MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Shewanella baltica OS678 plasmid pSBAL67801

Total Repeats: 1272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016905	TCA	2	6	59589	59594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715535
1002	NC_016905	TAA	2	6	59675	59680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715535
1003	NC_016905	CTA	2	6	59703	59708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715535
1004	NC_016905	AGAT	2	8	59717	59724	50 %	25 %	25 %	0 %	378715535
1005	NC_016905	CCT	2	6	59766	59771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715535
1006	NC_016905	TCAT	2	8	59838	59845	25 %	50 %	0 %	25 %	378715535
1007	NC_016905	TCAA	2	8	59883	59890	50 %	25 %	0 %	25 %	378715535
1008	NC_016905	TTC	2	6	59929	59934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715535
1009	NC_016905	CAT	2	6	60007	60012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715535
1010	NC_016905	AAT	2	6	60050	60055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715535
1011	NC_016905	CTT	3	9	60154	60162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715535
1012	NC_016905	TC	3	6	60181	60186	0 %	50 %	0 %	50 %	378715535
1013	NC_016905	AGTA	2	8	60212	60219	50 %	25 %	25 %	0 %	378715535
1014	NC_016905	CTT	2	6	60250	60255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715535
1015	NC_016905	CAG	2	6	60310	60315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715535
1016	NC_016905	T	6	6	60404	60409	0 %	100 %	0 %	0 %	378715535
1017	NC_016905	GCTT	2	8	60450	60457	0 %	50 %	25 %	25 %	378715535
1018	NC_016905	GAA	2	6	60520	60525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715535
1019	NC_016905	ATC	2	6	60641	60646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715535
1020	NC_016905	TCA	2	6	60687	60692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715535
1021	NC_016905	T	6	6	60763	60768	0 %	100 %	0 %	0 %	378715535
1022	NC_016905	TTC	2	6	60845	60850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715535
1023	NC_016905	CTT	2	6	60889	60894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715535
1024	NC_016905	CTT	2	6	60972	60977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715535
1025	NC_016905	CTT	2	6	60991	60996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715535
1026	NC_016905	AGT	2	6	61147	61152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715535
1027	NC_016905	TTTG	2	8	61224	61231	0 %	75 %	25 %	0 %	378715535
1028	NC_016905	TTC	2	6	61317	61322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715535
1029	NC_016905	ATA	2	6	61392	61397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715535
1030	NC_016905	T	6	6	61433	61438	0 %	100 %	0 %	0 %	378715535
1031	NC_016905	CAG	2	6	61534	61539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715535
1032	NC_016905	TG	3	6	61614	61619	0 %	50 %	50 %	0 %	378715535
1033	NC_016905	AGAACC	2	12	61656	61667	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378715535
1034	NC_016905	GTA	2	6	61685	61690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715535
1035	NC_016905	TA	3	6	61807	61812	50 %	50 %	0 %	0 %	378715535
1036	NC_016905	ATG	2	6	61857	61862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715535
1037	NC_016905	TCT	2	6	61866	61871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715535
1038	NC_016905	AGTT	2	8	61946	61953	25 %	50 %	25 %	0 %	378715535
1039	NC_016905	GAA	2	6	62021	62026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715535
1040	NC_016905	GTT	2	6	62164	62169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715535
1041	NC_016905	TTC	2	6	62210	62215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715535
1042	NC_016905	CCG	2	6	62286	62291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715535
1043	NC_016905	TCATC	2	10	62317	62326	20 %	40 %	0 %	40 %	378715535
1044	NC_016905	AAC	2	6	62358	62363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715535
1045	NC_016905	GAT	2	6	62401	62406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715535
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1047	NC_016905	TGT	2	6	62492	62497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715535
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1049	NC_016905	TC	3	6	62527	62532	0 %	50 %	0 %	50 %	378715536
1050	NC_016905	CAG	2	6	62544	62549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715536
1051	NC_016905	GAGTC	2	10	62554	62563	20 %	20 %	40 %	20 %	378715536
1052	NC_016905	TTGA	2	8	62666	62673	25 %	50 %	25 %	0 %	378715536
1053	NC_016905	GCTT	2	8	62723	62730	0 %	50 %	25 %	25 %	378715536
1054	NC_016905	TAT	2	6	62740	62745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378715536
1055	NC_016905	CTA	2	6	63231	63236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715537
1056	NC_016905	CTG	2	6	63371	63376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715537
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1058	NC_016905	T	7	7	63612	63618	0 %	100 %	0 %	0 %	378715538
1059	NC_016905	GCA	2	6	63710	63715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715538
1060	NC_016905	GTC	2	6	63779	63784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715538
