MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS15252 chromosome

Total Repeats: 31254

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017040	T	6	6	251	256	0 %	100 %	0 %	0 %	383479208
2	NC_017040	T	6	6	310	315	0 %	100 %	0 %	0 %	383479208
3	NC_017040	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479208
4	NC_017040	A	7	7	395	401	100 %	0 %	0 %	0 %	383479208
5	NC_017040	CTG	2	6	422	427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479208
6	NC_017040	GAA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479208
7	NC_017040	ATCA	2	8	508	515	50 %	25 %	0 %	25 %	383479208
8	NC_017040	AGC	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479208
9	NC_017040	TGC	2	6	624	629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479208
10	NC_017040	TTA	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479208
11	NC_017040	AT	3	6	768	773	50 %	50 %	0 %	0 %	383479208
12	NC_017040	TTA	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479208
13	NC_017040	GAAA	2	8	837	844	75 %	0 %	25 %	0 %	383479208
14	NC_017040	TGA	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479208
15	NC_017040	A	7	7	895	901	100 %	0 %	0 %	0 %	383479208
16	NC_017040	CT	3	6	904	909	0 %	50 %	0 %	50 %	383479208
17	NC_017040	AAG	2	6	917	922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479208
18	NC_017040	ATA	3	9	950	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479208
19	NC_017040	ACAA	2	8	959	966	75 %	0 %	0 %	25 %	383479208
20	NC_017040	ATC	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479208
21	NC_017040	AGA	2	6	1011	1016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479208
22	NC_017040	CCT	2	6	1063	1068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383479208
23	NC_017040	CAAA	2	8	1224	1231	75 %	0 %	0 %	25 %	383479208
24	NC_017040	TGC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479208
25	NC_017040	GAA	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479208
26	NC_017040	CTA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479208
27	NC_017040	TGG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383479208
28	NC_017040	TAA	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479208
29	NC_017040	A	6	6	1569	1574	100 %	0 %	0 %	0 %	383479208
30	NC_017040	ATT	2	6	1768	1773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479209
31	NC_017040	TCA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479209
32	NC_017040	GTAA	2	8	1919	1926	50 %	25 %	25 %	0 %	383479209
33	NC_017040	TTA	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479209
34	NC_017040	T	7	7	1981	1987	0 %	100 %	0 %	0 %	383479209
35	NC_017040	ATT	2	6	1994	1999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479209
36	NC_017040	AAC	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479209
37	NC_017040	GTT	2	6	2051	2056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479209
38	NC_017040	AAG	2	6	2121	2126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479209
39	NC_017040	ATT	2	6	2161	2166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479209
40	NC_017040	TAT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479209
41	NC_017040	GTC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479209
42	NC_017040	GACT	2	8	2278	2285	25 %	25 %	25 %	25 %	383479209
43	NC_017040	CAG	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479209
44	NC_017040	GA	3	6	2365	2370	50 %	0 %	50 %	0 %	383479209
45	NC_017040	CAG	2	6	2376	2381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479209
46	NC_017040	GAT	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479209
47	NC_017040	TTA	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479209
48	NC_017040	GTT	2	6	2531	2536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479209
49	NC_017040	CTT	2	6	2575	2580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383479209
50	NC_017040	GGTAA	2	10	2666	2675	40 %	20 %	40 %	0 %	383479209
51	NC_017040	AGTC	2	8	2696	2703	25 %	25 %	25 %	25 %	383479209
52	NC_017040	GAA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479209
53	NC_017040	AATT	2	8	2850	2857	50 %	50 %	0 %	0 %	383479209
54	NC_017040	TAAG	2	8	2876	2883	50 %	25 %	25 %	0 %	383479209
55	NC_017040	TGAAA	2	10	2976	2985	60 %	20 %	20 %	0 %	383479210
56	NC_017040	A	6	6	2983	2988	100 %	0 %	0 %	0 %	383479210
57	NC_017040	ATG	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479210
58	NC_017040	A	7	7	3129	3135	100 %	0 %	0 %	0 %	383479210
59	NC_017040	CAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479211
60	NC_017040	GCT	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479211
61	NC_017040	TGGTA	2	10	3603	3612	20 %	40 %	40 %	0 %	383479211
62	NC_017040	A	7	7	3661	3667	100 %	0 %	0 %	0 %	383479211
63	NC_017040	TGA	3	9	3801	3809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479211
64	NC_017040	TCAA	2	8	3907	3914	50 %	25 %	0 %	25 %	383479211
65	NC_017040	A	6	6	3935	3940	100 %	0 %	0 %	0 %	383479211
66	NC_017040	AGA	2	6	4047	4052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479211
67	NC_017040	GTT	2	6	4063	4068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479211
68	NC_017040	AAC	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479211
69	NC_017040	CAAA	2	8	4161	4168	75 %	0 %	0 %	25 %	383479211
70	NC_017040	AGT	2	6	4200	4205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479211
71	NC_017040	AGA	3	9	4224	4232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479211
