MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. PCC-P

Total Repeats: 58300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017039	TGC	2	6	971	976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383324081
2	NC_017039	CCA	2	6	1026	1031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383324081
3	NC_017039	GCG	2	6	1089	1094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383324081
4	NC_017039	C	6	6	1162	1167	0 %	0 %	0 %	100 %	383324081
5	NC_017039	TCC	2	6	1173	1178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383324081
6	NC_017039	CCA	2	6	1202	1207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383324081
7	NC_017039	CCCTA	2	10	1278	1287	20 %	20 %	0 %	60 %	383324081
8	NC_017039	CAG	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383324081
9	NC_017039	GAA	2	6	1417	1422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383324081
10	NC_017039	A	6	6	1471	1476	100 %	0 %	0 %	0 %	383324081
11	NC_017039	GCC	2	6	1613	1618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383324082
12	NC_017039	GAA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383324082
13	NC_017039	CAGG	2	8	1643	1650	25 %	0 %	50 %	25 %	383324082
14	NC_017039	TGG	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383324082
15	NC_017039	A	6	6	1724	1729	100 %	0 %	0 %	0 %	383324082
16	NC_017039	TCA	2	6	1806	1811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383324082
17	NC_017039	CCT	2	6	1867	1872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383324082
18	NC_017039	GTG	2	6	1991	1996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383324082
19	NC_017039	GGT	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383324082
20	NC_017039	AAC	2	6	2016	2021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383324082
21	NC_017039	TTTG	2	8	2090	2097	0 %	75 %	25 %	0 %	383324082
22	NC_017039	C	6	6	2228	2233	0 %	0 %	0 %	100 %	383324083
23	NC_017039	GTC	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383324083
24	NC_017039	TGGAG	2	10	2411	2420	20 %	20 %	60 %	0 %	383324083
25	NC_017039	CCA	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383324083
26	NC_017039	AAT	2	6	2750	2755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383324083
27	NC_017039	GCG	2	6	2797	2802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383324083
28	NC_017039	T	8	8	2817	2824	0 %	100 %	0 %	0 %	383324083
29	NC_017039	CAT	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383324083
30	NC_017039	GTT	2	6	2840	2845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383324083
31	NC_017039	TCA	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383324084
32	NC_017039	ATCG	2	8	3324	3331	25 %	25 %	25 %	25 %	383324084
33	NC_017039	GTT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383324084
34	NC_017039	ATT	2	6	3387	3392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383324084
35	NC_017039	AAT	2	6	3402	3407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383324084
36	NC_017039	TGG	2	6	3524	3529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383324084
37	NC_017039	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383324084
38	NC_017039	AGGT	2	8	3751	3758	25 %	25 %	50 %	0 %	383324084
39	NC_017039	AAG	2	6	3784	3789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383324084
40	NC_017039	TTG	2	6	3853	3858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383324084
41	NC_017039	CAA	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383324084
42	NC_017039	GGT	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383324084
43	NC_017039	TCA	2	6	4234	4239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383324084
44	NC_017039	AGT	2	6	4446	4451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383324085
45	NC_017039	GTT	2	6	4459	4464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383324085
46	NC_017039	TGG	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383324085
47	NC_017039	AAT	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383324085
48	NC_017039	TGG	2	6	4756	4761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383324085
49	NC_017039	TCT	2	6	4869	4874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383324085
50	NC_017039	CAA	2	6	4949	4954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383324085
51	NC_017039	TTC	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383324085
52	NC_017039	TCT	2	6	5013	5018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383324085
53	NC_017039	CA	3	6	5066	5071	50 %	0 %	0 %	50 %	383324085
54	NC_017039	T	6	6	5078	5083	0 %	100 %	0 %	0 %	383324085
55	NC_017039	TGG	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383324085
56	NC_017039	CAT	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383324085
57	NC_017039	C	6	6	5178	5183	0 %	0 %	0 %	100 %	383324085
58	NC_017039	AATT	2	8	5309	5316	50 %	50 %	0 %	0 %	383324085
59	NC_017039	CAA	2	6	5320	5325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383324085
60	NC_017039	TGGT	2	8	5389	5396	0 %	50 %	50 %	0 %	383324085
61	NC_017039	CCA	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383324086
62	NC_017039	TAA	2	6	5732	5737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383324086
63	NC_017039	TCA	2	6	5766	5771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383324086
64	NC_017039	CCA	2	6	5857	5862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383324086
65	NC_017039	CGG	2	6	6036	6041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383324086
66	NC_017039	G	6	6	6040	6045	0 %	0 %	100 %	0 %	383324086
67	NC_017039	GGT	2	6	6164	6169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383324086
68	NC_017039	GAA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383324086
69	NC_017039	TCT	2	6	6387	6392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383324086
70	NC_017039	GCG	2	6	6398	6403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383324086
71	NC_017039	GTG	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383324086