1061	NC_016905	CAT	2	6	63834	63839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715538
1062	NC_016905	CAT	2	6	63855	63860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715538
1063	NC_016905	AATC	2	8	63911	63918	50 %	25 %	0 %	25 %	378715538
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1065	NC_016905	AGC	2	6	64042	64047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715538
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1067	NC_016905	TTTG	2	8	64121	64128	0 %	75 %	25 %	0 %	378715538
1068	NC_016905	CAG	2	6	64453	64458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715539
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1070	NC_016905	ATTA	2	8	64472	64479	50 %	50 %	0 %	0 %	378715539
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1072	NC_016905	GGT	2	6	64628	64633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715539
1073	NC_016905	T	6	6	64940	64945	0 %	100 %	0 %	0 %	378715539
1074	NC_016905	CTAT	2	8	65124	65131	25 %	50 %	0 %	25 %	378715539
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1080	NC_016905	CCAAG	2	10	65579	65588	40 %	0 %	20 %	40 %	378715540
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1082	NC_016905	GCA	3	9	65735	65743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715540
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1088	NC_016905	AAT	2	6	65857	65862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715540
1089	NC_016905	ATA	2	6	65887	65892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715540
1090	NC_016905	T	6	6	65959	65964	0 %	100 %	0 %	0 %	378715540
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1096	NC_016905	TGG	2	6	66124	66129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715540
1097	NC_016905	GTC	2	6	66135	66140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715540
1098	NC_016905	GAA	2	6	67576	67581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715541
1099	NC_016905	GGAA	2	8	67704	67711	50 %	0 %	50 %	0 %	378715541
1100	NC_016905	AGA	2	6	67744	67749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715541
1101	NC_016905	TGA	2	6	67759	67764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715541
1102	NC_016905	GAAA	2	8	67807	67814	75 %	0 %	25 %	0 %	378715541
1103	NC_016905	A	6	6	67819	67824	100 %	0 %	0 %	0 %	378715541
1104	NC_016905	CTT	2	6	67834	67839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715541
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1106	NC_016905	TCA	2	6	67868	67873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715541
1107	NC_016905	GAA	2	6	68058	68063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715541
1108	NC_016905	AAGG	2	8	68071	68078	50 %	0 %	50 %	0 %	378715541
1109	NC_016905	TCGT	2	8	68099	68106	0 %	50 %	25 %	25 %	378715541
1110	NC_016905	GTGAC	2	10	68249	68258	20 %	20 %	40 %	20 %	378715541
1111	NC_016905	GTG	2	6	68296	68301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715541
1112	NC_016905	TAA	2	6	68378	68383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715541
1113	NC_016905	GTT	2	6	68533	68538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715541
1114	NC_016905	CAAC	2	8	68587	68594	50 %	0 %	0 %	50 %	378715541
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1121	NC_016905	ATG	2	6	69195	69200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715542
1122	NC_016905	TGA	2	6	69245	69250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715542
1123	NC_016905	GCT	2	6	69279	69284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715542
1124	NC_016905	TCG	2	6	69317	69322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715542
1125	NC_016905	TG	3	6	69350	69355	0 %	50 %	50 %	0 %	378715542
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1255	NC_016905	T	6	6	79473	79478	0 %	100 %	0 %	0 %	378715554
1256	NC_016905	AAG	2	6	79515	79520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715554
1257	NC_016905	TAA	2	6	79648	79653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715554
1258	NC_016905	T	6	6	79691	79696	0 %	100 %	0 %	0 %	378715554
1259	NC_016905	GAT	2	6	79844	79849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715554
1260	NC_016905	GAA	2	6	79859	79864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715554
1261	NC_016905	T	6	6	79888	79893	0 %	100 %	0 %	0 %	378715554
1262	NC_016905	AGC	2	6	79990	79995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715554
1263	NC_016905	TCA	2	6	80014	80019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715554
1264	NC_016905	AGA	2	6	80128	80133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715555
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1266	NC_016905	TAGCGT	2	12	80211	80222	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378715555
1267	NC_016905	TAA	2	6	80284	80289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715555
1268	NC_016905	TTAA	2	8	80297	80304	50 %	50 %	0 %	0 %	378715555
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1271	NC_016905	ACC	2	6	80381	80386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715555
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