MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 91814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_016860	AGGG	2	8	319023	319030	25 %	0 %	75 %	0 %	378982815
6003	NC_016860	GTG	2	6	319088	319093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982815
6004	NC_016860	CAG	2	6	319100	319105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982815
6005	NC_016860	GCG	2	6	319113	319118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982815
6006	NC_016860	CAA	2	6	319150	319155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982815
6007	NC_016860	TGAA	2	8	319233	319240	50 %	25 %	25 %	0 %	378982816
6008	NC_016860	GGT	2	6	319257	319262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982816
6009	NC_016860	AGA	2	6	319395	319400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982816
6010	NC_016860	CGC	2	6	319444	319449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982816
6011	NC_016860	CGA	2	6	319504	319509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982816
6012	NC_016860	A	6	6	319553	319558	100 %	0 %	0 %	0 %	378982816
6013	NC_016860	CAG	2	6	319681	319686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982816
6014	NC_016860	GGAAA	2	10	319698	319707	60 %	0 %	40 %	0 %	378982816
6015	NC_016860	CAG	2	6	319832	319837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982817
6016	NC_016860	GCC	3	9	320020	320028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982817
6017	NC_016860	CAG	2	6	320057	320062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982817
6018	NC_016860	CGGTAC	2	12	320073	320084	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378982817
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6020	NC_016860	GAA	2	6	320099	320104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982817
6021	NC_016860	GC	3	6	320190	320195	0 %	0 %	50 %	50 %	378982817
6022	NC_016860	TTA	2	6	320198	320203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982817
6023	NC_016860	GCT	2	6	320227	320232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982817
6024	NC_016860	GATA	2	8	320308	320315	50 %	25 %	25 %	0 %	378982817
6025	NC_016860	CAT	2	6	320338	320343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982817
6026	NC_016860	AGC	2	6	320461	320466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982817
6027	NC_016860	CTG	3	9	320483	320491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982817
6028	NC_016860	GCT	2	6	320515	320520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982817
6029	NC_016860	TGA	2	6	320683	320688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982817
6030	NC_016860	CTG	2	6	320699	320704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982817
6031	NC_016860	GC	3	6	320724	320729	0 %	0 %	50 %	50 %	378982817
6032	NC_016860	GGT	2	6	320773	320778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982817
6033	NC_016860	CCGA	2	8	320837	320844	25 %	0 %	25 %	50 %	378982817
6034	NC_016860	GCC	2	6	320864	320869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982817
6035	NC_016860	GGCT	2	8	320928	320935	0 %	25 %	50 %	25 %	378982817
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6040	NC_016860	GACA	2	8	321114	321121	50 %	0 %	25 %	25 %	378982817
6041	NC_016860	CGC	2	6	321131	321136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982818
6042	NC_016860	GCG	2	6	321139	321144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982818
6043	NC_016860	ATG	2	6	321148	321153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982818
6044	NC_016860	CCA	2	6	321164	321169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982818
6045	NC_016860	AC	3	6	321207	321212	50 %	0 %	0 %	50 %	378982818
6046	NC_016860	CAGC	2	8	321213	321220	25 %	0 %	25 %	50 %	378982818
6047	NC_016860	GGCT	2	8	321269	321276	0 %	25 %	50 %	25 %	378982818
6048	NC_016860	GCG	2	6	321286	321291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982818
6049	NC_016860	CGC	2	6	321306	321311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982818
6050	NC_016860	CTG	2	6	321388	321393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982818
6051	NC_016860	GCG	2	6	321441	321446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982818
6052	NC_016860	TGA	2	6	321489	321494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982818
6053	NC_016860	GCC	2	6	321496	321501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982818
6054	NC_016860	CGGCG	2	10	321520	321529	0 %	0 %	60 %	40 %	378982818
6055	NC_016860	CTG	2	6	321547	321552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982818
6056	NC_016860	ATC	2	6	321598	321603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982818
6057	NC_016860	GGC	2	6	321612	321617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982818
6058	NC_016860	ACC	2	6	321656	321661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982818
6059	NC_016860	CTG	2	6	321739	321744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982818
6060	NC_016860	GAC	2	6	321815	321820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982818
6061	NC_016860	GCG	2	6	321822	321827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982818
6062	NC_016860	GGAT	2	8	321908	321915	25 %	25 %	50 %	0 %	378982818
6063	NC_016860	ACA	2	6	321933	321938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982818
6064	NC_016860	GCC	4	12	321966	321977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982818
6065	NC_016860	CTG	2	6	322009	322014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982818
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6070	NC_016860	GCG	2	6	322175	322180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982818
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6072	NC_016860	CATT	2	8	322215	322222	25 %	50 %	0 %	25 %	378982818
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6092	NC_016860	TTTA	2	8	323065	323072	25 %	75 %	0 %	0 %	378982819
6093	NC_016860	CG	3	6	323141	323146	0 %	0 %	50 %	50 %	378982819
6094	NC_016860	ATAA	2	8	323159	323166	75 %	25 %	0 %	0 %	378982819
6095	NC_016860	AT	3	6	323187	323192	50 %	50 %	0 %	0 %	378982819
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6103	NC_016860	GC	4	8	323894	323901	0 %	0 %	50 %	50 %	378982821
6104	NC_016860	GTTCTG	2	12	323916	323927	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378982821
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6113	NC_016860	CTGG	2	8	324379	324386	0 %	25 %	50 %	25 %	378982821
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6120	NC_016860	CGCC	2	8	324617	324624	0 %	0 %	25 %	75 %	378982821
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6489	NC_016860	TAA	2	6	340610	340615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982836
6490	NC_016860	ATC	2	6	340786	340791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982837
6491	NC_016860	CGGA	2	8	340815	340822	25 %	0 %	50 %	25 %	378982837
6492	NC_016860	CCA	2	6	340862	340867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982837
6493	NC_016860	CGG	2	6	340890	340895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982837
6494	NC_016860	TGC	2	6	341180	341185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982838
6495	NC_016860	GAA	2	6	341280	341285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982838
6496	NC_016860	TCA	2	6	341294	341299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982838
6497	NC_016860	A	7	7	342233	342239	100 %	0 %	0 %	0 %	378982839
6498	NC_016860	ATG	2	6	342264	342269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982839
6499	NC_016860	GCT	2	6	342270	342275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982839
6500	NC_016860	GTT	2	6	342277	342282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982839

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