MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 88570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016863	CGG	2	6	210782	210787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987584
4002	NC_016863	TCTT	2	8	210820	210827	0 %	75 %	0 %	25 %	378987584
4003	NC_016863	AGC	2	6	210862	210867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987584
4004	NC_016863	TGC	2	6	210936	210941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987584
4005	NC_016863	CTT	2	6	211114	211119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987585
4006	NC_016863	GCC	2	6	211179	211184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987585
4007	NC_016863	GAT	2	6	211199	211204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987585
4008	NC_016863	CTTGC	2	10	211379	211388	0 %	40 %	20 %	40 %	378987585
4009	NC_016863	GGC	2	6	211554	211559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987586
4010	NC_016863	CAG	2	6	211599	211604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987586
4011	NC_016863	GTC	2	6	211629	211634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987586
4012	NC_016863	TTCA	2	8	211650	211657	25 %	50 %	0 %	25 %	378987586
4013	NC_016863	GGCAAT	2	12	211668	211679	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378987586
4014	NC_016863	TCA	2	6	211730	211735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987586
4015	NC_016863	GCT	2	6	211763	211768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987586
4016	NC_016863	TGAGC	2	10	211791	211800	20 %	20 %	40 %	20 %	378987586
4017	NC_016863	AAT	2	6	211821	211826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987586
4018	NC_016863	CGA	2	6	211835	211840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987586
4019	NC_016863	CCA	2	6	211865	211870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987586
4020	NC_016863	CGC	2	6	211967	211972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987586
4021	NC_016863	AG	3	6	212010	212015	50 %	0 %	50 %	0 %	378987586
4022	NC_016863	ACGT	2	8	212029	212036	25 %	25 %	25 %	25 %	378987586
4023	NC_016863	CAC	2	6	212202	212207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987586
4024	NC_016863	CGT	2	6	212249	212254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987586
4025	NC_016863	TGG	2	6	212267	212272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987586
4026	NC_016863	GAC	2	6	212306	212311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987586
4027	NC_016863	GCA	2	6	212324	212329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987586
4028	NC_016863	CAA	2	6	212354	212359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987586
4029	NC_016863	TTC	2	6	212495	212500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987587
4030	NC_016863	CTG	2	6	212537	212542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987587
4031	NC_016863	CGG	2	6	212545	212550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987587
4032	NC_016863	CCG	2	6	212604	212609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987587
4033	NC_016863	GCCGAT	2	12	212666	212677	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378987587
4034	NC_016863	GCAC	2	8	212725	212732	25 %	0 %	25 %	50 %	378987587
4035	NC_016863	CCAGCA	2	12	212734	212745	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378987587
4036	NC_016863	CAG	2	6	212783	212788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987587
4037	NC_016863	GCC	2	6	212825	212830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987587
4038	NC_016863	CCAG	2	8	212914	212921	25 %	0 %	25 %	50 %	378987587
4039	NC_016863	GCC	2	6	212924	212929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987587
4040	NC_016863	CGCA	2	8	212954	212961	25 %	0 %	25 %	50 %	378987587
4041	NC_016863	GC	3	6	213043	213048	0 %	0 %	50 %	50 %	378987587
4042	NC_016863	CG	3	6	213059	213064	0 %	0 %	50 %	50 %	378987587
4043	NC_016863	CAGG	2	8	213094	213101	25 %	0 %	50 %	25 %	378987587
4044	NC_016863	AG	3	6	213132	213137	50 %	0 %	50 %	0 %	378987587
4045	NC_016863	TCG	2	6	213165	213170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987587
4046	NC_016863	T	6	6	213221	213226	0 %	100 %	0 %	0 %	378987587
4047	NC_016863	CTTG	2	8	213229	213236	0 %	50 %	25 %	25 %	378987587
4048	NC_016863	GCA	2	6	213244	213249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987587
4049	NC_016863	TGG	3	9	213256	213264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987587
4050	NC_016863	GCA	2	6	213411	213416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987588
4051	NC_016863	AGATC	2	10	213460	213469	40 %	20 %	20 %	20 %	378987588
4052	NC_016863	CGGT	2	8	213540	213547	0 %	25 %	50 %	25 %	378987588
4053	NC_016863	TTC	2	6	213665	213670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987588
4054	NC_016863	GCG	3	9	213736	213744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987588
