MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 90422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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90002	NC_016857	T	6	6	4853332	4853337	0 %	100 %	0 %	0 %	379703818
90003	NC_016857	TAA	2	6	4853388	4853393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703818
90004	NC_016857	TCA	2	6	4853405	4853410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703818
90005	NC_016857	CT	3	6	4853435	4853440	0 %	50 %	0 %	50 %	379703818
90006	NC_016857	GCA	2	6	4853454	4853459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703818
90007	NC_016857	GC	3	6	4853527	4853532	0 %	0 %	50 %	50 %	379703818
90008	NC_016857	TGG	2	6	4853576	4853581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703818
90009	NC_016857	CGA	2	6	4853616	4853621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703818
90010	NC_016857	ACAAT	2	10	4853637	4853646	60 %	20 %	0 %	20 %	379703818
90011	NC_016857	CTG	2	6	4853696	4853701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703819
90012	NC_016857	CTTT	2	8	4853865	4853872	0 %	75 %	0 %	25 %	379703820
90013	NC_016857	GCG	2	6	4853875	4853880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703820
90014	NC_016857	GCT	2	6	4853924	4853929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703820
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90016	NC_016857	CGC	2	6	4854002	4854007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703820
90017	NC_016857	GGA	2	6	4854017	4854022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379703820
90018	NC_016857	CGC	2	6	4854055	4854060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703820
90019	NC_016857	CGC	2	6	4854100	4854105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703820
90020	NC_016857	GCT	2	6	4854137	4854142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703820
90021	NC_016857	ATGGAT	2	12	4854147	4854158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703820
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90024	NC_016857	CGG	2	6	4854416	4854421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703820
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90031	NC_016857	AATG	2	8	4854890	4854897	50 %	25 %	25 %	0 %	379703821
90032	NC_016857	AACG	2	8	4854998	4855005	50 %	0 %	25 %	25 %	379703821
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90034	NC_016857	GGT	2	6	4855129	4855134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703821
90035	NC_016857	TGC	3	9	4855188	4855196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703821
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90041	NC_016857	TCCG	2	8	4855702	4855709	0 %	25 %	25 %	50 %	379703821
90042	NC_016857	GTC	2	6	4855760	4855765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703821
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90050	NC_016857	CTG	2	6	4855988	4855993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703821
90051	NC_016857	TGG	2	6	4856037	4856042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703821
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90053	NC_016857	TCG	2	6	4856128	4856133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703821
90054	NC_016857	TGCC	2	8	4856142	4856149	0 %	25 %	25 %	50 %	379703821
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90105	NC_016857	CCAG	2	8	4858663	4858670	25 %	0 %	25 %	50 %	379703823
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.