MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 88570

< Previous12...166167168169170171172173174175176177178Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
88501	NC_016863	TTA	2	6	4812275	4812280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991852
88502	NC_016863	CTGC	2	8	4812309	4812316	0 %	25 %	25 %	50 %	378991852
88503	NC_016863	C	7	7	4812316	4812322	0 %	0 %	0 %	100 %	378991852
88504	NC_016863	TCA	2	6	4812362	4812367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991852
88505	NC_016863	GGC	2	6	4812604	4812609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991853
88506	NC_016863	TGA	2	6	4812634	4812639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991853
88507	NC_016863	ATA	2	6	4812706	4812711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991853
88508	NC_016863	TAA	2	6	4812732	4812737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991853
88509	NC_016863	TTG	2	6	4812763	4812768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378991853
88510	NC_016863	AT	3	6	4812811	4812816	50 %	50 %	0 %	0 %	378991853
88511	NC_016863	ATC	2	6	4812868	4812873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991853
88512	NC_016863	G	6	6	4812930	4812935	0 %	0 %	100 %	0 %	378991853
88513	NC_016863	ATA	2	6	4813001	4813006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991853
88514	NC_016863	ATTG	2	8	4813090	4813097	25 %	50 %	25 %	0 %	378991853
88515	NC_016863	TCA	2	6	4813103	4813108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991853
88516	NC_016863	CAA	3	9	4813140	4813148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378991853
88517	NC_016863	T	6	6	4813212	4813217	0 %	100 %	0 %	0 %	378991853
88518	NC_016863	GGC	2	6	4813361	4813366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991854
88519	NC_016863	CTG	2	6	4813381	4813386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991854
88520	NC_016863	CAT	2	6	4813417	4813422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991854
88521	NC_016863	ATC	2	6	4813532	4813537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991854
88522	NC_016863	TGG	2	6	4813684	4813689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991854
88523	NC_016863	GAT	2	6	4813805	4813810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991854
88524	NC_016863	TTA	2	6	4813818	4813823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991854
88525	NC_016863	TA	3	6	4814221	4814226	50 %	50 %	0 %	0 %	378991855
88526	NC_016863	CTG	2	6	4814287	4814292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991855
88527	NC_016863	TCA	2	6	4814468	4814473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991855
88528	NC_016863	ATA	2	6	4814506	4814511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991855
88529	NC_016863	GGT	2	6	4814518	4814523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991855
88530	NC_016863	A	6	6	4814533	4814538	100 %	0 %	0 %	0 %	378991855
88531	NC_016863	TCT	2	6	4814552	4814557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378991855
88532	NC_016863	GATT	2	8	4814684	4814691	25 %	50 %	25 %	0 %	378991855
88533	NC_016863	T	7	7	4814786	4814792	0 %	100 %	0 %	0 %	378991855
88534	NC_016863	CCG	2	6	4814819	4814824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991855
88535	NC_016863	GAT	2	6	4815258	4815263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991856
88536	NC_016863	TCA	2	6	4815300	4815305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991856
88537	NC_016863	ATT	2	6	4815355	4815360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991856
88538	NC_016863	AGC	2	6	4815466	4815471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991856
88539	NC_016863	TGA	2	6	4815481	4815486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991856
88540	NC_016863	AGC	2	6	4815513	4815518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991856
88541	NC_016863	T	6	6	4815529	4815534	0 %	100 %	0 %	0 %	378991856
88542	NC_016863	CGC	2	6	4815818	4815823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991857
88543	NC_016863	TGG	2	6	4815848	4815853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991857
88544	NC_016863	GAT	2	6	4815855	4815860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991857
88545	NC_016863	ACG	2	6	4815900	4815905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991857
88546	NC_016863	TTC	2	6	4815958	4815963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378991857
88547	NC_016863	GC	3	6	4815973	4815978	0 %	0 %	50 %	50 %	378991857
88548	NC_016863	GCA	2	6	4816010	4816015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991857
88549	NC_016863	CG	3	6	4816017	4816022	0 %	0 %	50 %	50 %	378991857
88550	NC_016863	ACG	2	6	4816125	4816130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991857
88551	NC_016863	CAG	2	6	4816167	4816172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991857
88552	NC_016863	ATC	2	6	4816224	4816229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991857
88553	NC_016863	AG	3	6	4816389	4816394	50 %	0 %	50 %	0 %	378991857
88554	NC_016863	CAT	2	6	4816433	4816438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991857
88555	NC_016863	CAA	2	6	4816663	4816668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378991858
88556	NC_016863	CAT	2	6	4816669	4816674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991858
88557	NC_016863	GCC	2	6	4817210	4817215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991859
88558	NC_016863	ATT	2	6	4817315	4817320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991859
88559	NC_016863	ATA	2	6	4817322	4817327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991859
88560	NC_016863	CGA	2	6	4817382	4817387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991859
88561	NC_016863	TAC	2	6	4817414	4817419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991859
88562	NC_016863	TTA	2	6	4817444	4817449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991859
88563	NC_016863	GCTGGC	2	12	4817524	4817535	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378991859
88564	NC_016863	GGC	2	6	4817560	4817565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991859
88565	NC_016863	TGA	2	6	4817662	4817667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991859
88566	NC_016863	CG	4	8	4817687	4817694	0 %	0 %	50 %	50 %	378991859
88567	NC_016863	GGC	2	6	4817722	4817727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991859
88568	NC_016863	ACA	2	6	4817755	4817760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378991859
88569	NC_016863	CTG	2	6	4817771	4817776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991859
88570	NC_016863	A	8	8	4817823	4817830	100 %	0 %	0 %	0 %	378991859

< Previous12...166167168169170171172173174175176177178Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.