MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 88570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59001	NC_016863	TCA	2	6	3221136	3221141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378990411
59002	NC_016863	TCG	2	6	3221262	3221267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990411
59003	NC_016863	CTG	2	6	3221351	3221356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990411
59004	NC_016863	TGA	2	6	3221415	3221420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378990411
59005	NC_016863	CAG	2	6	3221567	3221572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990412
59006	NC_016863	CGT	2	6	3221582	3221587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990412
59007	NC_016863	CGG	2	6	3221673	3221678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378990412
59008	NC_016863	CTGG	2	8	3221686	3221693	0 %	25 %	50 %	25 %	378990412
59009	NC_016863	CTG	2	6	3221726	3221731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990412
59010	NC_016863	GAT	2	6	3221839	3221844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378990412
59011	NC_016863	TCA	2	6	3221878	3221883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378990412
59012	NC_016863	CCG	2	6	3221956	3221961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378990412
59013	NC_016863	GTA	2	6	3221972	3221977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378990412
59014	NC_016863	CAGGC	2	10	3222178	3222187	20 %	0 %	40 %	40 %	378990413
59015	NC_016863	GCG	2	6	3222225	3222230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378990413
59016	NC_016863	A	6	6	3222297	3222302	100 %	0 %	0 %	0 %	378990413
59017	NC_016863	CGT	2	6	3222305	3222310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990413
59018	NC_016863	TCA	2	6	3222404	3222409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378990413
59019	NC_016863	CGG	2	6	3222428	3222433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378990413
59020	NC_016863	A	6	6	3222437	3222442	100 %	0 %	0 %	0 %	378990413
59021	NC_016863	CGG	2	6	3222554	3222559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378990413
59022	NC_016863	GCC	2	6	3222617	3222622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378990413
59023	NC_016863	CGCCCG	2	12	3222623	3222634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378990413
59024	NC_016863	ATTT	2	8	3222651	3222658	25 %	75 %	0 %	0 %	378990413
59025	NC_016863	CAA	2	6	3222696	3222701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378990413
59026	NC_016863	T	7	7	3222903	3222909	0 %	100 %	0 %	0 %	378990414
59027	NC_016863	TTG	2	6	3222943	3222948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378990414
59028	NC_016863	GCA	2	6	3223046	3223051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990414
59029	NC_016863	TGA	2	6	3223109	3223114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378990414
59030	NC_016863	CGA	2	6	3223125	3223130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990414
59031	NC_016863	CGC	2	6	3223139	3223144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378990414
59032	NC_016863	CG	3	6	3223172	3223177	0 %	0 %	50 %	50 %	378990414
59033	NC_016863	A	6	6	3223181	3223186	100 %	0 %	0 %	0 %	378990414
59034	NC_016863	ATCG	2	8	3223206	3223213	25 %	25 %	25 %	25 %	378990414
59035	NC_016863	GCG	2	6	3223256	3223261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378990414
59036	NC_016863	CAG	2	6	3223297	3223302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990414
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59040	NC_016863	CG	3	6	3223430	3223435	0 %	0 %	50 %	50 %	378990414
59041	NC_016863	CTGCCG	2	12	3223456	3223467	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378990414
59042	NC_016863	CTG	2	6	3223483	3223488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990414
59043	NC_016863	CGG	2	6	3223511	3223516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378990414
59044	NC_016863	CG	3	6	3223533	3223538	0 %	0 %	50 %	50 %	378990414
59045	NC_016863	CA	3	6	3223698	3223703	50 %	0 %	0 %	50 %	378990415
59046	NC_016863	AAGA	2	8	3223712	3223719	75 %	0 %	25 %	0 %	378990415
59047	NC_016863	TGC	2	6	3223734	3223739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990415
59048	NC_016863	CGT	2	6	3223751	3223756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990415
59049	NC_016863	GCCCGC	2	12	3223811	3223822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378990415
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59051	NC_016863	TTTA	2	8	3223946	3223953	25 %	75 %	0 %	0 %	378990415
59052	NC_016863	GAA	3	9	3223979	3223987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378990415
59053	NC_016863	CAA	2	6	3224002	3224007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378990415
59054	NC_016863	GCG	2	6	3224160	3224165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378990415
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59056	NC_016863	GTC	2	6	3224300	3224305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990415
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59058	NC_016863	GGC	2	6	3224371	3224376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378990415
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59061	NC_016863	CGCC	2	8	3224425	3224432	0 %	0 %	25 %	75 %	378990415
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59346	NC_016863	GCAA	2	8	3240405	3240412	50 %	0 %	25 %	25 %	378990433
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59469	NC_016863	AGC	2	6	3247291	3247296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990440
59470	NC_016863	CTG	2	6	3247327	3247332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990440
59471	NC_016863	TCA	2	6	3247388	3247393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378990440
59472	NC_016863	TTC	2	6	3247409	3247414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378990440
59473	NC_016863	GTT	2	6	3247545	3247550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378990440
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59480	NC_016863	CCTT	2	8	3247871	3247878	0 %	50 %	0 %	50 %	378990440
59481	NC_016863	ACC	2	6	3247896	3247901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378990440
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59483	NC_016863	ATC	2	6	3248077	3248082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378990440
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59491	NC_016863	GCGG	2	8	3248610	3248617	0 %	0 %	75 %	25 %	378990441
59492	NC_016863	CGC	2	6	3248699	3248704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378990441
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59497	NC_016863	TCA	2	6	3248875	3248880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378990441
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59500	NC_016863	GAT	3	9	3248981	3248989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378990441

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