MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 52464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_016912	CAT	2	6	2245476	2245481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015431
44002	NC_016912	CAAT	2	8	2245514	2245521	50 %	25 %	0 %	25 %	379015431
44003	NC_016912	TTCA	2	8	2245531	2245538	25 %	50 %	0 %	25 %	379015431
44004	NC_016912	CATC	2	8	2245674	2245681	25 %	25 %	0 %	50 %	379015431
44005	NC_016912	TAT	2	6	2245683	2245688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015431
44006	NC_016912	ATT	2	6	2245705	2245710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015431
44007	NC_016912	CTT	2	6	2245764	2245769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015431
44008	NC_016912	CAT	2	6	2245785	2245790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015431
44009	NC_016912	ATCA	2	8	2245819	2245826	50 %	25 %	0 %	25 %	379015431
44010	NC_016912	TAC	2	6	2245830	2245835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015431
44011	NC_016912	TAA	2	6	2245944	2245949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015431
44012	NC_016912	ACC	2	6	2246003	2246008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015431
44013	NC_016912	TAC	2	6	2246622	2246627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015432
44014	NC_016912	TAA	2	6	2246642	2246647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015432
44015	NC_016912	AGT	2	6	2246686	2246691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015432
44016	NC_016912	GCC	2	6	2246711	2246716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379015432
44017	NC_016912	TTA	2	6	2246736	2246741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015432
44018	NC_016912	ATT	2	6	2246813	2246818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015432
44019	NC_016912	TCAT	2	8	2246826	2246833	25 %	50 %	0 %	25 %	379015432
44020	NC_016912	GAT	2	6	2246856	2246861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015432
44021	NC_016912	GTT	2	6	2246908	2246913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015432
44022	NC_016912	CAC	2	6	2246926	2246931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015432
44023	NC_016912	CTT	3	9	2246938	2246946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015432
44024	NC_016912	TAA	2	6	2246956	2246961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015432
44025	NC_016912	CTG	2	6	2246993	2246998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015432
44026	NC_016912	TTAC	2	8	2247039	2247046	25 %	50 %	0 %	25 %	379015432
44027	NC_016912	CCG	2	6	2247057	2247062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379015432
44028	NC_016912	CTAT	2	8	2247066	2247073	25 %	50 %	0 %	25 %	379015432
44029	NC_016912	CCAT	2	8	2247087	2247094	25 %	25 %	0 %	50 %	379015432
44030	NC_016912	CATT	2	8	2247124	2247131	25 %	50 %	0 %	25 %	379015432
44031	NC_016912	CCA	2	6	2247165	2247170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015432
44032	NC_016912	T	6	6	2247190	2247195	0 %	100 %	0 %	0 %	379015432
44033	NC_016912	AGT	2	6	2247197	2247202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015432
44034	NC_016912	CAA	2	6	2247211	2247216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015432
44035	NC_016912	TACT	2	8	2247241	2247248	25 %	50 %	0 %	25 %	379015432
44036	NC_016912	TTC	2	6	2247258	2247263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015432
44037	NC_016912	GATA	2	8	2247275	2247282	50 %	25 %	25 %	0 %	379015432
44038	NC_016912	ATA	2	6	2247288	2247293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015432
44039	NC_016912	T	6	6	2247392	2247397	0 %	100 %	0 %	0 %	379015432
44040	NC_016912	TTA	2	6	2247441	2247446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015432
44041	NC_016912	TAA	2	6	2247451	2247456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015432
44042	NC_016912	AGC	2	6	2247464	2247469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015432
44043	NC_016912	TACA	2	8	2247470	2247477	50 %	25 %	0 %	25 %	379015432
44044	NC_016912	T	7	7	2247529	2247535	0 %	100 %	0 %	0 %	379015432
44045	NC_016912	ATCT	2	8	2247702	2247709	25 %	50 %	0 %	25 %	379015433
44046	NC_016912	ACC	2	6	2247722	2247727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015433
44047	NC_016912	TTA	2	6	2247768	2247773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015433
44048	NC_016912	TAA	2	6	2247778	2247783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015433
44049	NC_016912	GTC	2	6	2247825	2247830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015433
44050	NC_016912	GCA	2	6	2247867	2247872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015433
44051	NC_016912	AAAT	2	8	2247983	2247990	75 %	25 %	0 %	0 %	379015433
44052	NC_016912	TCA	2	6	2248009	2248014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015433
44053	NC_016912	ATA	2	6	2248032	2248037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015433
44054	NC_016912	TGG	2	6	2248058	2248063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379015433
44055	NC_016912	TTC	2	6	2248064	2248069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015433
