MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 52464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45502	NC_016912	TAA	2	6	2323753	2323758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015505
45503	NC_016912	CA	3	6	2323777	2323782	50 %	0 %	0 %	50 %	379015505
45504	NC_016912	ACA	2	6	2323833	2323838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015505
45505	NC_016912	ACTAAT	2	12	2323839	2323850	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379015505
45506	NC_016912	TAA	2	6	2323862	2323867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015505
45507	NC_016912	TAA	2	6	2323885	2323890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015505
45508	NC_016912	GTA	2	6	2323893	2323898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015505
45509	NC_016912	AATG	2	8	2323901	2323908	50 %	25 %	25 %	0 %	379015505
45510	NC_016912	GTG	2	6	2323921	2323926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379015505
45511	NC_016912	ATC	2	6	2323947	2323952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015505
45512	NC_016912	T	6	6	2324003	2324008	0 %	100 %	0 %	0 %	379015505
45513	NC_016912	CAG	2	6	2324014	2324019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015505
45514	NC_016912	CTAATC	2	12	2324020	2324031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015505
45515	NC_016912	GAA	2	6	2324045	2324050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015505
45516	NC_016912	ATA	2	6	2324052	2324057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015505
45517	NC_016912	TAA	2	6	2324060	2324065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015505
45518	NC_016912	A	6	6	2324087	2324092	100 %	0 %	0 %	0 %	379015505
45519	NC_016912	AAT	2	6	2324102	2324107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015505
45520	NC_016912	CTG	2	6	2324152	2324157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015505
45521	NC_016912	TTGA	2	8	2324167	2324174	25 %	50 %	25 %	0 %	379015505
45522	NC_016912	TTG	2	6	2324203	2324208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015505
45523	NC_016912	TTG	2	6	2324269	2324274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015505
45524	NC_016912	TAA	2	6	2324275	2324280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015505
45525	NC_016912	TTAA	2	8	2324391	2324398	50 %	50 %	0 %	0 %	379015505
45526	NC_016912	ATA	2	6	2324455	2324460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015505
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45529	NC_016912	TAGG	2	8	2324506	2324513	25 %	25 %	50 %	0 %	379015505
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45532	NC_016912	TTA	2	6	2324818	2324823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015506
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45535	NC_016912	T	6	6	2324915	2324920	0 %	100 %	0 %	0 %	379015506
45536	NC_016912	CAA	2	6	2325026	2325031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015506
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45538	NC_016912	T	8	8	2325070	2325077	0 %	100 %	0 %	0 %	379015506
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45542	NC_016912	TTC	2	6	2325537	2325542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015507
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45544	NC_016912	ATG	2	6	2325629	2325634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015507
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45546	NC_016912	GT	3	6	2325665	2325670	0 %	50 %	50 %	0 %	379015507
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45550	NC_016912	TAAT	2	8	2325872	2325879	50 %	50 %	0 %	0 %	379015507
45551	NC_016912	A	6	6	2325922	2325927	100 %	0 %	0 %	0 %	379015507
45552	NC_016912	TCAA	2	8	2326159	2326166	50 %	25 %	0 %	25 %	379015508
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45554	NC_016912	AT	4	8	2326267	2326274	50 %	50 %	0 %	0 %	379015508
45555	NC_016912	TAAA	2	8	2326318	2326325	75 %	25 %	0 %	0 %	379015508
45556	NC_016912	AAT	3	9	2326347	2326355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015508
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45564	NC_016912	TACG	2	8	2326801	2326808	25 %	25 %	25 %	25 %	379015509
45565	NC_016912	GTG	2	6	2326818	2326823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379015509
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45608	NC_016912	ATCCA	2	10	2329630	2329639	40 %	20 %	0 %	40 %	379015510
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45614	NC_016912	TAA	2	6	2330120	2330125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015511
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45617	NC_016912	TGT	2	6	2330318	2330323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015511
45618	NC_016912	ATTC	2	8	2330356	2330363	25 %	50 %	0 %	25 %	379015511
45619	NC_016912	TGT	2	6	2330372	2330377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015511
45620	NC_016912	TA	3	6	2330407	2330412	50 %	50 %	0 %	0 %	379015511
45621	NC_016912	AAT	2	6	2330430	2330435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015511
