MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240 plasmid pSTMDT12_L

Total Repeats: 1876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016861	TGA	2	6	61923	61928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987349
1002	NC_016861	GC	3	6	62155	62160	0 %	0 %	50 %	50 %	378987350
1003	NC_016861	GACC	2	8	62176	62183	25 %	0 %	25 %	50 %	378987350
1004	NC_016861	CGA	2	6	62242	62247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987350
1005	NC_016861	A	6	6	62288	62293	100 %	0 %	0 %	0 %	378987350
1006	NC_016861	GCT	2	6	62299	62304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987350
1007	NC_016861	GGC	2	6	62344	62349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987350
1008	NC_016861	ACT	2	6	62400	62405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987350
1009	NC_016861	CCA	2	6	62527	62532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987350
1010	NC_016861	CA	4	8	62581	62588	50 %	0 %	0 %	50 %	378987350
1011	NC_016861	AT	3	6	62662	62667	50 %	50 %	0 %	0 %	378987350
1012	NC_016861	GC	3	6	62728	62733	0 %	0 %	50 %	50 %	378987350
1013	NC_016861	GCC	2	6	62747	62752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987350
1014	NC_016861	ACG	2	6	62754	62759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987350
1015	NC_016861	GGC	2	6	62820	62825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987351
1016	NC_016861	GC	3	6	62850	62855	0 %	0 %	50 %	50 %	378987351
1017	NC_016861	GCG	2	6	62931	62936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987351
1018	NC_016861	CTG	2	6	62947	62952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987351
1019	NC_016861	ATG	2	6	63059	63064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987352
1020	NC_016861	GAACT	2	10	63080	63089	40 %	20 %	20 %	20 %	378987352
1021	NC_016861	ACG	2	6	63114	63119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987352
1022	NC_016861	CTG	2	6	63131	63136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987352
1023	NC_016861	CTG	2	6	63326	63331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987352
1024	NC_016861	CGGG	2	8	63352	63359	0 %	0 %	75 %	25 %	378987352
1025	NC_016861	GGA	2	6	63370	63375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987352
1026	NC_016861	GGCCT	2	10	63382	63391	0 %	20 %	40 %	40 %	378987352
1027	NC_016861	CTGGCG	2	12	63455	63466	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378987352
1028	NC_016861	GTG	2	6	63646	63651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987353
1029	NC_016861	GGCT	2	8	63655	63662	0 %	25 %	50 %	25 %	378987353
1030	NC_016861	TGC	2	6	63684	63689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987353
1031	NC_016861	GAC	2	6	63705	63710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987353
1032	NC_016861	CTG	2	6	63748	63753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987353
1033	NC_016861	CTG	2	6	63904	63909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987353
1034	NC_016861	CGG	2	6	63974	63979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987353
1035	NC_016861	AGGACG	2	12	64079	64090	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378987353
1036	NC_016861	TGC	2	6	64145	64150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987353
1037	NC_016861	GGA	2	6	64170	64175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987353
1038	NC_016861	GCC	2	6	64186	64191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987353
1039	NC_016861	GAACC	2	10	64225	64234	40 %	0 %	20 %	40 %	378987353
1040	NC_016861	CCG	2	6	64248	64253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987353
1041	NC_016861	TTA	2	6	64835	64840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987354
1042	NC_016861	GAA	2	6	64846	64851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987354
1043	NC_016861	GCTG	2	8	64899	64906	0 %	25 %	50 %	25 %	378987354
1044	NC_016861	A	6	6	64930	64935	100 %	0 %	0 %	0 %	378987354
1045	NC_016861	GGT	2	6	64954	64959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987354
1046	NC_016861	GGC	2	6	64987	64992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987354
1047	NC_016861	ATG	2	6	64999	65004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987354
1048	NC_016861	ATT	2	6	65080	65085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987354
1049	NC_016861	TCGC	2	8	65092	65099	0 %	25 %	25 %	50 %	378987354
1050	NC_016861	CCG	2	6	65106	65111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987354
1051	NC_016861	TGC	2	6	65162	65167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987354
1052	NC_016861	CGC	2	6	65223	65228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987354
1053	NC_016861	CTG	2	6	65328	65333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987355
1054	NC_016861	A	6	6	65363	65368	100 %	0 %	0 %	0 %	378987355
1055	NC_016861	TCA	2	6	65375	65380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987355
1056	NC_016861	TGA	2	6	65433	65438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987355
1057	NC_016861	GC	3	6	65454	65459	0 %	0 %	50 %	50 %	378987355
1058	NC_016861	TTG	2	6	65513	65518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987355
1059	NC_016861	TGC	2	6	65582	65587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987355
1060	NC_016861	GCT	2	6	65650	65655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987355
1061	NC_016861	GAA	3	9	65656	65664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987355
1062	NC_016861	ACT	2	6	65732	65737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987355
1063	NC_016861	GGC	2	6	65992	65997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987356
