026
4513	NC_017046	CGC	2	6	239228	239233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495026
4514	NC_017046	TAT	2	6	239250	239255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495026
4515	NC_017046	TCA	2	6	239318	239323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495026
4516	NC_017046	ATT	2	6	239365	239370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495026
4517	NC_017046	TAT	2	6	239430	239435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495026
4518	NC_017046	TGC	2	6	239471	239476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495026
4519	NC_017046	GGC	2	6	239506	239511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495026
4520	NC_017046	A	6	6	239518	239523	100 %	0 %	0 %	0 %	383495026
4521	NC_017046	GCG	2	6	239537	239542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495026
4522	NC_017046	CGG	2	6	239547	239552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495026
4523	NC_017046	TTGA	2	8	239572	239579	25 %	50 %	25 %	0 %	383495026
4524	NC_017046	GCCG	2	8	239580	239587	0 %	0 %	50 %	50 %	383495026
4525	NC_017046	GGC	2	6	239593	239598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495026
4526	NC_017046	CGC	2	6	239619	239624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495026
4527	NC_017046	CTG	2	6	239650	239655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495026
4528	NC_017046	TTA	2	6	239663	239668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495026
4529	NC_017046	ACG	2	6	239680	239685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495026
4530	NC_017046	TGCTT	2	10	239687	239696	0 %	60 %	20 %	20 %	383495026
4531	NC_017046	TTC	2	6	239697	239702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495026
4532	NC_017046	GC	3	6	239705	239710	0 %	0 %	50 %	50 %	383495026
4533	NC_017046	G	6	6	239712	239717	0 %	0 %	100 %	0 %	383495026
4534	NC_017046	GCT	2	6	239748	239753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495026
4535	NC_017046	GGC	3	9	239772	239780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495026
4536	NC_017046	GGC	2	6	239847	239852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495026
4537	NC_017046	GC	3	6	239859	239864	0 %	0 %	50 %	50 %	383495026
4538	NC_017046	TGCTGG	2	12	239882	239893	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383495026
4539	NC_017046	GC	3	6	240001	240006	0 %	0 %	50 %	50 %	383495026
4540	NC_017046	GGC	2	6	240033	240038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495026
4541	NC_017046	TGA	2	6	240162	240167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495027
4542	NC_017046	GCA	2	6	240196	240201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495027
4543	NC_017046	CGG	2	6	240270	240275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495027
4544	NC_017046	TGG	2	6	240362	240367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495027
4545	NC_017046	TGG	2	6	240392	240397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495027
4546	NC_017046	AACC	2	8	240447	240454	50 %	0 %	0 %	50 %	383495027
4547	NC_017046	CTTC	2	8	240485	240492	0 %	50 %	0 %	50 %	383495027
4548	NC_017046	GCC	2	6	240657	240662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495028
4549	NC_017046	ACC	2	6	240681	240686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495028
4550	NC_017046	CAT	2	6	240692	240697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495028
4551	NC_017046	ATA	2	6	240759	240764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495028
4552	NC_017046	AAT	2	6	240827	240832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495028
4553	NC_017046	CGC	2	6	240835	240840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495028
4554	NC_017046	ACAG	2	8	240863	240870	50 %	0 %	25 %	25 %	383495028
4555	NC_017046	TGGC	2	8	240980	240987	0 %	25 %	50 %	25 %	383495028
4556	NC_017046	CGA	2	6	241024	241029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495028
4557	NC_017046	CGC	2	6	241096	241101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495028
4558	NC_017046	ACG	2	6	241113	241118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495028
4559	NC_017046	GTT	2	6	241291	241296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495029
4560	NC_017046	GCG	2	6	241299	241304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495029
4561	NC_017046	ATA	2	6	241308	241313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495029
4562	NC_017046	CCG	2	6	241509	241514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495029
4563	NC_017046	GTC	2	6	241518	241523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495029
4564	NC_017046	GAA	2	6	241582	241587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495029
4565	NC_017046	GCG	2	6	241629	241634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495029
4566	NC_017046	CTGC	2	8	241657	241664	0 %	25 %	25 %	50 %	383495029
4567	NC_017046	GGC	2	6	241691	241696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495029
4568	NC_017046	CCAC	2	8	241741	241748	25 %	0 %	0 %	75 %	383495029
4569	NC_017046	CCG	2	6	241800	241805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495029
4570	NC_017046	CGA	2	6	241813	241818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495029
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4572	NC_017046	T	6	6	241885	241890	0 %	100 %	0 %	0 %	383495029
4573	NC_017046	CGGG	2	8	241897	241904	0 %	0 %	75 %	25 %	383495029
4574	NC_017046	GCT	2	6	241916	241921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495029
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4576	NC_017046	GA	3	6	241972	241977	50 %	0 %	50 %	0 %	383495029
4577	NC_017046	CG	3	6	241987	241992	0 %	0 %	50 %	50 %	383495029
4578	NC_017046	AGC	2	6	242022	242027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495029
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4582	NC_017046	CGC	2	6	242309	242314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495030
4583	NC_017046	CT	3	6	242349	242354	0 %	50 %	0 %	50 %	383495030
4584	NC_017046	CGG	2	6	242369	242374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495030
4585	NC_017046	CCGG	2	8	242401	242408	0 %	0 %	50 %	50 %	383495030
4586	NC_017046	CGT	2	6	242456	242461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495030
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4588	NC_017046	TGA	2	6	242537	242542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495030
4589	NC_017046	GCC	2	6	242587	242592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495030
4590	NC_017046	GCC	2	6	242664	242669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495030
4591	NC_017046	GCA	2	6	242705	242710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495030
4592	NC_017046	CTT	3	9	242717	242725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495030
4593	NC_017046	ATG	2	6	242737	242742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495030
4594	NC_017046	ATCG	2	8	242843	242850	25 %	25 %	25 %	25 %	383495031
4595	NC_017046	TCG	2	6	242876	242881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495031
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4597	NC_017046	A	6	6	242986	242991	100 %	0 %	0 %	0 %	383495031
4598	NC_017046	GCA	2	6	243056	243061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495031
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4600	NC_017046	GCCT	2	8	243174	243181	0 %	25 %	25 %	50 %	383495031
4601	NC_017046	CCG	2	6	243201	243206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495031
4602	NC_017046	GGC	2	6	243224	243229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495031
4603	NC_017046	TG	3	6	243300	243305	0 %	50 %	50 %	0 %	383495031
4604	NC_017046	GAA	2	6	243333	243338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495031
4605	NC_017046	CGC	2	6	243354	243359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495031
4606	NC_017046	CGG	2	6	243455	243460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495031
4607	NC_017046	TGG	2	6	243486	243491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495031
4608	NC_017046	GAA	2	6	243527	243532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495031
4609	NC_017046	TAT	2	6	243540	243545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495031
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4612	NC_017046	GTG	2	6	243731	243736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495031
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4614	NC_017046	TGG	2	6	243766	243771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495031
4615	NC_017046	T	6	6	243831	243836	0 %	100 %	0 %	0 %	383495031
4616	NC_017046	TAAA	2	8	243859	243866	75 %	25 %	0 %	0 %	383495031
4617	NC_017046	GCC	2	6	243964	243969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495031
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4988	NC_017046	CGACAC	2	12	263565	263576	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383495047
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4991	NC_017046	GGT	2	6	263827	263832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495047
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