44056	NC_016912	TACG	2	8	2248142	2248149	25 %	25 %	25 %	25 %	379015433
44057	NC_016912	ATA	2	6	2248185	2248190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015433
44058	NC_016912	AAT	2	6	2248192	2248197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015433
44059	NC_016912	CTT	2	6	2248198	2248203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015433
44060	NC_016912	TCATT	2	10	2248273	2248282	20 %	60 %	0 %	20 %	379015433
44061	NC_016912	T	6	6	2248285	2248290	0 %	100 %	0 %	0 %	379015433
44062	NC_016912	TTG	2	6	2248334	2248339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015433
44063	NC_016912	TTG	3	9	2248343	2248351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015433
44064	NC_016912	AAATC	2	10	2248377	2248386	60 %	20 %	0 %	20 %	379015433
44065	NC_016912	TAAT	2	8	2248417	2248424	50 %	50 %	0 %	0 %	379015433
44066	NC_016912	TAA	2	6	2248911	2248916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015434
44067	NC_016912	CAA	2	6	2248928	2248933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015434
44068	NC_016912	A	7	7	2248937	2248943	100 %	0 %	0 %	0 %	379015434
44069	NC_016912	TGA	2	6	2249005	2249010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015434
44070	NC_016912	TGG	2	6	2249056	2249061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379015434
44071	NC_016912	ACA	2	6	2249071	2249076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015434
44072	NC_016912	AGTC	2	8	2249147	2249154	25 %	25 %	25 %	25 %	379015434
44073	NC_016912	TGA	2	6	2249269	2249274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015434
44074	NC_016912	CA	3	6	2249275	2249280	50 %	0 %	0 %	50 %	379015434
44075	NC_016912	TAG	2	6	2249346	2249351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015434
44076	NC_016912	TGA	2	6	2249362	2249367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015434
44077	NC_016912	TATT	2	8	2249391	2249398	25 %	75 %	0 %	0 %	379015434
44078	NC_016912	ATTC	2	8	2249499	2249506	25 %	50 %	0 %	25 %	379015434
44079	NC_016912	ATC	2	6	2249547	2249552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015434
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44083	NC_016912	TAGAA	2	10	2249987	2249996	60 %	20 %	20 %	0 %	379015435
44084	NC_016912	ATG	2	6	2250021	2250026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015435
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44086	NC_016912	TTTA	2	8	2250110	2250117	25 %	75 %	0 %	0 %	379015435
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44088	NC_016912	A	6	6	2250144	2250149	100 %	0 %	0 %	0 %	379015435
44089	NC_016912	TAAT	2	8	2250166	2250173	50 %	50 %	0 %	0 %	379015435
44090	NC_016912	T	6	6	2250184	2250189	0 %	100 %	0 %	0 %	379015435
44091	NC_016912	TTA	2	6	2250239	2250244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015435
44092	NC_016912	GAAA	2	8	2250255	2250262	75 %	0 %	25 %	0 %	379015436
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44097	NC_016912	CTT	2	6	2250447	2250452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015436
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44100	NC_016912	TTTA	2	8	2250561	2250568	25 %	75 %	0 %	0 %	379015436
44101	NC_016912	AT	3	6	2250625	2250630	50 %	50 %	0 %	0 %	379015436
44102	NC_016912	AAT	2	6	2250657	2250662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015436
44103	NC_016912	T	6	6	2250690	2250695	0 %	100 %	0 %	0 %	379015436
44104	NC_016912	AAAT	2	8	2250744	2250751	75 %	25 %	0 %	0 %	379015436
44105	NC_016912	CCAATC	2	12	2250760	2250771	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379015436
44106	NC_016912	TG	3	6	2250787	2250792	0 %	50 %	50 %	0 %	379015436
44107	NC_016912	ATA	2	6	2250828	2250833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015436
44108	NC_016912	CAAA	2	8	2250836	2250843	75 %	0 %	0 %	25 %	379015436
44109	NC_016912	TC	3	6	2250913	2250918	0 %	50 %	0 %	50 %	379015436
44110	NC_016912	T	7	7	2250946	2250952	0 %	100 %	0 %	0 %	379015436
44111	NC_016912	ACA	2	6	2251037	2251042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015437
44112	NC_016912	ATA	2	6	2251081	2251086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015437
44113	NC_016912	TGAAT	2	10	2251148	2251157	40 %	40 %	20 %	0 %	379015437
44114	NC_016912	CAT	2	6	2251177	2251182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015437
44115	NC_016912	AT	3	6	2251181	2251186	50 %	50 %	0 %	0 %	379015437
44116	NC_016912	TAT	2	6	2251209	2251214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015437
44117	NC_016912	ACT	2	6	2251226	2251231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015437
44118	NC_016912	TAA	2	6	2251232	2251237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015437
44119	NC_016912	ATT	2	6	2251313	2251318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015437
44120	NC_016912	ATAG	2	8	2251806	2251813	50 %	25 %	25 %	0 %	379015438
44121	NC_016912	AT	3	6	2251823	2251828	50 %	50 %	0 %	0 %	379015438
44122	NC_016912	A	7	7	2251840	2251846	100 %	0 %	0 %	0 %	379015438
44123	NC_016912	TTA	2	6	2251914	2251919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015438