1064	NC_016861	AAC	2	6	65998	66003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987356
1065	NC_016861	AGA	2	6	66007	66012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987356
1066	NC_016861	AAAG	2	8	66059	66066	75 %	0 %	25 %	0 %	378987356
1067	NC_016861	GGT	2	6	66079	66084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987356
1068	NC_016861	GTC	2	6	66095	66100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987356
1069	NC_016861	GA	3	6	66121	66126	50 %	0 %	50 %	0 %	378987356
1070	NC_016861	A	6	6	66208	66213	100 %	0 %	0 %	0 %	378987356
1071	NC_016861	T	7	7	66275	66281	0 %	100 %	0 %	0 %	378987356
1072	NC_016861	GT	3	6	66291	66296	0 %	50 %	50 %	0 %	378987356
1073	NC_016861	GCA	2	6	66984	66989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987357
1074	NC_016861	GGTC	2	8	67013	67020	0 %	25 %	50 %	25 %	378987357
1075	NC_016861	CAGG	2	8	67109	67116	25 %	0 %	50 %	25 %	378987357
1076	NC_016861	AC	3	6	67133	67138	50 %	0 %	0 %	50 %	378987357
1077	NC_016861	ACC	2	6	67275	67280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987357
1078	NC_016861	GGC	2	6	67299	67304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987357
1079	NC_016861	CAGC	2	8	67331	67338	25 %	0 %	25 %	50 %	378987357
1080	NC_016861	CAG	2	6	67341	67346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987357
1081	NC_016861	CGG	2	6	67366	67371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987357
1082	NC_016861	GCA	2	6	67410	67415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987357
1083	NC_016861	GCA	3	9	67428	67436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987357
1084	NC_016861	GCA	2	6	67439	67444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987357
1085	NC_016861	GCC	2	6	67445	67450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987357
1086	NC_016861	CGA	2	6	67478	67483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987357
1087	NC_016861	GACA	2	8	67556	67563	50 %	0 %	25 %	25 %	378987358
1088	NC_016861	CAT	2	6	67565	67570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987358
1089	NC_016861	CCTG	2	8	67586	67593	0 %	25 %	25 %	50 %	378987358
1090	NC_016861	GCA	2	6	67629	67634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987358
1091	NC_016861	GCG	2	6	67738	67743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987358
1092	NC_016861	AAT	2	6	67861	67866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987359
1093	NC_016861	CGC	2	6	67924	67929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987359
1094	NC_016861	CGG	2	6	67953	67958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987359
1095	NC_016861	GAA	2	6	67973	67978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987359
1096	NC_016861	AG	3	6	68044	68049	50 %	0 %	50 %	0 %	378987359
1097	NC_016861	GTT	2	6	68102	68107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987359
1098	NC_016861	CCCT	2	8	68112	68119	0 %	25 %	0 %	75 %	378987359
1099	NC_016861	GGC	2	6	68158	68163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987359
1100	NC_016861	CCG	2	6	68244	68249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987359
1101	NC_016861	GCA	2	6	68269	68274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987359
1102	NC_016861	CG	3	6	68312	68317	0 %	0 %	50 %	50 %	378987359
1103	NC_016861	CTG	2	6	68357	68362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987359
1104	NC_016861	GGCT	2	8	68406	68413	0 %	25 %	50 %	25 %	378987359
1105	NC_016861	GCTG	2	8	68431	68438	0 %	25 %	50 %	25 %	378987359
1106	NC_016861	CAC	2	6	68449	68454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987359
1107	NC_016861	GGCGCT	2	12	68467	68478	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378987359
1108	NC_016861	GGA	2	6	68479	68484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987359
1109	NC_016861	CAGGTG	2	12	68498	68509	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378987359
1110	NC_016861	GGC	2	6	68515	68520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987359
1111	NC_016861	CAA	2	6	68599	68604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987359
1112	NC_016861	CGA	2	6	68671	68676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987359
1113	NC_016861	CTG	2	6	68717	68722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987359
1114	NC_016861	GTGG	2	8	68734	68741	0 %	25 %	75 %	0 %	378987359
1115	NC_016861	CAG	2	6	68873	68878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987359
1116	NC_016861	ACG	2	6	68904	68909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987359
1117	NC_016861	GC	3	6	69004	69009	0 %	0 %	50 %	50 %	378987359
1118	NC_016861	GTG	3	9	69020	69028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987359
1119	NC_016861	CTG	2	6	69161	69166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987359
1120	NC_016861	TG	3	6	69174	69179	0 %	50 %	50 %	0 %	378987359
1121	NC_016861	GGC	2	6	69202	69207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987359
1122	NC_016861	GCA	2	6	69214	69219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987359
1123	NC_016861	CAG	2	6	69271	69276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987359
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1125	NC_016861	AGG	2	6	69384	69389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987359
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1248	NC_016861	ACATT	2	10	76411	76420	40 %	40 %	0 %	20 %	378987372
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1250	NC_016861	A	6	6	76484	76489	100 %	0 %	0 %	0 %	378987372
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