MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 88570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_016863	CTC	2	6	77966	77971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987472
1503	NC_016863	GCC	2	6	78015	78020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987472
1504	NC_016863	TGA	2	6	78052	78057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987472
1505	NC_016863	CGG	2	6	78068	78073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987472
1506	NC_016863	CCT	2	6	78085	78090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987472
1507	NC_016863	ACC	2	6	78171	78176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987472
1508	NC_016863	TCGG	2	8	78186	78193	0 %	25 %	50 %	25 %	378987472
1509	NC_016863	CGCA	2	8	78213	78220	25 %	0 %	25 %	50 %	378987472
1510	NC_016863	CGA	2	6	78293	78298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987472
1511	NC_016863	CCG	2	6	78320	78325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987472
1512	NC_016863	GGCG	2	8	78563	78570	0 %	0 %	75 %	25 %	378987472
1513	NC_016863	GCG	2	6	78645	78650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987472
1514	NC_016863	GCGAA	2	10	78700	78709	40 %	0 %	40 %	20 %	378987472
1515	NC_016863	CGG	3	9	78743	78751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987472
1516	NC_016863	ACT	2	6	78784	78789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987472
1517	NC_016863	CGG	2	6	78974	78979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987472
1518	NC_016863	CGC	2	6	78985	78990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987472
1519	NC_016863	GC	5	10	78999	79008	0 %	0 %	50 %	50 %	378987472
1520	NC_016863	CG	3	6	79059	79064	0 %	0 %	50 %	50 %	378987472
1521	NC_016863	CTGAAG	2	12	79101	79112	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378987472
1522	NC_016863	TGG	2	6	79183	79188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987472
1523	NC_016863	CTT	2	6	79195	79200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987472
1524	NC_016863	CGG	2	6	79267	79272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987472
1525	NC_016863	TGC	2	6	79297	79302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987472
1526	NC_016863	TGA	2	6	79316	79321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987472
1527	NC_016863	GTGGAC	2	12	79332	79343	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378987472
1528	NC_016863	GGC	2	6	79374	79379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987472
1529	NC_016863	GGCG	2	8	79400	79407	0 %	0 %	75 %	25 %	378987472
1530	NC_016863	CAG	2	6	79479	79484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987472
1531	NC_016863	TGA	2	6	79522	79527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987472
1532	NC_016863	GCG	2	6	79584	79589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987472
1533	NC_016863	CGTAC	2	10	79590	79599	20 %	20 %	20 %	40 %	378987472
1534	NC_016863	GGC	2	6	79640	79645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987472
1535	NC_016863	GC	3	6	79644	79649	0 %	0 %	50 %	50 %	378987472
1536	NC_016863	TAC	2	6	79707	79712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987472
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1539	NC_016863	CCA	2	6	79858	79863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987472
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1541	NC_016863	GCT	2	6	79883	79888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987472
1542	NC_016863	TCCG	2	8	79890	79897	0 %	25 %	25 %	50 %	378987472
1543	NC_016863	GTG	2	6	79917	79922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987472
1544	NC_016863	CGC	2	6	79928	79933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987472
1545	NC_016863	GCT	2	6	79937	79942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987472
1546	NC_016863	CCAC	2	8	79966	79973	25 %	0 %	0 %	75 %	378987472
1547	NC_016863	GTC	2	6	80038	80043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987472
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1549	NC_016863	ACC	2	6	80094	80099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987472
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1551	NC_016863	CGC	2	6	80136	80141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987472
1552	NC_016863	GC	3	6	80143	80148	0 %	0 %	50 %	50 %	378987472
1553	NC_016863	CGG	2	6	80183	80188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987472
1554	NC_016863	ACG	2	6	80196	80201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987472
1555	NC_016863	TG	3	6	80551	80556	0 %	50 %	50 %	0 %	378987473
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1558	NC_016863	GAT	2	6	80729	80734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987473
1559	NC_016863	TGCCAG	2	12	80760	80771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378987473
1560	NC_016863	GAAA	2	8	80835	80842	75 %	0 %	25 %	0 %	378987473
1561	NC_016863	C	6	6	80880	80885	0 %	0 %	0 %	100 %	378987473
1562	NC_016863	GAT	2	6	80915	80920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987473
1563	NC_016863	CGTC	2	8	81045	81052	0 %	25 %	25 %	50 %	378987474
1564	NC_016863	CGGT	2	8	81067	81074	0 %	25 %	50 %	25 %	378987474
1565	NC_016863	TTC	2	6	81076	81081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987474
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1572	NC_016863	CGTCC	2	10	81336	81345	0 %	20 %	20 %	60 %	378987474
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1581	NC_016863	CG	3	6	81874	81879	0 %	0 %	50 %	50 %	378987475
1582	NC_016863	GTT	2	6	81927	81932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987475
1583	NC_016863	CG	3	6	81942	81947	0 %	0 %	50 %	50 %	378987475
1584	NC_016863	CTT	2	6	82005	82010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987475
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1588	NC_016863	CCG	2	6	82187	82192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987475
1589	NC_016863	GCC	2	6	82264	82269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987475
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1591	NC_016863	CGC	2	6	82347	82352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987475
1592	NC_016863	GGTC	2	8	82451	82458	0 %	25 %	50 %	25 %	378987475
1593	NC_016863	ACTC	2	8	82503	82510	25 %	25 %	0 %	50 %	378987475
1594	NC_016863	T	8	8	82576	82583	0 %	100 %	0 %	0 %	378987476
1595	NC_016863	ATT	2	6	82585	82590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987476
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1597	NC_016863	ACCA	2	8	82761	82768	50 %	0 %	0 %	50 %	378987476
1598	NC_016863	ATA	2	6	82801	82806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987476
1599	NC_016863	CCG	2	6	82837	82842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987476
1600	NC_016863	CGA	2	6	82868	82873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987476
1601	NC_016863	CATCCT	2	12	82886	82897	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378987476
1602	NC_016863	CGG	2	6	83030	83035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987476
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1604	NC_016863	AAT	2	6	83133	83138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987476
1605	NC_016863	CAG	2	6	83172	83177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987476
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1607	NC_016863	GCG	2	6	83275	83280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987476
1608	NC_016863	ATC	3	9	83302	83310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987476
1609	NC_016863	AGC	2	6	83383	83388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987476
1610	NC_016863	TGC	2	6	83396	83401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987476
1611	NC_016863	CGG	2	6	83402	83407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987476
1612	NC_016863	GCG	2	6	83422	83427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987476
1613	NC_016863	TCA	2	6	83476	83481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987476
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1621	NC_016863	CAG	2	6	83781	83786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987476
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1623	NC_016863	A	6	6	83957	83962	100 %	0 %	0 %	0 %	378987476
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1998	NC_016863	CGA	2	6	105316	105321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987497
1999	NC_016863	TTG	2	6	105328	105333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987497
2000	NC_016863	ATC	2	6	105349	105354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987497

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