MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSHR1132 plasmid pST75

Total Repeats: 457

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016942	CTAG	2	8	196	203	25 %	25 %	25 %	25 %	379793807
2	NC_016942	ATG	2	6	205	210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793807
3	NC_016942	TA	3	6	266	271	50 %	50 %	0 %	0 %	379793807
4	NC_016942	GAT	2	6	356	361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793807
5	NC_016942	ATT	2	6	375	380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793807
6	NC_016942	TAA	2	6	503	508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793807
7	NC_016942	TAA	2	6	515	520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793807
8	NC_016942	ATAA	2	8	599	606	75 %	25 %	0 %	0 %	379793807
9	NC_016942	TAA	2	6	655	660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793807
10	NC_016942	GCTT	2	8	661	668	0 %	50 %	25 %	25 %	379793807
11	NC_016942	TTC	2	6	676	681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793807
12	NC_016942	TTG	2	6	728	733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379793807
13	NC_016942	ATG	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793807
14	NC_016942	TC	3	6	757	762	0 %	50 %	0 %	50 %	379793807
15	NC_016942	AT	3	6	773	778	50 %	50 %	0 %	0 %	379793807
16	NC_016942	TAG	2	6	805	810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793807
17	NC_016942	AAT	2	6	857	862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793807
18	NC_016942	CT	3	6	3014	3019	0 %	50 %	0 %	50 %	379793808
19	NC_016942	TAA	2	6	3034	3039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793808
20	NC_016942	AAT	2	6	3040	3045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793808
21	NC_016942	TA	3	6	3088	3093	50 %	50 %	0 %	0 %	379793808
22	NC_016942	ATG	2	6	3104	3109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793808
23	NC_016942	AC	3	6	3156	3161	50 %	0 %	0 %	50 %	379793808
24	NC_016942	TCT	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793808
25	NC_016942	ATA	2	6	3184	3189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793808
26	NC_016942	TCT	2	6	3202	3207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793808
27	NC_016942	T	6	6	3217	3222	0 %	100 %	0 %	0 %	379793808
28	NC_016942	ATC	2	6	3251	3256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793808
29	NC_016942	A	6	6	3261	3266	100 %	0 %	0 %	0 %	379793808
30	NC_016942	ATCAC	2	10	3303	3312	40 %	20 %	0 %	40 %	379793808
31	NC_016942	AAT	3	9	3392	3400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793809
32	NC_016942	TA	3	6	3416	3421	50 %	50 %	0 %	0 %	379793809
33	NC_016942	AAT	2	6	3422	3427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793809
34	NC_016942	CAA	2	6	3454	3459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793809
35	NC_016942	AAG	2	6	3507	3512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793809
36	NC_016942	AAAATT	2	12	3513	3524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793809
37	NC_016942	AGTA	2	8	3539	3546	50 %	25 %	25 %	0 %	379793809
38	NC_016942	TTCA	2	8	3662	3669	25 %	50 %	0 %	25 %	379793809
39	NC_016942	T	6	6	3674	3679	0 %	100 %	0 %	0 %	379793809
40	NC_016942	CT	3	6	3682	3687	0 %	50 %	0 %	50 %	379793809
41	NC_016942	ATC	2	6	3701	3706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793809
42	NC_016942	ACTA	2	8	3806	3813	50 %	25 %	0 %	25 %	379793809
43	NC_016942	ATA	2	6	3822	3827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793809
44	NC_016942	A	6	6	3887	3892	100 %	0 %	0 %	0 %	379793809
45	NC_016942	TAA	2	6	3896	3901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793809
46	NC_016942	TAA	2	6	3908	3913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793809
47	NC_016942	CTG	2	6	3919	3924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379793809
48	NC_016942	CAG	3	9	3940	3948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379793809
49	NC_016942	CAA	2	6	3949	3954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793809
50	NC_016942	CATA	2	8	3965	3972	50 %	25 %	0 %	25 %	379793809
51	NC_016942	AAAT	2	8	4343	4350	75 %	25 %	0 %	0 %	379793810
52	NC_016942	AT	3	6	4349	4354	50 %	50 %	0 %	0 %	379793810
53	NC_016942	CAAA	2	8	4365	4372	75 %	0 %	0 %	25 %	379793810
54	NC_016942	T	6	6	4397	4402	0 %	100 %	0 %	0 %	379793810
55	NC_016942	TTTAA	2	10	4512	4521	40 %	60 %	0 %	0 %	379793810
56	NC_016942	ATT	2	6	5013	5018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793811
57	NC_016942	ATATT	2	10	5027	5036	40 %	60 %	0 %	0 %	379793811
58	NC_016942	TTC	2	6	5074	5079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793811
59	NC_016942	ATTGA	2	10	5117	5126	40 %	40 %	20 %	0 %	379793811
60	NC_016942	T	6	6	5167	5172	0 %	100 %	0 %	0 %	379793811
61	NC_016942	AAG	2	6	5184	5189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793811
62	NC_016942	T	7	7	5254	5260	0 %	100 %	0 %	0 %	379793811
63	NC_016942	TAA	2	6	5311	5316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793811
64	NC_016942	TTAG	2	8	5321	5328	25 %	50 %	25 %	0 %	379793811
65	NC_016942	ATC	2	6	5362	5367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793811
66	NC_016942	TCAT	2	8	5432	5439	25 %	50 %	0 %	25 %	379793811
67	NC_016942	ATT	2	6	5443	5448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793811
68	NC_016942	CTTC	2	8	5577	5584	0 %	50 %	0 %	50 %	379793811
69	NC_016942	TCT	2	6	5609	5614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793811
70	NC_016942	TTTA	2	8	5677	5684	25 %	75 %	0 %	0 %	379793811
