MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 91767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_016856	GGCCTG	2	12	1008887	1008898	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378449325
19503	NC_016856	ACC	2	6	1008913	1008918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378449325
19504	NC_016856	TGT	2	6	1008943	1008948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378449325
19505	NC_016856	TGC	2	6	1008986	1008991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449325
19506	NC_016856	ATT	2	6	1009006	1009011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378449325
19507	NC_016856	CTG	2	6	1009020	1009025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449325
19508	NC_016856	TAT	2	6	1009028	1009033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378449325
19509	NC_016856	TTTA	2	8	1009050	1009057	25 %	75 %	0 %	0 %	378449325
19510	NC_016856	CTG	2	6	1009059	1009064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449325
19511	NC_016856	ACA	2	6	1009367	1009372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378449326
19512	NC_016856	TTA	2	6	1009388	1009393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378449326
19513	NC_016856	TGT	2	6	1009413	1009418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378449326
19514	NC_016856	TCT	2	6	1009451	1009456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378449326
19515	NC_016856	CATTG	2	10	1009656	1009665	20 %	40 %	20 %	20 %	378449326
19516	NC_016856	CGT	2	6	1009710	1009715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449326
19517	NC_016856	TTGT	2	8	1009741	1009748	0 %	75 %	25 %	0 %	378449326
19518	NC_016856	GTT	2	6	1009792	1009797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378449326
19519	NC_016856	TGT	2	6	1009842	1009847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378449326
19520	NC_016856	CAC	2	6	1009944	1009949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378449326
19521	NC_016856	TGG	2	6	1009974	1009979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378449326
19522	NC_016856	AGA	2	6	1009985	1009990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378449326
19523	NC_016856	ATG	2	6	1010104	1010109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378449326
19524	NC_016856	TTAT	2	8	1010210	1010217	25 %	75 %	0 %	0 %	378449326
19525	NC_016856	CGC	2	6	1010244	1010249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449326
19526	NC_016856	AT	3	6	1010307	1010312	50 %	50 %	0 %	0 %	378449326
19527	NC_016856	AAC	2	6	1010428	1010433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378449326
19528	NC_016856	GCT	2	6	1010445	1010450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449326
19529	NC_016856	GGCGTT	2	12	1010565	1010576	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378449326
19530	NC_016856	TGCC	2	8	1010613	1010620	0 %	25 %	25 %	50 %	378449326
19531	NC_016856	CTG	2	6	1010731	1010736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449326
19532	NC_016856	ACG	2	6	1010754	1010759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449326
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19534	NC_016856	GGC	2	6	1011114	1011119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378449327
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19536	NC_016856	T	6	6	1011199	1011204	0 %	100 %	0 %	0 %	378449327
19537	NC_016856	ATC	2	6	1011251	1011256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378449327
19538	NC_016856	GTC	2	6	1011257	1011262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449327
19539	NC_016856	TGG	2	6	1011369	1011374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378449327
19540	NC_016856	TCA	2	6	1011378	1011383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378449327
19541	NC_016856	TCA	2	6	1011432	1011437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378449327
19542	NC_016856	CTT	2	6	1011493	1011498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378449327
19543	NC_016856	T	6	6	1011497	1011502	0 %	100 %	0 %	0 %	378449327
19544	NC_016856	CTGC	2	8	1011532	1011539	0 %	25 %	25 %	50 %	378449327
19545	NC_016856	CGC	2	6	1011550	1011555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449327
19546	NC_016856	CGC	3	9	1011568	1011576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449327
19547	NC_016856	CAC	2	6	1011605	1011610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378449327
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19549	NC_016856	TAA	2	6	1011715	1011720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378449327
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19551	NC_016856	TG	3	6	1011971	1011976	0 %	50 %	50 %	0 %	378449328
19552	NC_016856	TGC	2	6	1011991	1011996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449328
19553	NC_016856	TGC	2	6	1012045	1012050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449328
19554	NC_016856	TCAT	2	8	1012078	1012085	25 %	50 %	0 %	25 %	378449328
19555	NC_016856	ATAC	2	8	1012109	1012116	50 %	25 %	0 %	25 %	378449328
19556	NC_016856	ATC	2	6	1012126	1012131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378449328
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19558	NC_016856	TGT	2	6	1012193	1012198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378449328
19559	NC_016856	AAT	2	6	1012211	1012216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378449328
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19565	NC_016856	TAT	2	6	1012583	1012588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378449329
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19571	NC_016856	ATT	2	6	1012908	1012913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378449329
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19582	NC_016856	ATA	2	6	1013324	1013329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378449329
19583	NC_016856	TTTA	2	8	1013334	1013341	25 %	75 %	0 %	0 %	378449329
19584	NC_016856	TA	3	6	1013373	1013378	50 %	50 %	0 %	0 %	378449329
19585	NC_016856	TAA	2	6	1013481	1013486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378449330
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19588	NC_016856	TGACGT	2	12	1013607	1013618	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378449330
19589	NC_016856	GTG	2	6	1013650	1013655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378449330
19590	NC_016856	CCAT	2	8	1013663	1013670	25 %	25 %	0 %	50 %	378449330
19591	NC_016856	TCG	2	6	1013699	1013704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449330
19592	NC_016856	GC	3	6	1013853	1013858	0 %	0 %	50 %	50 %	378449330
19593	NC_016856	CGA	2	6	1013864	1013869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449330
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19597	NC_016856	CAG	2	6	1014135	1014140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449330
19598	NC_016856	AG	3	6	1014206	1014211	50 %	0 %	50 %	0 %	378449330
19599	NC_016856	AGCC	2	8	1014274	1014281	25 %	0 %	25 %	50 %	378449330
19600	NC_016856	TCG	2	6	1014314	1014319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449330
19601	NC_016856	TCA	2	6	1014380	1014385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378449330
19602	NC_016856	CGC	2	6	1014387	1014392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449330
19603	NC_016856	CG	3	6	1014431	1014436	0 %	0 %	50 %	50 %	378449330
19604	NC_016856	GAA	2	6	1014439	1014444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378449330
19605	NC_016856	ATC	2	6	1014464	1014469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378449330
19606	NC_016856	GCA	2	6	1014478	1014483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449330
19607	NC_016856	GTT	2	6	1014502	1014507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378449330
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19613	NC_016856	TGC	2	6	1014916	1014921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449330
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19616	NC_016856	TCA	2	6	1015155	1015160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378449330
19617	NC_016856	GAT	2	6	1015201	1015206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378449330
19618	NC_016856	ACGGCC	2	12	1015207	1015218	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378449330
19619	NC_016856	T	7	7	1015329	1015335	0 %	100 %	0 %	0 %	378449330
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19624	NC_016856	TGG	2	6	1015494	1015499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378449330
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19628	NC_016856	ATG	2	6	1015800	1015805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023162
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19643	NC_016856	GCG	2	6	1017192	1017197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378449332
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19967	NC_016856	CGA	2	6	1033289	1033294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449348
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19991	NC_016856	CTTC	2	8	1034523	1034530	0 %	50 %	0 %	50 %	378449350
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19994	NC_016856	CG	3	6	1034730	1034735	0 %	0 %	50 %	50 %	378449350
19995	NC_016856	GGC	2	6	1034758	1034763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378449350
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