MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 chromosome

Total Repeats: 54116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016928	AGA	2	6	24361	24366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019830
502	NC_016928	ATGTA	2	10	24412	24421	40 %	40 %	20 %	0 %	379019830
503	NC_016928	TCT	2	6	24432	24437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019830
504	NC_016928	AACA	2	8	24456	24463	75 %	0 %	0 %	25 %	379019830
505	NC_016928	GTT	2	6	25696	25701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019831
506	NC_016928	TGA	3	9	25707	25715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019831
507	NC_016928	A	7	7	25749	25755	100 %	0 %	0 %	0 %	379019831
508	NC_016928	ATG	2	6	25790	25795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019831
509	NC_016928	GAA	3	9	25813	25821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019831
510	NC_016928	TAT	2	6	25832	25837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019831
511	NC_016928	A	6	6	25891	25896	100 %	0 %	0 %	0 %	379019831
512	NC_016928	CGT	2	6	26035	26040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019831
513	NC_016928	A	6	6	26131	26136	100 %	0 %	0 %	0 %	379019831
514	NC_016928	TGAATT	2	12	26166	26177	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379019831
515	NC_016928	ATT	2	6	26183	26188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019831
516	NC_016928	TTA	2	6	26227	26232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019831
517	NC_016928	GTAC	2	8	26266	26273	25 %	25 %	25 %	25 %	379019831
518	NC_016928	TCG	2	6	26289	26294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019831
519	NC_016928	GAT	2	6	26314	26319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019831
520	NC_016928	TCC	2	6	26366	26371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379019831
521	NC_016928	AAC	2	6	26372	26377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019831
522	NC_016928	GCT	2	6	26517	26522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019832
523	NC_016928	AAG	2	6	26533	26538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019832
524	NC_016928	TTA	2	6	26632	26637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019832
525	NC_016928	ATT	3	9	26695	26703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019832
526	NC_016928	CGA	3	9	26705	26713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019832
527	NC_016928	AATC	2	8	26733	26740	50 %	25 %	0 %	25 %	379019832
528	NC_016928	GGT	2	6	26821	26826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019832
529	NC_016928	TA	3	6	26843	26848	50 %	50 %	0 %	0 %	379019832
530	NC_016928	ATA	2	6	26930	26935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019832
531	NC_016928	TTG	2	6	26951	26956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019832
532	NC_016928	ATT	2	6	26970	26975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019832
533	NC_016928	ACCAA	2	10	27016	27025	60 %	0 %	0 %	40 %	379019832
534	NC_016928	ATG	2	6	27098	27103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019832
535	NC_016928	TAA	2	6	27129	27134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019832
536	NC_016928	AAG	2	6	27152	27157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019832
537	NC_016928	TAT	2	6	27222	27227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019832
538	NC_016928	CCG	2	6	27237	27242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379019832
539	NC_016928	AGA	2	6	27297	27302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019832
540	NC_016928	CAT	2	6	27303	27308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019832
541	NC_016928	GAA	2	6	27358	27363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019832
542	NC_016928	AAT	2	6	27373	27378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019832
543	NC_016928	TTA	2	6	27388	27393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019832
544	NC_016928	GAA	3	9	27403	27411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019832
545	NC_016928	AAC	3	9	27500	27508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019832
546	NC_016928	CGT	2	6	27523	27528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019832
547	NC_016928	TTG	2	6	27533	27538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019832
548	NC_016928	GAA	2	6	27601	27606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019832
549	NC_016928	GAA	2	6	27658	27663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019832
550	NC_016928	ATCAA	2	10	27728	27737	60 %	20 %	0 %	20 %	379019832
551	NC_016928	TAA	2	6	27768	27773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019832
552	NC_016928	ATT	2	6	27775	27780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019832
553	NC_016928	ACA	2	6	27808	27813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019832
554	NC_016928	GGT	2	6	28075	28080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019832
555	NC_016928	ATCT	2	8	28167	28174	25 %	50 %	0 %	25 %	379019832
556	NC_016928	AAT	2	6	28220	28225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019832
557	NC_016928	ACT	2	6	28255	28260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019833
558	NC_016928	TGA	2	6	28266	28271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019833
559	NC_016928	AT	3	6	28285	28290	50 %	50 %	0 %	0 %	379019833
560	NC_016928	AAG	2	6	28340	28345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019833
561	NC_016928	GAAAC	2	10	28349	28358	60 %	0 %	20 %	20 %	379019833
562	NC_016928	ATT	2	6	28412	28417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019833
