MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 91814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_016860	ATCACC	2	12	846186	846197	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	378983337
16003	NC_016860	CAT	2	6	846314	846319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378983337
16004	NC_016860	ACC	2	6	846399	846404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378983337
16005	NC_016860	CGG	2	6	846440	846445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378983337
16006	NC_016860	TGA	2	6	846520	846525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378983337
16007	NC_016860	CGG	2	6	846536	846541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378983337
16008	NC_016860	AGA	3	9	846548	846556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378983337
16009	NC_016860	GCG	2	6	846558	846563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378983337
16010	NC_016860	GTT	2	6	846594	846599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378983337
16011	NC_016860	CAT	2	6	846656	846661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378983337
16012	NC_016860	GGT	2	6	846666	846671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378983337
16013	NC_016860	TAAAA	2	10	846769	846778	80 %	20 %	0 %	0 %	378983337
16014	NC_016860	ATG	2	6	848356	848361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378983338
16015	NC_016860	CTG	2	6	848452	848457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983338
16016	NC_016860	GTT	2	6	848529	848534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378983338
16017	NC_016860	TAC	2	6	848605	848610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378983338
16018	NC_016860	CTT	2	6	848667	848672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378983338
16019	NC_016860	TTC	3	9	848698	848706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378983338
16020	NC_016860	CTGG	2	8	848748	848755	0 %	25 %	50 %	25 %	378983338
16021	NC_016860	TAC	2	6	848971	848976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378983338
16022	NC_016860	GCC	2	6	849025	849030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378983338
16023	NC_016860	CGA	2	6	849072	849077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378983338
16024	NC_016860	CCT	2	6	849158	849163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378983338
16025	NC_016860	TAT	2	6	849237	849242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378983338
16026	NC_016860	CTG	2	6	849337	849342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983338
16027	NC_016860	AGC	2	6	849344	849349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378983338
16028	NC_016860	GC	3	6	849351	849356	0 %	0 %	50 %	50 %	378983338
16029	NC_016860	GAA	2	6	849399	849404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378983338
16030	NC_016860	CTG	3	9	849421	849429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983338
16031	NC_016860	TGAC	2	8	849449	849456	25 %	25 %	25 %	25 %	378983338
16032	NC_016860	CGA	2	6	849482	849487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378983338
16033	NC_016860	ATTCC	2	10	849491	849500	20 %	40 %	0 %	40 %	378983338
16034	NC_016860	TGG	2	6	849536	849541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378983338
16035	NC_016860	CTG	3	9	849553	849561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983338
16036	NC_016860	ATC	2	6	849565	849570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378983338
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16038	NC_016860	GC	3	6	849627	849632	0 %	0 %	50 %	50 %	378983338
16039	NC_016860	GGTT	2	8	849676	849683	0 %	50 %	50 %	0 %	378983338
16040	NC_016860	GTC	2	6	849698	849703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983338
16041	NC_016860	CTG	2	6	849769	849774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983338
16042	NC_016860	TGG	2	6	849815	849820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378983338
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16044	NC_016860	TAC	2	6	849959	849964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378983339
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16046	NC_016860	CTG	2	6	849979	849984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983339
16047	NC_016860	GTT	2	6	850152	850157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378983339
16048	NC_016860	TGC	2	6	850158	850163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983339
16049	NC_016860	CGC	2	6	850179	850184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378983339
16050	NC_016860	GAT	2	6	850209	850214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378983339
16051	NC_016860	TTC	2	6	850234	850239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378983339
16052	NC_016860	CGGT	2	8	850244	850251	0 %	25 %	50 %	25 %	378983339
16053	NC_016860	GCC	2	6	850329	850334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378983339
16054	NC_016860	TAC	2	6	850408	850413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378983339
16055	NC_016860	CTT	2	6	850422	850427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378983339
16056	NC_016860	CTG	2	6	850450	850455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983339
16057	NC_016860	GAT	2	6	850476	850481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378983339
16058	NC_016860	GC	6	12	850536	850547	0 %	0 %	50 %	50 %	378983339
16059	NC_016860	GCG	2	6	850561	850566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378983339
16060	NC_016860	GGCG	2	8	850593	850600	0 %	0 %	75 %	25 %	378983339
16061	NC_016860	ATC	2	6	850649	850654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378983339
16062	NC_016860	GCC	2	6	850657	850662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378983339
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16065	NC_016860	TAA	2	6	850719	850724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378983339
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16067	NC_016860	GCT	2	6	850770	850775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983339
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16070	NC_016860	GAT	2	6	850899	850904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378983339
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16072	NC_016860	TGA	2	6	850958	850963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378983339
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16084	NC_016860	TCG	2	6	851600	851605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983342
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16089	NC_016860	TGC	2	6	851972	851977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983343
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16093	NC_016860	GCT	2	6	852162	852167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983343
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16099	NC_016860	ATTG	2	8	852779	852786	25 %	50 %	25 %	0 %	378983344
16100	NC_016860	GCC	2	6	852807	852812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378983344
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16479	NC_016860	TGC	2	6	870604	870609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983361
16480	NC_016860	CCGCG	2	10	870644	870653	0 %	0 %	40 %	60 %	378983361
16481	NC_016860	TGA	2	6	870718	870723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378983361
16482	NC_016860	CAGGC	2	10	870799	870808	20 %	0 %	40 %	40 %	378983362
16483	NC_016860	CAT	2	6	870809	870814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378983362
16484	NC_016860	GCT	2	6	870815	870820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983362
16485	NC_016860	CTG	4	12	870828	870839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983362
16486	NC_016860	TGGC	2	8	870840	870847	0 %	25 %	50 %	25 %	378983362
16487	NC_016860	GAA	2	6	870854	870859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378983362
16488	NC_016860	CTG	3	9	870873	870881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983362
16489	NC_016860	CGG	2	6	870893	870898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378983362
16490	NC_016860	GCT	2	6	870899	870904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983362
16491	NC_016860	CTG	2	6	870951	870956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983362
16492	NC_016860	CAC	2	6	870960	870965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378983362
16493	NC_016860	GC	3	6	871006	871011	0 %	0 %	50 %	50 %	378983362
16494	NC_016860	GCGCTG	2	12	871041	871052	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378983362
16495	NC_016860	CGC	2	6	871153	871158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378983362
16496	NC_016860	GCT	2	6	871202	871207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983362
16497	NC_016860	CTG	2	6	871224	871229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983362
16498	NC_016860	CGGCG	2	10	871232	871241	0 %	0 %	60 %	40 %	378983362
16499	NC_016860	ACT	2	6	871288	871293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378983362
16500	NC_016860	GGC	3	9	871322	871330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378983362

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