45622	NC_016912	TCA	2	6	2330439	2330444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015511
45623	NC_016912	CTC	2	6	2330501	2330506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379015511
45624	NC_016912	ATC	2	6	2330507	2330512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015511
45625	NC_016912	TGG	2	6	2330591	2330596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379015511
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45627	NC_016912	ACA	2	6	2330730	2330735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015511
45628	NC_016912	ATC	2	6	2330741	2330746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015511
45629	NC_016912	GCTC	2	8	2330866	2330873	0 %	25 %	25 %	50 %	379015512
45630	NC_016912	ATTC	2	8	2330874	2330881	25 %	50 %	0 %	25 %	379015512
45631	NC_016912	ATTT	2	8	2330988	2330995	25 %	75 %	0 %	0 %	379015512
45632	NC_016912	CTT	2	6	2331032	2331037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015512
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45634	NC_016912	AAC	2	6	2331051	2331056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015512
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45638	NC_016912	ATC	2	6	2331174	2331179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015512
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45640	NC_016912	ATC	2	6	2331219	2331224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015512
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45642	NC_016912	AT	3	6	2331241	2331246	50 %	50 %	0 %	0 %	379015512
45643	NC_016912	TCT	2	6	2331283	2331288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015512
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45646	NC_016912	CTTT	2	8	2331369	2331376	0 %	75 %	0 %	25 %	379015512
45647	NC_016912	CAT	2	6	2331405	2331410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015512
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45649	NC_016912	TGA	2	6	2331447	2331452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015512
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45681	NC_016912	TGT	2	6	2332546	2332551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015514
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45683	NC_016912	AT	3	6	2332616	2332621	50 %	50 %	0 %	0 %	379015514
45684	NC_016912	GTA	2	6	2332654	2332659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015514
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45688	NC_016912	CATC	2	8	2332766	2332773	25 %	25 %	0 %	50 %	379015514
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45692	NC_016912	TTTC	2	8	2332864	2332871	0 %	75 %	0 %	25 %	379015514
45693	NC_016912	ATAACG	2	12	2332911	2332922	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379015514
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45698	NC_016912	T	6	6	2333335	2333340	0 %	100 %	0 %	0 %	379015515
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45703	NC_016912	TGT	2	6	2333504	2333509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015515
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45705	NC_016912	T	6	6	2333536	2333541	0 %	100 %	0 %	0 %	379015515
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45720	NC_016912	TCA	2	6	2334498	2334503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015516
45721	NC_016912	GCAAC	2	10	2334534	2334543	40 %	0 %	20 %	40 %	379015516
45722	NC_016912	CAT	2	6	2334581	2334586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015516
45723	NC_016912	TCT	3	9	2334615	2334623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015516
45724	NC_016912	T	6	6	2334625	2334630	0 %	100 %	0 %	0 %	379015516
45725	NC_016912	ACC	2	6	2334662	2334667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015516
45726	NC_016912	TTCAAT	2	12	2334698	2334709	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379015516
45727	NC_016912	GTT	2	6	2334771	2334776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015516
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45729	NC_016912	TAAT	2	8	2334817	2334824	50 %	50 %	0 %	0 %	379015516
45730	NC_016912	A	6	6	2334841	2334846	100 %	0 %	0 %	0 %	379015516
45731	NC_016912	ACC	2	6	2334920	2334925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015516
45732	NC_016912	GTT	2	6	2334986	2334991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015516
45733	NC_016912	CCT	2	6	2335124	2335129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379015517
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45735	NC_016912	TCC	2	6	2335212	2335217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379015517
45736	NC_016912	TG	3	6	2335259	2335264	0 %	50 %	50 %	0 %	379015517
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45766	NC_016912	AACC	2	8	2336866	2336873	50 %	0 %	0 %	50 %	379015517
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45849	NC_016912	GTCGT	2	10	2340849	2340858	0 %	40 %	40 %	20 %	379015520
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