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44127	NC_016912	TAC	2	6	2252090	2252095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015438
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44223	NC_016912	TAA	2	6	2256501	2256506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015444
44224	NC_016912	CAA	2	6	2256569	2256574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015444
44225	NC_016912	TAA	2	6	2256623	2256628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015444
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44227	NC_016912	CATT	2	8	2256712	2256719	25 %	50 %	0 %	25 %	379015444
44228	NC_016912	AT	3	6	2256729	2256734	50 %	50 %	0 %	0 %	379015444
44229	NC_016912	CGT	2	6	2256774	2256779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015444
44230	NC_016912	CATTA	2	10	2256822	2256831	40 %	40 %	0 %	20 %	379015444
44231	NC_016912	ACA	2	6	2256849	2256854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015444
44232	NC_016912	GGT	2	6	2256886	2256891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379015444
44233	NC_016912	ATA	2	6	2256931	2256936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015444
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44235	NC_016912	AAT	2	6	2256957	2256962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015444
44236	NC_016912	TAACA	2	10	2257026	2257035	60 %	20 %	0 %	20 %	379015444
44237	NC_016912	TGT	2	6	2257078	2257083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015444
44238	NC_016912	AAAT	2	8	2257088	2257095	75 %	25 %	0 %	0 %	379015444
44239	NC_016912	GCT	2	6	2257105	2257110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015444
44240	NC_016912	A	6	6	2257126	2257131	100 %	0 %	0 %	0 %	379015444
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44244	NC_016912	TAAG	2	8	2257506	2257513	50 %	25 %	25 %	0 %	379015445
44245	NC_016912	AAAC	2	8	2257558	2257565	75 %	0 %	0 %	25 %	379015445
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44251	NC_016912	TAT	2	6	2257846	2257851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015445
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44341	NC_016912	TAAAA	2	10	2262526	2262535	80 %	20 %	0 %	0 %	379015449
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44352	NC_016912	TAA	2	6	2263067	2263072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015450
44353	NC_016912	CCA	2	6	2263083	2263088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015450
44354	NC_016912	AC	3	6	2263124	2263129	50 %	0 %	0 %	50 %	379015450
44355	NC_016912	TGTT	2	8	2263192	2263199	0 %	75 %	25 %	0 %	379015450
44356	NC_016912	T	6	6	2263213	2263218	0 %	100 %	0 %	0 %	379015450
44357	NC_016912	ATA	2	6	2263276	2263281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015450
44358	NC_016912	CAT	2	6	2263292	2263297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015450
44359	NC_016912	AAT	2	6	2263453	2263458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015450
44360	NC_016912	TA	4	8	2263467	2263474	50 %	50 %	0 %	0 %	379015450
44361	NC_016912	ATA	2	6	2263535	2263540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015450
44362	NC_016912	ATA	2	6	2263564	2263569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015450
44363	NC_016912	TTC	2	6	2264109	2264114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015451
44364	NC_016912	T	6	6	2264177	2264182	0 %	100 %	0 %	0 %	379015451
44365	NC_016912	CCA	2	6	2264215	2264220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015451
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44374	NC_016912	CTT	2	6	2264666	2264671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015451
44375	NC_016912	TTC	2	6	2264682	2264687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015451
44376	NC_016912	CTT	2	6	2264720	2264725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015451
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44384	NC_016912	CAA	2	6	2265073	2265078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015452
44385	NC_016912	A	6	6	2265077	2265082	100 %	0 %	0 %	0 %	379015452
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44433	NC_016912	ATCA	2	8	2267698	2267705	50 %	25 %	0 %	25 %	379015454
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44452	NC_016912	AT	4	8	2268947	2268954	50 %	50 %	0 %	0 %	379015454
44453	NC_016912	T	6	6	2268994	2268999	0 %	100 %	0 %	0 %	379015454
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44458	NC_016912	TCT	2	6	2269223	2269228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015454
44459	NC_016912	TTG	2	6	2269256	2269261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015454
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44461	NC_016912	T	7	7	2269318	2269324	0 %	100 %	0 %	0 %	379015454
44462	NC_016912	ATT	2	6	2269507	2269512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015455
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44464	NC_016912	ATA	2	6	2269544	2269549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015455
44465	NC_016912	AGCC	2	8	2269582	2269589	25 %	0 %	25 %	50 %	379015455
44466	NC_016912	A	7	7	2269609	2269615	100 %	0 %	0 %	0 %	379015455
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