MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 88570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_016863	TCAGG	2	10	740256	740265	20 %	20 %	40 %	20 %	378988070
14003	NC_016863	GACC	2	8	740277	740284	25 %	0 %	25 %	50 %	378988070
14004	NC_016863	CCA	2	6	740305	740310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378988070
14005	NC_016863	CGACG	2	10	740334	740343	20 %	0 %	40 %	40 %	378988070
14006	NC_016863	GGC	2	6	740344	740349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378988070
14007	NC_016863	T	6	6	740353	740358	0 %	100 %	0 %	0 %	378988070
14008	NC_016863	CGA	2	6	740377	740382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378988070
14009	NC_016863	CCG	2	6	740390	740395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378988070
14010	NC_016863	AGC	2	6	740399	740404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378988070
14011	NC_016863	TTC	2	6	740446	740451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378988070
14012	NC_016863	CCG	2	6	740568	740573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378988070
14013	NC_016863	AAT	2	6	740668	740673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378988070
14014	NC_016863	GGCGAA	2	12	740725	740736	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378988070
14015	NC_016863	CG	3	6	740842	740847	0 %	0 %	50 %	50 %	378988070
14016	NC_016863	CAA	2	6	740937	740942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378988070
14017	NC_016863	T	6	6	741040	741045	0 %	100 %	0 %	0 %	378988070
14018	NC_016863	CGC	2	6	741587	741592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378988071
14019	NC_016863	GAT	2	6	741596	741601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378988071
14020	NC_016863	CCGG	2	8	741635	741642	0 %	0 %	50 %	50 %	378988071
14021	NC_016863	T	6	6	741646	741651	0 %	100 %	0 %	0 %	378988071
14022	NC_016863	GC	3	6	741667	741672	0 %	0 %	50 %	50 %	378988071
14023	NC_016863	TGG	2	6	741712	741717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378988071
14024	NC_016863	GC	4	8	741725	741732	0 %	0 %	50 %	50 %	378988071
14025	NC_016863	CGA	2	6	741739	741744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378988071
14026	NC_016863	TGC	2	6	741749	741754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378988071
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14028	NC_016863	GC	3	6	741859	741864	0 %	0 %	50 %	50 %	378988071
14029	NC_016863	T	6	6	741884	741889	0 %	100 %	0 %	0 %	378988071
14030	NC_016863	CAG	2	6	742019	742024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378988071
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14032	NC_016863	GCA	2	6	742208	742213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378988072
14033	NC_016863	ACC	2	6	742288	742293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378988072
14034	NC_016863	T	6	6	742397	742402	0 %	100 %	0 %	0 %	378988072
14035	NC_016863	GCC	2	6	742498	742503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378988072
14036	NC_016863	GTC	2	6	742527	742532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378988072
14037	NC_016863	GTT	2	6	742580	742585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378988072
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14039	NC_016863	GGC	2	6	742599	742604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378988072
14040	NC_016863	AGT	2	6	742793	742798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378988072
14041	NC_016863	CGCCAG	2	12	742803	742814	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378988072
14042	NC_016863	CGC	2	6	742919	742924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378988072
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14045	NC_016863	GTG	2	6	743113	743118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378988072
14046	NC_016863	GCG	2	6	743184	743189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378988072
14047	NC_016863	CTG	2	6	743205	743210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378988072
14048	NC_016863	CTT	2	6	743216	743221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378988072
14049	NC_016863	GCA	2	6	743571	743576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378988073
14050	NC_016863	CA	4	8	743668	743675	50 %	0 %	0 %	50 %	378988073
14051	NC_016863	GTA	2	6	743686	743691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378988073
14052	NC_016863	CGGTG	2	10	743737	743746	0 %	20 %	60 %	20 %	378988073
14053	NC_016863	CGC	2	6	743835	743840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378988073
14054	NC_016863	AATA	2	8	743841	743848	75 %	25 %	0 %	0 %	378988073
14055	NC_016863	CAG	2	6	744033	744038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378988073
14056	NC_016863	TGA	2	6	744069	744074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378988073
14057	NC_016863	CAGCG	2	10	744103	744112	20 %	0 %	40 %	40 %	378988073
14058	NC_016863	T	7	7	744148	744154	0 %	100 %	0 %	0 %	378988073
14059	NC_016863	TCA	2	6	744246	744251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378988073
14060	NC_016863	TCG	2	6	744254	744259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378988073
14061	NC_016863	CGC	3	9	744372	744380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378988073
14062	NC_016863	GA	3	6	744413	744418	50 %	0 %	50 %	0 %	378988073
14063	NC_016863	GTT	2	6	744438	744443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378988073
14064	NC_016863	CGG	2	6	744451	744456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378988073
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14092	NC_016863	GC	3	6	746262	746267	0 %	0 %	50 %	50 %	378988075
14093	NC_016863	TCA	2	6	746289	746294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378988075
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14103	NC_016863	GCT	2	6	746620	746625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378988075
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14480	NC_016863	ATC	2	6	767222	767227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378988092
14481	NC_016863	TTC	2	6	767261	767266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378988092
14482	NC_016863	GCGG	2	8	767270	767277	0 %	0 %	75 %	25 %	378988092
14483	NC_016863	AAT	2	6	767363	767368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378988092
14484	NC_016863	GGC	2	6	767387	767392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378988092
14485	NC_016863	GCGCG	2	10	767452	767461	0 %	0 %	60 %	40 %	378988092
14486	NC_016863	GCG	2	6	767468	767473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378988092
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14491	NC_016863	CCAGCC	2	12	767646	767657	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	378988093
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