MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 91767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016856	TGA	2	6	179327	179332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448456
3502	NC_016856	ACG	2	6	179333	179338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448456
3503	NC_016856	GAC	2	6	179407	179412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448456
3504	NC_016856	CAC	2	6	179470	179475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448456
3505	NC_016856	CTT	2	6	179489	179494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448456
3506	NC_016856	GTT	2	6	179500	179505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448456
3507	NC_016856	AAT	2	6	179627	179632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448457
3508	NC_016856	CGT	2	6	179786	179791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448457
3509	NC_016856	CCG	2	6	179857	179862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448457
3510	NC_016856	AGA	2	6	179894	179899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448457
3511	NC_016856	GAA	2	6	179900	179905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448457
3512	NC_016856	GCG	2	6	179910	179915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448457
3513	NC_016856	GCA	3	9	179919	179927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448457
3514	NC_016856	CTG	2	6	179929	179934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448457
3515	NC_016856	GCG	2	6	179940	179945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448457
3516	NC_016856	ACGTTC	2	12	179950	179961	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378448457
3517	NC_016856	CT	3	6	180143	180148	0 %	50 %	0 %	50 %	378448457
3518	NC_016856	GCA	3	9	180183	180191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448457
3519	NC_016856	CGGCTG	2	12	180214	180225	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378448457
3520	NC_016856	CAG	3	9	180229	180237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448457
3521	NC_016856	CGG	2	6	180272	180277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448457
3522	NC_016856	CGA	2	6	180278	180283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448457
3523	NC_016856	GAAA	2	8	180404	180411	75 %	0 %	25 %	0 %	378448457
3524	NC_016856	GCG	3	9	180510	180518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448457
3525	NC_016856	CGG	2	6	180526	180531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448457
3526	NC_016856	CTG	2	6	180547	180552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448457
3527	NC_016856	ACG	2	6	180595	180600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448457
3528	NC_016856	GC	3	6	180636	180641	0 %	0 %	50 %	50 %	378448457
3529	NC_016856	CG	3	6	180738	180743	0 %	0 %	50 %	50 %	378448457
3530	NC_016856	GCT	2	6	180756	180761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448457
3531	NC_016856	GCGG	2	8	180762	180769	0 %	0 %	75 %	25 %	378448457
3532	NC_016856	TGC	2	6	180784	180789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448457
3533	NC_016856	GAA	2	6	180828	180833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448457
3534	NC_016856	TGA	2	6	180889	180894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448457
3535	NC_016856	CAG	2	6	180954	180959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448457
3536	NC_016856	TCA	2	6	181012	181017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448457
3537	NC_016856	GCT	2	6	181032	181037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448457
3538	NC_016856	CT	3	6	181064	181069	0 %	50 %	0 %	50 %	378448457
3539	NC_016856	GAA	2	6	181097	181102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448457
3540	NC_016856	TGG	2	6	181144	181149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448457
3541	NC_016856	AAG	2	6	181173	181178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448457
3542	NC_016856	ACC	2	6	181206	181211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448457
3543	NC_016856	A	6	6	181218	181223	100 %	0 %	0 %	0 %	378448457
3544	NC_016856	GGT	2	6	181260	181265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448457
3545	NC_016856	CGG	2	6	181286	181291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448457
3546	NC_016856	TGA	2	6	181405	181410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448457
3547	NC_016856	TC	3	6	181417	181422	0 %	50 %	0 %	50 %	378448457
3548	NC_016856	ACC	2	6	181432	181437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448457
3549	NC_016856	CAA	2	6	181481	181486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448457
3550	NC_016856	TGT	2	6	181489	181494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448457
3551	NC_016856	ATG	2	6	181717	181722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448458
3552	NC_016856	GGGC	2	8	181757	181764	0 %	0 %	75 %	25 %	378448458
3553	NC_016856	ACA	2	6	181832	181837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448458
3554	NC_016856	GCT	2	6	181884	181889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448458
3555	NC_016856	GAA	2	6	181909	181914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448458
3556	NC_016856	GCTG	2	8	181923	181930	0 %	25 %	50 %	25 %	378448458
3557	NC_016856	CGG	2	6	182013	182018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448458
3558	NC_016856	AAAGTG	2	12	182044	182055	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378448458
