MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 chromosome

Total Repeats: 54116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_016928	TTA	2	6	2211403	2211408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379021848
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43005	NC_016928	TAAAA	2	10	2211491	2211500	80 %	20 %	0 %	0 %	379021848
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43015	NC_016928	AAT	2	6	2212027	2212032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021849
43016	NC_016928	ATA	3	9	2212127	2212135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021849
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43118	NC_016928	TAA	2	6	2216820	2216825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021852
43119	NC_016928	TCC	2	6	2216895	2216900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379021853
43120	NC_016928	ATT	2	6	2216967	2216972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379021853
43121	NC_016928	CAT	2	6	2217050	2217055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379021853
43122	NC_016928	AAT	2	6	2217056	2217061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021853
43123	NC_016928	ATT	2	6	2217095	2217100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379021853
43124	NC_016928	CAAT	2	8	2217148	2217155	50 %	25 %	0 %	25 %	379021853
43125	NC_016928	ATG	2	6	2217171	2217176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379021853
43126	NC_016928	ATA	2	6	2217217	2217222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021853
43127	NC_016928	ATA	2	6	2217233	2217238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021853
43128	NC_016928	TACCA	2	10	2217245	2217254	40 %	20 %	0 %	40 %	379021853
43129	NC_016928	AT	3	6	2217255	2217260	50 %	50 %	0 %	0 %	379021853
43130	NC_016928	AAT	2	6	2217290	2217295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021853
43131	NC_016928	ACC	2	6	2217296	2217301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379021853
43132	NC_016928	CA	3	6	2217307	2217312	50 %	0 %	0 %	50 %	379021853
43133	NC_016928	TTTG	2	8	2217356	2217363	0 %	75 %	25 %	0 %	379021853
43134	NC_016928	AAT	2	6	2217411	2217416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021853
43135	NC_016928	TTG	2	6	2217490	2217495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379021853
43136	NC_016928	ATA	2	6	2217538	2217543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021853
43137	NC_016928	TGT	2	6	2217581	2217586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379021853
43138	NC_016928	ATG	2	6	2217651	2217656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379021853
43139	NC_016928	AATG	2	8	2217657	2217664	50 %	25 %	25 %	0 %	379021853
43140	NC_016928	GTA	2	6	2217681	2217686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379021853
43141	NC_016928	AT	3	6	2217767	2217772	50 %	50 %	0 %	0 %	379021853
43142	NC_016928	AAT	2	6	2217773	2217778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021853
43143	NC_016928	CA	3	6	2217815	2217820	50 %	0 %	0 %	50 %	379021853
43144	NC_016928	ATG	3	9	2217841	2217849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379021853
43145	NC_016928	CA	3	6	2217906	2217911	50 %	0 %	0 %	50 %	379021853
43146	NC_016928	TGAACT	2	12	2218169	2218180	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379021854
43147	NC_016928	AGA	2	6	2218215	2218220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379021854
43148	NC_016928	ATTT	2	8	2218232	2218239	25 %	75 %	0 %	0 %	379021854
43149	NC_016928	ACA	3	9	2218242	2218250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379021854
43150	NC_016928	TAA	2	6	2218251	2218256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021854
43151	NC_016928	GAT	2	6	2218281	2218286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379021854
43152	NC_016928	GC	3	6	2218354	2218359	0 %	0 %	50 %	50 %	379021854
43153	NC_016928	TGATT	2	10	2218386	2218395	20 %	60 %	20 %	0 %	379021854
43154	NC_016928	A	6	6	2218605	2218610	100 %	0 %	0 %	0 %	379021854
43155	NC_016928	TGC	2	6	2218611	2218616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379021854
43156	NC_016928	TAA	2	6	2218640	2218645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021854
43157	NC_016928	TTTA	2	8	2218713	2218720	25 %	75 %	0 %	0 %	379021854
43158	NC_016928	TTC	2	6	2218842	2218847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379021854
43159	NC_016928	TCAA	2	8	2218853	2218860	50 %	25 %	0 %	25 %	379021854
43160	NC_016928	TCA	2	6	2218941	2218946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379021854
