MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 88570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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65002	NC_016863	GAT	2	6	3549636	3549641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378990728
65003	NC_016863	GCTG	2	8	3549658	3549665	0 %	25 %	50 %	25 %	378990728
65004	NC_016863	TGC	2	6	3549706	3549711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990728
65005	NC_016863	GTT	2	6	3549720	3549725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378990728
65006	NC_016863	GCT	2	6	3549778	3549783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990728
65007	NC_016863	CTA	2	6	3549836	3549841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378990728
65008	NC_016863	ACC	2	6	3549870	3549875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378990728
65009	NC_016863	GCA	2	6	3549993	3549998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990729
65010	NC_016863	GTT	2	6	3550138	3550143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378990729
65011	NC_016863	AGC	2	6	3550169	3550174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990729
65012	NC_016863	ACC	2	6	3550239	3550244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378990729
65013	NC_016863	GCG	2	6	3550274	3550279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378990729
65014	NC_016863	ACG	2	6	3550292	3550297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990729
65015	NC_016863	CTT	3	9	3550334	3550342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378990730
65016	NC_016863	TCG	2	6	3550365	3550370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990730
65017	NC_016863	GAC	2	6	3550405	3550410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990730
65018	NC_016863	GC	3	6	3550416	3550421	0 %	0 %	50 %	50 %	378990730
65019	NC_016863	CTG	2	6	3550426	3550431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990730
65020	NC_016863	CAG	2	6	3550495	3550500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990730
65021	NC_016863	GA	3	6	3550534	3550539	50 %	0 %	50 %	0 %	378990730
65022	NC_016863	TAC	2	6	3550556	3550561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378990730
65023	NC_016863	ACCA	2	8	3550592	3550599	50 %	0 %	0 %	50 %	378990730
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65026	NC_016863	CG	3	6	3550659	3550664	0 %	0 %	50 %	50 %	378990730
65027	NC_016863	TAA	2	6	3550792	3550797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378990730
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65031	NC_016863	GC	3	6	3550919	3550924	0 %	0 %	50 %	50 %	378990731
65032	NC_016863	AAC	2	6	3550958	3550963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378990731
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65035	NC_016863	CAGTTC	2	12	3551087	3551098	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378990731
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65037	NC_016863	GGA	2	6	3551180	3551185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378990731
65038	NC_016863	GAC	2	6	3551401	3551406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990732
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65041	NC_016863	GAT	2	6	3551516	3551521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378990732
65042	NC_016863	TTCAG	2	10	3551526	3551535	20 %	40 %	20 %	20 %	378990732
65043	NC_016863	ATTG	2	8	3551592	3551599	25 %	50 %	25 %	0 %	378990732
65044	NC_016863	CAGC	2	8	3551649	3551656	25 %	0 %	25 %	50 %	378990733
65045	NC_016863	CTT	2	6	3551667	3551672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378990733
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65048	NC_016863	GAT	2	6	3551752	3551757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378990733
65049	NC_016863	CTG	3	9	3551997	3552005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990733
65050	NC_016863	CAG	2	6	3552013	3552018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990733
65051	NC_016863	TCT	2	6	3552063	3552068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378990733
65052	NC_016863	ACT	2	6	3552125	3552130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378990733
65053	NC_016863	GTA	2	6	3552139	3552144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378990733
65054	NC_016863	GAA	2	6	3552204	3552209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378990734
65055	NC_016863	T	6	6	3552216	3552221	0 %	100 %	0 %	0 %	378990734
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65058	NC_016863	GGTT	2	8	3552328	3552335	0 %	50 %	50 %	0 %	378990734
65059	NC_016863	CAA	2	6	3552383	3552388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378990734
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65061	NC_016863	AG	3	6	3552521	3552526	50 %	0 %	50 %	0 %	378990735
65062	NC_016863	GCT	2	6	3552594	3552599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990735
65063	NC_016863	GCAT	2	8	3552622	3552629	25 %	25 %	25 %	25 %	378990735
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65100	NC_016863	ACG	2	6	3555139	3555144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990741
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65103	NC_016863	GA	3	6	3555235	3555240	50 %	0 %	50 %	0 %	378990741
65104	NC_016863	ATT	2	6	3555265	3555270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378990742
65105	NC_016863	TTG	2	6	3555306	3555311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378990742
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65107	NC_016863	CAC	3	9	3555382	3555390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378990742
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65109	NC_016863	ACGCC	2	10	3555441	3555450	20 %	0 %	20 %	60 %	378990742
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65113	NC_016863	AACC	2	8	3555673	3555680	50 %	0 %	0 %	50 %	378990742
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65115	NC_016863	CAA	2	6	3555853	3555858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378990742
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