72	NC_017039	GAT	2	6	6478	6483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383324086
73	NC_017039	ATG	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383324086
74	NC_017039	CAA	3	9	6548	6556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383324086
75	NC_017039	AAC	2	6	6602	6607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383324086
76	NC_017039	CAA	2	6	7300	7305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383324087
77	NC_017039	GGTT	2	8	7319	7326	0 %	50 %	50 %	0 %	383324087
78	NC_017039	TGA	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383324087
79	NC_017039	CCA	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383324087
80	NC_017039	TCA	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383324087
81	NC_017039	CGC	2	6	7387	7392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383324087
82	NC_017039	C	6	6	7394	7399	0 %	0 %	0 %	100 %	383324087
83	NC_017039	AAC	2	6	7451	7456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383324087
84	NC_017039	ATC	2	6	7457	7462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383324087
85	NC_017039	TGT	2	6	7471	7476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383324087
86	NC_017039	CTT	2	6	7479	7484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383324087
87	NC_017039	GGT	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383324087
88	NC_017039	GTA	2	6	7571	7576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383324087
89	NC_017039	GTC	2	6	7611	7616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383324087
90	NC_017039	TG	3	6	7658	7663	0 %	50 %	50 %	0 %	383324087
91	NC_017039	CCG	2	6	7692	7697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383324087
92	NC_017039	GGT	2	6	7847	7852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383324087
93	NC_017039	CCT	3	9	7887	7895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383324087
94	NC_017039	ACC	2	6	7907	7912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383324087
95	NC_017039	AAG	3	9	7950	7958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383324087
96	NC_017039	ACA	2	6	7965	7970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383324087
97	NC_017039	GCC	2	6	7976	7981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383324087
98	NC_017039	CTT	2	6	8016	8021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383324087
99	NC_017039	CAA	2	6	8023	8028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383324087
100	NC_017039	CTT	3	9	8044	8052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383324087
101	NC_017039	TTCAAC	2	12	8126	8137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383324087
102	NC_017039	CTG	2	6	8295	8300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383324087
103	NC_017039	GAA	2	6	8498	8503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383324088
104	NC_017039	CGG	2	6	8511	8516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383324088
105	NC_017039	A	8	8	8543	8550	100 %	0 %	0 %	0 %	383324088
106	NC_017039	CCT	2	6	8553	8558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383324088
107	NC_017039	GAA	2	6	8567	8572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383324088
108	NC_017039	G	6	6	8601	8606	0 %	0 %	100 %	0 %	383324088
109	NC_017039	TC	3	6	8646	8651	0 %	50 %	0 %	50 %	383324088
110	NC_017039	TTG	2	6	8681	8686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383324088
111	NC_017039	TGG	2	6	8691	8696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383324088
112	NC_017039	AAAG	2	8	8709	8716	75 %	0 %	25 %	0 %	383324088
113	NC_017039	GTT	2	6	8781	8786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383324088
114	NC_017039	TGG	2	6	8868	8873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383324088
115	NC_017039	TGA	2	6	8937	8942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383324088
116	NC_017039	ACC	2	6	8959	8964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383324088
117	NC_017039	CAT	4	12	9076	9087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383324088
118	NC_017039	AAC	2	6	9090	9095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383324088
119	NC_017039	TAC	2	6	9114	9119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383324088
120	NC_017039	TC	3	6	9123	9128	0 %	50 %	0 %	50 %	383324088
121	NC_017039	AAT	2	6	9281	9286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383324088
122	NC_017039	AAG	2	6	9354	9359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383324088
123	NC_017039	AGCC	2	8	9370	9377	25 %	0 %	25 %	50 %	383324088
124	NC_017039	G	6	6	9430	9435	0 %	0 %	100 %	0 %	383324088
125	NC_017039	ACA	2	6	9492	9497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383324088
126	NC_017039	GGC	2	6	9523	9528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383324088
127	NC_017039	GGGC	2	8	9587	9594	0 %	0 %	75 %	25 %	383324088
128	NC_017039	GCA	2	6	9636	9641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383324088
129	NC_017039	C	6	6	9668	9673	0 %	0 %	0 %	100 %	383324088
130	NC_017039	A	6	6	9697	9702	100 %	0 %	0 %	0 %	383324088
131	NC_017039	ATG	2	6	9756	9761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383324088
132	NC_017039	TAG	2	6	9784	9789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383324088
133	NC_017039	TTG	2	6	9853	9858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383324088
134	NC_017039	AAT	2	6	9925	9930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383324088
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263	NC_017039	GTT	2	6	17574	17579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383324094
264	NC_017039	GCC	2	6	17640	17645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383324094
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267	NC_017039	GCG	2	6	17896	17901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383324095
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