43161	NC_016928	TTAA	2	8	2218960	2218967	50 %	50 %	0 %	0 %	379021854
43162	NC_016928	ATT	2	6	2219117	2219122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379021854
43163	NC_016928	CA	3	6	2219174	2219179	50 %	0 %	0 %	50 %	379021854
43164	NC_016928	ACG	2	6	2219236	2219241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379021854
43165	NC_016928	GAA	2	6	2219283	2219288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379021854
43166	NC_016928	CAA	2	6	2219315	2219320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379021854
43167	NC_016928	TGA	2	6	2219325	2219330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379021854
43168	NC_016928	ATT	2	6	2219406	2219411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379021854
43169	NC_016928	A	6	6	2219415	2219420	100 %	0 %	0 %	0 %	379021854
43170	NC_016928	AAG	2	6	2219441	2219446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379021854
43171	NC_016928	ATCA	2	8	2219528	2219535	50 %	25 %	0 %	25 %	379021854
43172	NC_016928	CAT	2	6	2219540	2219545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379021854
43173	NC_016928	ATC	2	6	2219559	2219564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379021854
43174	NC_016928	GCATT	2	10	2219636	2219645	20 %	40 %	20 %	20 %	379021854
43175	NC_016928	AATT	2	8	2219867	2219874	50 %	50 %	0 %	0 %	379021854
43176	NC_016928	TCGT	2	8	2219930	2219937	0 %	50 %	25 %	25 %	379021854
43177	NC_016928	AC	3	6	2219977	2219982	50 %	0 %	0 %	50 %	379021854
43178	NC_016928	GT	3	6	2220057	2220062	0 %	50 %	50 %	0 %	379021854
43179	NC_016928	TAC	2	6	2220063	2220068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379021854
43180	NC_016928	CAT	2	6	2220091	2220096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379021854
43181	NC_016928	TAA	2	6	2220114	2220119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021854
43182	NC_016928	AAT	2	6	2220136	2220141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021854
43183	NC_016928	TCTT	2	8	2220323	2220330	0 %	75 %	0 %	25 %	379021855
43184	NC_016928	T	7	7	2220348	2220354	0 %	100 %	0 %	0 %	379021855
43185	NC_016928	AT	3	6	2220432	2220437	50 %	50 %	0 %	0 %	379021855
43186	NC_016928	CAG	2	6	2220523	2220528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379021855
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43188	NC_016928	T	6	6	2220664	2220669	0 %	100 %	0 %	0 %	379021855
43189	NC_016928	CAA	2	6	2220670	2220675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379021855
43190	NC_016928	TCA	2	6	2220678	2220683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379021855
43191	NC_016928	ATTT	2	8	2220694	2220701	25 %	75 %	0 %	0 %	379021855
43192	NC_016928	TTG	2	6	2220728	2220733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379021855
43193	NC_016928	CTCTT	2	10	2220743	2220752	0 %	60 %	0 %	40 %	379021855
43194	NC_016928	ATA	2	6	2220816	2220821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021855
43195	NC_016928	A	6	6	2220895	2220900	100 %	0 %	0 %	0 %	379021856
43196	NC_016928	TA	3	6	2220927	2220932	50 %	50 %	0 %	0 %	379021856
43197	NC_016928	GAT	2	6	2220963	2220968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379021856
43198	NC_016928	AAT	2	6	2221000	2221005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021856
43199	NC_016928	A	6	6	2221060	2221065	100 %	0 %	0 %	0 %	379021856
43200	NC_016928	TTG	2	6	2221074	2221079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379021856
43201	NC_016928	ATT	2	6	2221266	2221271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379021857
43202	NC_016928	ATTT	2	8	2221307	2221314	25 %	75 %	0 %	0 %	379021857
43203	NC_016928	T	7	7	2221312	2221318	0 %	100 %	0 %	0 %	379021857
43204	NC_016928	TA	3	6	2221321	2221326	50 %	50 %	0 %	0 %	379021857
43205	NC_016928	T	6	6	2221387	2221392	0 %	100 %	0 %	0 %	379021857
43206	NC_016928	CAT	2	6	2221423	2221428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379021857
43207	NC_016928	GCA	2	6	2221512	2221517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379021857
43208	NC_016928	GAAG	2	8	2221552	2221559	50 %	0 %	50 %	0 %	379021857
43209	NC_016928	TAC	2	6	2221622	2221627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379021857
43210	NC_016928	TAA	2	6	2221631	2221636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021857
43211	NC_016928	TAAT	2	8	2221838	2221845	50 %	50 %	0 %	0 %	379021858
43212	NC_016928	GAA	2	6	2221863	2221868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379021858
