MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 88570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_016863	TCTGGA	2	12	2795881	2795892	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378990034
51502	NC_016863	CA	3	6	2795969	2795974	50 %	0 %	0 %	50 %	378990034
51503	NC_016863	ATTA	2	8	2796073	2796080	50 %	50 %	0 %	0 %	378990034
51504	NC_016863	GTT	2	6	2796165	2796170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378990035
51505	NC_016863	TC	3	6	2796171	2796176	0 %	50 %	0 %	50 %	378990035
51506	NC_016863	CGCAG	2	10	2796301	2796310	20 %	0 %	40 %	40 %	378990035
51507	NC_016863	GCC	2	6	2796365	2796370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378990035
51508	NC_016863	GCTGGA	2	12	2796383	2796394	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378990035
51509	NC_016863	CCTTT	2	10	2796473	2796482	0 %	60 %	0 %	40 %	378990036
51510	NC_016863	AGA	2	6	2796539	2796544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378990036
51511	NC_016863	GCC	2	6	2796597	2796602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378990036
51512	NC_016863	CAAT	2	8	2796710	2796717	50 %	25 %	0 %	25 %	378990036
51513	NC_016863	GC	3	6	2796719	2796724	0 %	0 %	50 %	50 %	378990036
51514	NC_016863	GA	3	6	2796775	2796780	50 %	0 %	50 %	0 %	378990036
51515	NC_016863	CATAG	2	10	2796817	2796826	40 %	20 %	20 %	20 %	378990036
51516	NC_016863	AC	3	6	2796886	2796891	50 %	0 %	0 %	50 %	378990036
51517	NC_016863	GCAT	2	8	2796925	2796932	25 %	25 %	25 %	25 %	378990036
51518	NC_016863	CTG	2	6	2796935	2796940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990036
51519	NC_016863	GGT	2	6	2796966	2796971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378990036
51520	NC_016863	CTT	2	6	2797064	2797069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378990036
51521	NC_016863	CTG	2	6	2797203	2797208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990036
51522	NC_016863	AGT	2	6	2797234	2797239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378990036
51523	NC_016863	ACG	2	6	2797268	2797273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990036
51524	NC_016863	AT	3	6	2797312	2797317	50 %	50 %	0 %	0 %	378990036
51525	NC_016863	AGC	2	6	2797378	2797383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990036
51526	NC_016863	CAT	2	6	2797449	2797454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378990036
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51528	NC_016863	A	6	6	2797537	2797542	100 %	0 %	0 %	0 %	378990036
51529	NC_016863	CGG	2	6	2797544	2797549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378990036
51530	NC_016863	AGT	2	6	2797578	2797583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378990036
51531	NC_016863	AGA	2	6	2797601	2797606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378990036
51532	NC_016863	CGC	2	6	2797702	2797707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378990036
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51535	NC_016863	CGTTTC	2	12	2797889	2797900	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378990037
51536	NC_016863	CCA	2	6	2797930	2797935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378990037
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51538	NC_016863	TCT	2	6	2798000	2798005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378990037
51539	NC_016863	ATC	2	6	2798098	2798103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378990037
51540	NC_016863	CTG	2	6	2798104	2798109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990037
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51542	NC_016863	GAA	2	6	2798187	2798192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378990037
51543	NC_016863	GCT	2	6	2798259	2798264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990037
51544	NC_016863	CTG	2	6	2798290	2798295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990037
51545	NC_016863	ACTGC	2	10	2804286	2804295	20 %	20 %	20 %	40 %	378990038
51546	NC_016863	ATC	2	6	2804305	2804310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378990038
51547	NC_016863	TGC	2	6	2804363	2804368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990038
51548	NC_016863	CTG	2	6	2804386	2804391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990038
51549	NC_016863	TCG	2	6	2804465	2804470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990038
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51551	NC_016863	TGT	2	6	2804549	2804554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378990038
51552	NC_016863	TCA	2	6	2804582	2804587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378990038
51553	NC_016863	CGGA	2	8	2804605	2804612	25 %	0 %	50 %	25 %	378990038
51554	NC_016863	ACC	2	6	2804717	2804722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378990038
51555	NC_016863	GTCA	2	8	2804755	2804762	25 %	25 %	25 %	25 %	378990038
51556	NC_016863	CGT	2	6	2804769	2804774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990038
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51559	NC_016863	CGT	2	6	2804976	2804981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990038
51560	NC_016863	CAGGAA	2	12	2805046	2805057	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378990038
51561	NC_016863	TCGGA	2	10	2805075	2805084	20 %	20 %	40 %	20 %	378990038
51562	NC_016863	ACG	2	6	2805100	2805105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990038
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51564	NC_016863	ACGCG	2	10	2805383	2805392	20 %	0 %	40 %	40 %	378990038
51565	NC_016863	AG	3	6	2805448	2805453	50 %	0 %	50 %	0 %	378990038
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51570	NC_016863	TCA	2	6	2805567	2805572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378990038
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51583	NC_016863	GC	3	6	2806125	2806130	0 %	0 %	50 %	50 %	378990038
51584	NC_016863	TAA	2	6	2806185	2806190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378990038
51585	NC_016863	TGCGC	2	10	2806191	2806200	0 %	20 %	40 %	40 %	378990038
51586	NC_016863	CAA	2	6	2806209	2806214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378990038
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51588	NC_016863	ACG	2	6	2806267	2806272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990038
51589	NC_016863	TCA	2	6	2806304	2806309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378990038
51590	NC_016863	T	6	6	2806369	2806374	0 %	100 %	0 %	0 %	378990038
51591	NC_016863	CAG	2	6	2806480	2806485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990038
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51599	NC_016863	GTC	2	6	2807021	2807026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990039
51600	NC_016863	CGA	2	6	2807033	2807038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990039
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51604	NC_016863	GCC	3	9	2807351	2807359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378990039
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51609	NC_016863	CAT	2	6	2807729	2807734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378990040
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51612	NC_016863	GCA	2	6	2807843	2807848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990040
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51616	NC_016863	GAC	2	6	2808122	2808127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378990040
51617	NC_016863	TTCA	2	8	2808135	2808142	25 %	50 %	0 %	25 %	378990040
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51653	NC_016863	CG	3	6	2810509	2810514	0 %	0 %	50 %	50 %	378990044
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51656	NC_016863	CG	3	6	2810581	2810586	0 %	0 %	50 %	50 %	378990044
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51709	NC_016863	CTG	2	6	2813241	2813246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990046
51710	NC_016863	T	6	6	2813285	2813290	0 %	100 %	0 %	0 %	378990046
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51732	NC_016863	TAT	2	6	2815190	2815195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378990048
51733	NC_016863	GAA	2	6	2815231	2815236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378990048
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51755	NC_016863	AT	3	6	2816530	2816535	50 %	50 %	0 %	0 %	378990049
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51844	NC_016863	AT	3	6	2821235	2821240	50 %	50 %	0 %	0 %	378990055
51845	NC_016863	ATG	2	6	2821266	2821271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378990055
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