4055	NC_016863	GAA	2	6	213756	213761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987588
4056	NC_016863	CGA	2	6	213766	213771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987588
4057	NC_016863	GGC	2	6	213806	213811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987588
4058	NC_016863	CGCGG	2	10	213882	213891	0 %	0 %	60 %	40 %	378987589
4059	NC_016863	CG	3	6	213892	213897	0 %	0 %	50 %	50 %	378987589
4060	NC_016863	ACG	2	6	213913	213918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987589
4061	NC_016863	GCG	2	6	213919	213924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987589
4062	NC_016863	TCG	2	6	213935	213940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987589
4063	NC_016863	CGG	2	6	213970	213975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987589
4064	NC_016863	CAC	2	6	213998	214003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987589
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4067	NC_016863	CGCGG	2	10	214066	214075	0 %	0 %	60 %	40 %	378987589
4068	NC_016863	CAT	2	6	214212	214217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987589
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4070	NC_016863	T	6	6	214269	214274	0 %	100 %	0 %	0 %	378987589
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4108	NC_016863	GCCAG	2	10	216050	216059	20 %	0 %	40 %	40 %	378987590
4109	NC_016863	G	6	6	216175	216180	0 %	0 %	100 %	0 %	378987590
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4112	NC_016863	TGC	2	6	216323	216328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987590
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4117	NC_016863	CTC	2	6	216605	216610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987591
4118	NC_016863	GCGCG	2	10	216616	216625	0 %	0 %	60 %	40 %	378987591
4119	NC_016863	GGC	2	6	216647	216652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987591
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4244	NC_016863	TGG	4	12	222323	222334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987595
4245	NC_016863	GCG	2	6	222344	222349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987595
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4247	NC_016863	GGCGG	2	10	222367	222376	0 %	0 %	80 %	20 %	378987595
4248	NC_016863	GC	3	6	222412	222417	0 %	0 %	50 %	50 %	378987595
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4352	NC_016863	TGAT	2	8	227000	227007	25 %	50 %	25 %	0 %	378987598
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4354	NC_016863	CGT	2	6	227057	227062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987598
4355	NC_016863	TGGTC	2	10	227066	227075	0 %	40 %	40 %	20 %	378987598
4356	NC_016863	CGCT	2	8	227173	227180	0 %	25 %	25 %	50 %	378987598
4357	NC_016863	GCCA	2	8	227254	227261	25 %	0 %	25 %	50 %	378987598
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4359	NC_016863	G	6	6	227284	227289	0 %	0 %	100 %	0 %	378987598
4360	NC_016863	TGA	2	6	227300	227305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987598
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4362	NC_016863	CGG	2	6	227426	227431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987598
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4364	NC_016863	AAG	2	6	227459	227464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987598
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4484	NC_016863	ATG	2	6	233972	233977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987602
4485	NC_016863	TGC	2	6	234009	234014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987602
4486	NC_016863	GGC	2	6	234023	234028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987602
4487	NC_016863	GCC	2	6	234044	234049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987602
4488	NC_016863	TCG	2	6	234195	234200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987602
4489	NC_016863	T	6	6	234297	234302	0 %	100 %	0 %	0 %	378987602
4490	NC_016863	CCG	2	6	234323	234328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987602
4491	NC_016863	T	6	6	234381	234386	0 %	100 %	0 %	0 %	378987602
4492	NC_016863	CCGC	2	8	234388	234395	0 %	0 %	25 %	75 %	378987602
4493	NC_016863	GCA	2	6	234418	234423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987602
4494	NC_016863	CTA	2	6	234490	234495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987602
4495	NC_016863	GTG	2	6	234497	234502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987602
4496	NC_016863	CCAG	2	8	234536	234543	25 %	0 %	25 %	50 %	378987602
4497	NC_016863	GC	3	6	234648	234653	0 %	0 %	50 %	50 %	378987602
4498	NC_016863	ACA	2	6	234681	234686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987602
4499	NC_016863	GCCGC	2	10	234863	234872	0 %	0 %	40 %	60 %	378987603
4500	NC_016863	CGG	2	6	234886	234891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987603

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