43213	NC_016928	TTAA	2	8	2221899	2221906	50 %	50 %	0 %	0 %	379021858
43214	NC_016928	TTA	2	6	2221911	2221916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379021858
43215	NC_016928	CTCA	2	8	2221934	2221941	25 %	25 %	0 %	50 %	379021858
43216	NC_016928	ATC	2	6	2221962	2221967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379021858
43217	NC_016928	GCA	2	6	2221995	2222000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379021858
43218	NC_016928	TAA	2	6	2222006	2222011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021858
43219	NC_016928	ACC	2	6	2222030	2222035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379021858
43220	NC_016928	ATG	2	6	2222046	2222051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379021858
43221	NC_016928	AAT	2	6	2222058	2222063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021858
43222	NC_016928	CAC	2	6	2222113	2222118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379021858
43223	NC_016928	ATA	2	6	2222178	2222183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021858
43224	NC_016928	AAGTA	2	10	2222186	2222195	60 %	20 %	20 %	0 %	379021858
43225	NC_016928	TGT	2	6	2222226	2222231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379021858
43226	NC_016928	GTAA	2	8	2222293	2222300	50 %	25 %	25 %	0 %	379021858
43227	NC_016928	AC	3	6	2222398	2222403	50 %	0 %	0 %	50 %	379021858
43228	NC_016928	AATA	2	8	2222408	2222415	75 %	25 %	0 %	0 %	379021858
43229	NC_016928	CCA	2	6	2222441	2222446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379021858
43230	NC_016928	ACC	2	6	2222492	2222497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379021858
43231	NC_016928	CAA	2	6	2222587	2222592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379021858
43232	NC_016928	TAC	2	6	2222609	2222614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379021858
43233	NC_016928	ATA	2	6	2222689	2222694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021858
43234	NC_016928	TAAA	2	8	2222746	2222753	75 %	25 %	0 %	0 %	379021858
43235	NC_016928	A	6	6	2222751	2222756	100 %	0 %	0 %	0 %	379021858
43236	NC_016928	GCA	2	6	2222799	2222804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379021858
43237	NC_016928	CAC	2	6	2222845	2222850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379021858
43238	NC_016928	TAA	2	6	2222879	2222884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021858
43239	NC_016928	CATG	2	8	2222973	2222980	25 %	25 %	25 %	25 %	379021858
43240	NC_016928	TGCAT	2	10	2223006	2223015	20 %	40 %	20 %	20 %	379021858
43241	NC_016928	ATG	2	6	2223142	2223147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379021858
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43243	NC_016928	TAATG	2	10	2223182	2223191	40 %	40 %	20 %	0 %	379021858
43244	NC_016928	AAAAT	2	10	2223205	2223214	80 %	20 %	0 %	0 %	379021858
43245	NC_016928	AC	3	6	2223217	2223222	50 %	0 %	0 %	50 %	379021858
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43247	NC_016928	AATA	2	8	2223249	2223256	75 %	25 %	0 %	0 %	379021858
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43251	NC_016928	TA	3	6	2223711	2223716	50 %	50 %	0 %	0 %	379021859
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43266	NC_016928	TGT	2	6	2224375	2224380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379021859
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43339	NC_016928	ATCT	2	8	2228898	2228905	25 %	50 %	0 %	25 %	379021863
43340	NC_016928	TTC	2	6	2229031	2229036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379021863
43341	NC_016928	GCT	2	6	2229038	2229043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379021863
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43345	NC_016928	TTTG	2	8	2229104	2229111	0 %	75 %	25 %	0 %	379021863
43346	NC_016928	T	6	6	2229178	2229183	0 %	100 %	0 %	0 %	379021863
43347	NC_016928	TGC	2	6	2229196	2229201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379021863
43348	NC_016928	CTTT	2	8	2229227	2229234	0 %	75 %	0 %	25 %	379021863
43349	NC_016928	CTT	3	9	2229240	2229248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379021863
43350	NC_016928	GTA	2	6	2229286	2229291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379021863
43351	NC_016928	AAT	3	9	2229292	2229300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021863
43352	NC_016928	ACA	2	6	2229305	2229310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379021863
43353	NC_016928	ATTC	2	8	2229412	2229419	25 %	50 %	0 %	25 %	379021863