72	NC_017040	AGA	2	6	4260	4265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479211
73	NC_017040	AGC	2	6	4317	4322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479211
74	NC_017040	ATC	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479211
75	NC_017040	CAG	2	6	4355	4360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479211
76	NC_017040	GCT	2	6	4414	4419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479211
77	NC_017040	TAT	2	6	4422	4427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479211
78	NC_017040	ATG	2	6	4475	4480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479211
79	NC_017040	AAG	2	6	4514	4519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479211
80	NC_017040	GAA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479211
81	NC_017040	TGT	2	6	4551	4556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479211
82	NC_017040	CAT	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479211
83	NC_017040	TTG	2	6	4679	4684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479212
84	NC_017040	A	6	6	4712	4717	100 %	0 %	0 %	0 %	383479212
85	NC_017040	GAT	2	6	4783	4788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479212
86	NC_017040	TTA	2	6	4820	4825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479212
87	NC_017040	CTA	2	6	4853	4858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479212
88	NC_017040	AAT	2	6	4867	4872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479212
89	NC_017040	CTA	2	6	4902	4907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479212
90	NC_017040	ATG	2	6	4940	4945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479212
91	NC_017040	TTACGT	2	12	4969	4980	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383479212
92	NC_017040	CAG	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479212
93	NC_017040	GAC	2	6	5072	5077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479212
94	NC_017040	TTA	2	6	5096	5101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479212
95	NC_017040	TCAAT	2	10	5115	5124	40 %	40 %	0 %	20 %	383479212
96	NC_017040	TTTA	2	8	5183	5190	25 %	75 %	0 %	0 %	383479212
97	NC_017040	A	6	6	5207	5212	100 %	0 %	0 %	0 %	383479212
98	NC_017040	ATT	2	6	5252	5257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479213
99	NC_017040	ACC	2	6	5298	5303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383479213
100	NC_017040	GAT	2	6	5373	5378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479213
101	NC_017040	A	9	9	5380	5388	100 %	0 %	0 %	0 %	383479213
102	NC_017040	TGA	2	6	5453	5458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479213
103	NC_017040	T	6	6	5475	5480	0 %	100 %	0 %	0 %	383479213
104	NC_017040	TGA	2	6	5704	5709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479213
105	NC_017040	TTA	2	6	5737	5742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479213
106	NC_017040	T	6	6	5820	5825	0 %	100 %	0 %	0 %	383479213
107	NC_017040	TGA	2	6	5828	5833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479213
108	NC_017040	AAC	2	6	5881	5886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479213
109	NC_017040	GAT	2	6	5988	5993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479213
110	NC_017040	A	6	6	5994	5999	100 %	0 %	0 %	0 %	383479213
111	NC_017040	AGA	2	6	6008	6013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479213
112	NC_017040	A	6	6	6029	6034	100 %	0 %	0 %	0 %	383479213
113	NC_017040	ATT	2	6	6071	6076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479213
114	NC_017040	ATT	2	6	6095	6100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479213
115	NC_017040	T	6	6	6129	6134	0 %	100 %	0 %	0 %	383479213
116	NC_017040	GAT	2	6	6135	6140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479213
117	NC_017040	GATTT	2	10	6169	6178	20 %	60 %	20 %	0 %	383479213
118	NC_017040	AGA	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479213
119	NC_017040	ACT	2	6	6238	6243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479213
120	NC_017040	CTT	2	6	6287	6292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383479213
121	NC_017040	T	6	6	6369	6374	0 %	100 %	0 %	0 %	383479213
122	NC_017040	TTGA	2	8	6390	6397	25 %	50 %	25 %	0 %	383479213
123	NC_017040	A	7	7	6415	6421	100 %	0 %	0 %	0 %	383479213
124	NC_017040	AAC	2	6	6425	6430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479213
125	NC_017040	ACGA	2	8	6463	6470	50 %	0 %	25 %	25 %	383479213
126	NC_017040	CCTT	2	8	6503	6510	0 %	50 %	0 %	50 %	383479213
127	NC_017040	AGTG	2	8	6512	6519	25 %	25 %	50 %	0 %	383479213
128	NC_017040	TGA	2	6	6587	6592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479213
129	NC_017040	ACG	2	6	6641	6646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479213
130	NC_017040	GATTCA	2	12	6764	6775	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383479213
131	NC_017040	TAG	2	6	6848	6853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479213
132	NC_017040	CTG	2	6	6871	6876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479213
133	NC_017040	TAA	2	6	6896	6901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479213
134	NC_017040	ATG	2	6	6907	6912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479213
135	NC_017040	TGA	2	6	6965	6970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479213
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