MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 90422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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65002	NC_016857	CCA	2	6	3516581	3516586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379702591
65003	NC_016857	GC	4	8	3516690	3516697	0 %	0 %	50 %	50 %	379702591
65004	NC_016857	CGC	2	6	3516718	3516723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379702591
65005	NC_016857	ACA	2	6	3516790	3516795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379702591
65006	NC_016857	CTG	3	9	3516804	3516812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379702591
65007	NC_016857	CAT	2	6	3516827	3516832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379702591
65008	NC_016857	CCGC	2	8	3516855	3516862	0 %	0 %	25 %	75 %	379702591
65009	NC_016857	AAC	2	6	3516870	3516875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379702591
65010	NC_016857	GC	3	6	3516896	3516901	0 %	0 %	50 %	50 %	379702591
65011	NC_016857	CTT	2	6	3516902	3516907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379702591
65012	NC_016857	GGCA	2	8	3516947	3516954	25 %	0 %	50 %	25 %	379702591
65013	NC_016857	CGC	2	6	3516977	3516982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379702591
65014	NC_016857	CGG	2	6	3517145	3517150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379702591
65015	NC_016857	GAC	2	6	3517179	3517184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379702591
65016	NC_016857	GCC	2	6	3517192	3517197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379702591
65017	NC_016857	TGGA	2	8	3517212	3517219	25 %	25 %	50 %	0 %	379702591
65018	NC_016857	CCG	2	6	3517229	3517234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379702591
65019	NC_016857	TGA	2	6	3517259	3517264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379702591
65020	NC_016857	CGA	2	6	3517400	3517405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379702591
65021	NC_016857	CCAG	2	8	3517426	3517433	25 %	0 %	25 %	50 %	379702591
65022	NC_016857	TAT	2	6	3517439	3517444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379702591
65023	NC_016857	ACT	2	6	3517450	3517455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379702591
65024	NC_016857	CAG	2	6	3517461	3517466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379702591
65025	NC_016857	TCGC	2	8	3517521	3517528	0 %	25 %	25 %	50 %	379702591
65026	NC_016857	TCT	2	6	3517555	3517560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379702591
65027	NC_016857	CTG	2	6	3517608	3517613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379702591
65028	NC_016857	CAC	2	6	3517634	3517639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379702591
65029	NC_016857	TGC	2	6	3517765	3517770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379702591
65030	NC_016857	CTGCG	2	10	3517866	3517875	0 %	20 %	40 %	40 %	379702591
65031	NC_016857	CAT	2	6	3517883	3517888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379702591
65032	NC_016857	CTAT	2	8	3517954	3517961	25 %	50 %	0 %	25 %	379702591
65033	NC_016857	TGAT	2	8	3517993	3518000	25 %	50 %	25 %	0 %	379702591
65034	NC_016857	TACCG	2	10	3518022	3518031	20 %	20 %	20 %	40 %	379702591
65035	NC_016857	CAA	2	6	3518057	3518062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379702591
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65038	NC_016857	CGG	2	6	3518195	3518200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379702591
65039	NC_016857	TGA	2	6	3518210	3518215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379702591
65040	NC_016857	CAG	2	6	3518220	3518225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379702591
65041	NC_016857	CTG	2	6	3518229	3518234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379702591
65042	NC_016857	TC	3	6	3518237	3518242	0 %	50 %	0 %	50 %	379702591
65043	NC_016857	CTGG	2	8	3518252	3518259	0 %	25 %	50 %	25 %	379702591
65044	NC_016857	CTG	2	6	3518286	3518291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379702591
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65047	NC_016857	CTG	2	6	3518436	3518441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379702591
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65049	NC_016857	CGG	2	6	3518588	3518593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379702591
65050	NC_016857	CAACTC	2	12	3518594	3518605	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379702591
65051	NC_016857	GGC	2	6	3518613	3518618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379702591
65052	NC_016857	GC	3	6	3518628	3518633	0 %	0 %	50 %	50 %	379702591
65053	NC_016857	CAC	2	6	3518850	3518855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379702591
65054	NC_016857	GAT	2	6	3518921	3518926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379702591
65055	NC_016857	ACG	2	6	3519016	3519021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379702591
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65057	NC_016857	TTG	2	6	3519085	3519090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379702591
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65059	NC_016857	CGG	2	6	3519149	3519154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379702591
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65062	NC_016857	TTCGGC	2	12	3519207	3519218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379702591
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65065	NC_016857	TGG	2	6	3519415	3519420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379702591
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65071	NC_016857	TCCGA	2	10	3519726	3519735	20 %	20 %	20 %	40 %	379702591
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65089	NC_016857	GGT	2	6	3520925	3520930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379702592
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65102	NC_016857	CG	4	8	3521411	3521418	0 %	0 %	50 %	50 %	379702592
65103	NC_016857	GCG	2	6	3521488	3521493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379702592
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65107	NC_016857	CA	3	6	3521617	3521622	50 %	0 %	0 %	50 %	379702592
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65115	NC_016857	CAT	2	6	3522145	3522150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379702593
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