563	NC_016928	ATC	2	6	28431	28436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019833
564	NC_016928	GAAGT	2	10	28499	28508	40 %	20 %	40 %	0 %	379019833
565	NC_016928	TCG	2	6	28522	28527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019833
566	NC_016928	TGA	2	6	28539	28544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019833
567	NC_016928	ATT	2	6	28570	28575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019833
568	NC_016928	ATTTCA	2	12	28650	28661	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379019833
569	NC_016928	ATG	2	6	28680	28685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019833
570	NC_016928	TGA	2	6	28687	28692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019833
571	NC_016928	AAC	2	6	28744	28749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019833
572	NC_016928	AGC	2	6	28783	28788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019833
573	NC_016928	A	6	6	28793	28798	100 %	0 %	0 %	0 %	379019833
574	NC_016928	ATC	2	6	28820	28825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019833
575	NC_016928	ACAA	2	8	28826	28833	75 %	0 %	0 %	25 %	379019833
576	NC_016928	ACG	2	6	28850	28855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019833
577	NC_016928	AATG	2	8	28930	28937	50 %	25 %	25 %	0 %	379019833
578	NC_016928	TCGT	2	8	28962	28969	0 %	50 %	25 %	25 %	379019833
579	NC_016928	GTG	2	6	28980	28985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019833
580	NC_016928	ACA	2	6	28995	29000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019833
581	NC_016928	ATA	2	6	29001	29006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019833
582	NC_016928	GAA	2	6	29090	29095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019833
583	NC_016928	TTA	2	6	29118	29123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019833
584	NC_016928	TGG	2	6	29131	29136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019833
585	NC_016928	ATT	2	6	29158	29163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019833
586	NC_016928	AAT	2	6	29171	29176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019833
587	NC_016928	TAA	2	6	29227	29232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019833
588	NC_016928	TCG	2	6	29287	29292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019833
589	NC_016928	GTT	2	6	29312	29317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019833
590	NC_016928	ATA	2	6	29331	29336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019833
591	NC_016928	AACA	2	8	29407	29414	75 %	0 %	0 %	25 %	379019833
592	NC_016928	ATG	2	6	29508	29513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019833
593	NC_016928	TAA	2	6	29629	29634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019834
594	NC_016928	CA	3	6	29646	29651	50 %	0 %	0 %	50 %	379019834
595	NC_016928	AAG	2	6	29691	29696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019834
596	NC_016928	GCA	2	6	29813	29818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019834
597	NC_016928	ATT	2	6	29830	29835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019834
598	NC_016928	GT	3	6	29910	29915	0 %	50 %	50 %	0 %	379019834
599	NC_016928	GTTCTG	2	12	29949	29960	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379019834
600	NC_016928	AGA	2	6	30031	30036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019834
601	NC_016928	CAAT	2	8	30059	30066	50 %	25 %	0 %	25 %	379019834
602	NC_016928	GATG	2	8	30067	30074	25 %	25 %	50 %	0 %	379019834
603	NC_016928	ATTAT	2	10	30142	30151	40 %	60 %	0 %	0 %	379019834
604	NC_016928	A	6	6	30164	30169	100 %	0 %	0 %	0 %	379019834
605	NC_016928	TGA	2	6	30172	30177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019834
606	NC_016928	TAC	2	6	30200	30205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019834
607	NC_016928	AACGA	2	10	30215	30224	60 %	0 %	20 %	20 %	379019834
608	NC_016928	TACT	2	8	30289	30296	25 %	50 %	0 %	25 %	379019834
609	NC_016928	ATA	2	6	30312	30317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019834
610	NC_016928	ATT	2	6	30326	30331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019834
611	NC_016928	GTA	2	6	30765	30770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019835
612	NC_016928	GAA	2	6	30845	30850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019835
613	NC_016928	GGCA	2	8	30987	30994	25 %	0 %	50 %	25 %	379019835
614	NC_016928	AAAG	2	8	31000	31007	75 %	0 %	25 %	0 %	379019835
615	NC_016928	ATG	2	6	31101	31106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019835
616	NC_016928	ATA	2	6	31134	31139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019835
617	NC_016928	AAG	2	6	31145	31150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019835
618	NC_016928	AAC	2	6	31284	31289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019835
619	NC_016928	ATA	2	6	31398	31403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019835
620	NC_016928	GAAC	2	8	31444	31451	50 %	0 %	25 %	25 %	379019835
621	NC_016928	AAG	2	6	31470	31475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019835
622	NC_016928	AT	3	6	31514	31519	50 %	50 %	0 %	0 %	379019835
623	NC_016928	TAC	2	6	31765	31770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019836
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625	NC_016928	AAC	2	6	31871	31876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019836
626	NC_016928	CAA	2	6	31902	31907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019836
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628	NC_016928	TCA	2	6	31931	31936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019836
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