43354	NC_016928	GTG	2	6	2229507	2229512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379021863
43355	NC_016928	GAC	2	6	2229619	2229624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379021863
43356	NC_016928	TAA	2	6	2229678	2229683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021863
43357	NC_016928	CTA	2	6	2229765	2229770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379021863
43358	NC_016928	AAT	2	6	2229800	2229805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021863
43359	NC_016928	ATCC	2	8	2229836	2229843	25 %	25 %	0 %	50 %	379021863
43360	NC_016928	CTG	3	9	2229846	2229854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379021863
43361	NC_016928	AAT	2	6	2229857	2229862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021863
43362	NC_016928	AAT	2	6	2229869	2229874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021863
43363	NC_016928	ATG	2	6	2229941	2229946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379021863
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43368	NC_016928	CCA	2	6	2230124	2230129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379021863
43369	NC_016928	CA	3	6	2230164	2230169	50 %	0 %	0 %	50 %	379021863
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43374	NC_016928	AAAT	2	8	2230410	2230417	75 %	25 %	0 %	0 %	379021863
43375	NC_016928	AT	3	6	2230438	2230443	50 %	50 %	0 %	0 %	379021863
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43380	NC_016928	CAT	2	6	2230596	2230601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379021864
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43382	NC_016928	TTGT	2	8	2230652	2230659	0 %	75 %	25 %	0 %	379021864
43383	NC_016928	GCAAT	2	10	2230675	2230684	40 %	20 %	20 %	20 %	379021864
43384	NC_016928	CTT	2	6	2230691	2230696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379021864
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43423	NC_016928	T	6	6	2232553	2232558	0 %	100 %	0 %	0 %	379021867
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43457	NC_016928	TCTTCA	2	12	2234145	2234156	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379021870
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43466	NC_016928	CAA	2	6	2234465	2234470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379021870
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43470	NC_016928	TGT	2	6	2234546	2234551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379021870
43471	NC_016928	ATG	2	6	2234590	2234595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379021870
43472	NC_016928	CAC	2	6	2234692	2234697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379021870
43473	NC_016928	CAATT	2	10	2234729	2234738	40 %	40 %	0 %	20 %	379021870
43474	NC_016928	CGA	2	6	2234779	2234784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379021870
43475	NC_016928	GTG	2	6	2235196	2235201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379021871
43476	NC_016928	TGA	2	6	2235233	2235238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379021871
43477	NC_016928	ATT	2	6	2235283	2235288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379021871
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43482	NC_016928	TAT	2	6	2235595	2235600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379021871
43483	NC_016928	CAT	2	6	2235626	2235631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379021871
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43486	NC_016928	TCA	2	6	2235681	2235686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379021871
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43490	NC_016928	TCA	2	6	2236170	2236175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379021872
43491	NC_016928	T	6	6	2236181	2236186	0 %	100 %	0 %	0 %	379021872
43492	NC_016928	AAT	2	6	2236208	2236213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021872
43493	NC_016928	TAA	2	6	2236300	2236305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379021872
43494	NC_016928	ATC	2	6	2236594	2236599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379021873
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43497	NC_016928	TCT	3	9	2236663	2236671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379021873
43498	NC_016928	AT	3	6	2236688	2236693	50 %	50 %	0 %	0 %	379021873
43499	NC_016928	ACA	2	6	2236738	2236743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379021873
43500	NC_016928	CTA	2	6	2236754	2236759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379021873

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