71	NC_016942	CGT	2	6	5690	5695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379793811
72	NC_016942	T	7	7	5728	5734	0 %	100 %	0 %	0 %	379793811
73	NC_016942	CTTTT	2	10	5746	5755	0 %	80 %	0 %	20 %	379793811
74	NC_016942	T	6	6	5752	5757	0 %	100 %	0 %	0 %	379793811
75	NC_016942	TCA	2	6	5816	5821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793811
76	NC_016942	TTAG	2	8	5888	5895	25 %	50 %	25 %	0 %	379793811
77	NC_016942	TCTT	2	8	5944	5951	0 %	75 %	0 %	25 %	379793811
78	NC_016942	GAA	2	6	6438	6443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
79	NC_016942	TAA	2	6	6470	6475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793812
80	NC_016942	AGA	2	6	6530	6535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
81	NC_016942	A	6	6	6547	6552	100 %	0 %	0 %	0 %	379793812
82	NC_016942	TAC	2	6	6599	6604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793812
83	NC_016942	ACAA	2	8	6610	6617	75 %	0 %	0 %	25 %	379793812
84	NC_016942	A	8	8	6616	6623	100 %	0 %	0 %	0 %	379793812
85	NC_016942	ATA	2	6	6631	6636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793812
86	NC_016942	TAG	2	6	6667	6672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793812
87	NC_016942	A	6	6	6681	6686	100 %	0 %	0 %	0 %	379793812
88	NC_016942	AAT	2	6	6702	6707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793812
89	NC_016942	GTC	2	6	6727	6732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379793812
90	NC_016942	ACA	2	6	6738	6743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793812
91	NC_016942	AG	3	6	6812	6817	50 %	0 %	50 %	0 %	379793812
92	NC_016942	TAA	2	6	6818	6823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793812
93	NC_016942	AGAAAA	2	12	6851	6862	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379793812
94	NC_016942	CTA	2	6	6889	6894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793812
95	NC_016942	A	6	6	6922	6927	100 %	0 %	0 %	0 %	379793812
96	NC_016942	TAC	2	6	6932	6937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793812
97	NC_016942	GAA	2	6	6966	6971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
98	NC_016942	AT	3	6	7000	7005	50 %	50 %	0 %	0 %	379793812
99	NC_016942	CGA	2	6	7019	7024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379793812
100	NC_016942	GAA	2	6	7038	7043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
101	NC_016942	AGA	2	6	7052	7057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
102	NC_016942	AGA	2	6	7094	7099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
103	NC_016942	GAA	2	6	7107	7112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
104	NC_016942	GTTT	2	8	7141	7148	0 %	75 %	25 %	0 %	379793812
105	NC_016942	CAT	2	6	7325	7330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793813
106	NC_016942	AAT	2	6	7468	7473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793814
107	NC_016942	TCA	2	6	7483	7488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793814
108	NC_016942	T	6	6	7498	7503	0 %	100 %	0 %	0 %	379793814
109	NC_016942	ATCATT	2	12	7549	7560	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379793814
110	NC_016942	AGT	2	6	7666	7671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793814
111	NC_016942	AAT	3	9	7677	7685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793814
112	NC_016942	T	6	6	7719	7724	0 %	100 %	0 %	0 %	379793814
113	NC_016942	TC	3	6	7778	7783	0 %	50 %	0 %	50 %	379793814
114	NC_016942	GATTTT	2	12	7806	7817	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379793814
115	NC_016942	T	6	6	7822	7827	0 %	100 %	0 %	0 %	379793814
116	NC_016942	T	6	6	7829	7834	0 %	100 %	0 %	0 %	379793814
117	NC_016942	TAA	2	6	7839	7844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793814
118	NC_016942	TAA	2	6	7872	7877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793814
119	NC_016942	TAAT	2	8	7910	7917	50 %	50 %	0 %	0 %	379793814
120	NC_016942	CTA	2	6	7961	7966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793814
121	NC_016942	TCA	2	6	8030	8035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793814
122	NC_016942	ATTA	2	8	8606	8613	50 %	50 %	0 %	0 %	379793815
123	NC_016942	TATG	2	8	8740	8747	25 %	50 %	25 %	0 %	379793815
124	NC_016942	TCT	2	6	8754	8759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793815
125	NC_016942	TTG	2	6	8829	8834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379793815
126	NC_016942	TCA	2	6	8842	8847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793815
127	NC_016942	ATT	2	6	8869	8874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793815
128	NC_016942	TAG	2	6	8875	8880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793815
129	NC_016942	TA	3	6	8969	8974	50 %	50 %	0 %	0 %	379793815
130	NC_016942	TCTA	2	8	8995	9002	25 %	50 %	0 %	25 %	379793815
131	NC_016942	CATT	2	8	9074	9081	25 %	50 %	0 %	25 %	379793815
132	NC_016942	GTT	2	6	9100	9105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379793815
133	NC_016942	ACA	2	6	9130	9135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793815
134	NC_016942	CAA	2	6	9173	9178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793815
135	NC_016942	ATTC	2	8	9197	9204	25 %	50 %	0 %	25 %	379793815
136	NC_016942	ATT	2	6	9239	9244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793815
137	NC_016942	TAA	2	6	9277	9282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793815
138	NC_016942	ATCA	2	8	9321	9328	50 %	25 %	0 %	25 %	379793815
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