3559	NC_016856	TGGAAG	2	12	182093	182104	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378448458
3560	NC_016856	ATC	2	6	182143	182148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448458
3561	NC_016856	CG	3	6	182198	182203	0 %	0 %	50 %	50 %	378448458
3562	NC_016856	AAG	2	6	182234	182239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448458
3563	NC_016856	GCG	2	6	182264	182269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448458
3564	NC_016856	ATC	2	6	182272	182277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448458
3565	NC_016856	CGG	2	6	182354	182359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448458
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3567	NC_016856	A	6	6	182482	182487	100 %	0 %	0 %	0 %	378448458
3568	NC_016856	ATG	2	6	182510	182515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448458
3569	NC_016856	TGG	2	6	182522	182527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448458
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3571	NC_016856	TCG	2	6	182660	182665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448458
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3573	NC_016856	ACT	2	6	182738	182743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448458
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3582	NC_016856	GCA	2	6	183273	183278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448459
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3584	NC_016856	AT	3	6	183429	183434	50 %	50 %	0 %	0 %	378448460
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3590	NC_016856	GGC	2	6	183618	183623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448460
3591	NC_016856	GCA	2	6	183632	183637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448460
3592	NC_016856	TGA	2	6	183645	183650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448460
3593	NC_016856	CAA	2	6	183666	183671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448460
3594	NC_016856	GCC	2	6	183672	183677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448460
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3596	NC_016856	GGCCA	2	10	183903	183912	20 %	0 %	40 %	40 %	378448461
3597	NC_016856	GCGCC	2	10	183916	183925	0 %	0 %	40 %	60 %	378448461
3598	NC_016856	CGT	2	6	183931	183936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448461
3599	NC_016856	ATA	2	6	183945	183950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448461
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3601	NC_016856	GTAA	2	8	184102	184109	50 %	25 %	25 %	0 %	378448461
3602	NC_016856	CTG	2	6	184115	184120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448461
3603	NC_016856	GCAT	2	8	184134	184141	25 %	25 %	25 %	25 %	378448461
3604	NC_016856	GCC	2	6	184203	184208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448461
3605	NC_016856	GCC	2	6	184223	184228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448461
3606	NC_016856	TCT	2	6	184263	184268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448461
3607	NC_016856	CGG	2	6	184370	184375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448461
3608	NC_016856	GCC	2	6	184384	184389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448461
3609	NC_016856	CGTTT	2	10	184418	184427	0 %	60 %	20 %	20 %	378448461
3610	NC_016856	T	6	6	184425	184430	0 %	100 %	0 %	0 %	378448461
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3613	NC_016856	GGGGA	2	10	184470	184479	20 %	0 %	80 %	0 %	378448461
3614	NC_016856	TCG	2	6	186557	186562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448462
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3620	NC_016856	GCT	2	6	186766	186771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448462
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3982	NC_016856	GTG	2	6	205000	205005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448478
3983	NC_016856	GCT	2	6	205179	205184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448478
3984	NC_016856	TCG	2	6	205217	205222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448478
3985	NC_016856	CGA	2	6	205391	205396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448478
3986	NC_016856	TAT	2	6	205544	205549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448478
3987	NC_016856	CGC	2	6	205574	205579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448478
3988	NC_016856	CGAC	2	8	205580	205587	25 %	0 %	25 %	50 %	378448478
3989	NC_016856	CT	3	6	205591	205596	0 %	50 %	0 %	50 %	378448478
3990	NC_016856	CCTG	2	8	205609	205616	0 %	25 %	25 %	50 %	378448478
3991	NC_016856	TGGTC	2	10	205637	205646	0 %	40 %	40 %	20 %	378448478
3992	NC_016856	A	6	6	205653	205658	100 %	0 %	0 %	0 %	378448478
3993	NC_016856	TGG	2	6	205676	205681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448478
3994	NC_016856	ATAGCG	2	12	205739	205750	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378448478
3995	NC_016856	CAG	2	6	205752	205757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448478
3996	NC_016856	TTC	2	6	205768	205773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448478
3997	NC_016856	CG	3	6	205850	205855	0 %	0 %	50 %	50 %	378448479
3998	NC_016856	CAG	3	9	205880	205888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448479
3999	NC_016856	CGA	2	6	205933	205938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448479
4000	NC_016856	TGC	2	6	206005	206010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448479

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