MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 91767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016856	TCA	2	6	577378	577383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448860
11002	NC_016856	ACG	2	6	577423	577428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448860
11003	NC_016856	TGG	2	6	577489	577494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448860
11004	NC_016856	TGC	2	6	577586	577591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448860
11005	NC_016856	GC	3	6	577682	577687	0 %	0 %	50 %	50 %	378448860
11006	NC_016856	GTC	2	6	577697	577702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448860
11007	NC_016856	GCT	2	6	577734	577739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448860
11008	NC_016856	GAA	2	6	577753	577758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448860
11009	NC_016856	TGG	2	6	577763	577768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448860
11010	NC_016856	TCG	2	6	577772	577777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448860
11011	NC_016856	GCG	2	6	577791	577796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448860
11012	NC_016856	TGG	2	6	577814	577819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448860
11013	NC_016856	GAA	2	6	577882	577887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448860
11014	NC_016856	TGT	2	6	577890	577895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448860
11015	NC_016856	CTAT	2	8	577919	577926	25 %	50 %	0 %	25 %	378448860
11016	NC_016856	CGC	2	6	577947	577952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448860
11017	NC_016856	ATGT	2	8	578191	578198	25 %	50 %	25 %	0 %	378448861
11018	NC_016856	AAG	2	6	578207	578212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448861
11019	NC_016856	CAC	2	6	578217	578222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448861
11020	NC_016856	AC	3	6	578342	578347	50 %	0 %	0 %	50 %	378448861
11021	NC_016856	GCG	2	6	578350	578355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448861
11022	NC_016856	CCGGC	2	10	578387	578396	0 %	0 %	40 %	60 %	378448861
11023	NC_016856	GGC	2	6	578565	578570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448861
11024	NC_016856	CG	3	6	578579	578584	0 %	0 %	50 %	50 %	378448861
11025	NC_016856	ACA	2	6	578589	578594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448861
11026	NC_016856	GCC	2	6	578618	578623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448861
11027	NC_016856	TA	3	6	578708	578713	50 %	50 %	0 %	0 %	378448861
11028	NC_016856	AGCC	2	8	578714	578721	25 %	0 %	25 %	50 %	378448861
11029	NC_016856	GCG	2	6	578792	578797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448861
11030	NC_016856	TTA	2	6	578801	578806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448861
11031	NC_016856	ACGCCG	2	12	578807	578818	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378448861
11032	NC_016856	CTG	2	6	578824	578829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448861
11033	NC_016856	CAG	2	6	578830	578835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448861
11034	NC_016856	GGGCTG	2	12	578877	578888	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378448861
11035	NC_016856	CTG	2	6	578962	578967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448861
11036	NC_016856	ATC	2	6	579052	579057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448861
11037	NC_016856	TGT	2	6	579092	579097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448861
11038	NC_016856	GCG	2	6	579130	579135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448861
11039	NC_016856	CAG	2	6	579217	579222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448861
11040	NC_016856	TGC	2	6	579236	579241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448861
11041	NC_016856	TG	3	6	579318	579323	0 %	50 %	50 %	0 %	378448861
11042	NC_016856	CAC	2	6	579330	579335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448861
11043	NC_016856	TGC	2	6	579368	579373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448861
11044	NC_016856	AGAC	2	8	579384	579391	50 %	0 %	25 %	25 %	378448861
11045	NC_016856	CGG	2	6	579437	579442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448861
11046	NC_016856	TGC	2	6	579456	579461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448861
11047	NC_016856	CGCAA	2	10	579467	579476	40 %	0 %	20 %	40 %	378448861
11048	NC_016856	TGG	2	6	579479	579484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448861
11049	NC_016856	GC	3	6	579536	579541	0 %	0 %	50 %	50 %	378448861
11050	NC_016856	AAC	2	6	579574	579579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448861
11051	NC_016856	ACT	2	6	579626	579631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448861
11052	NC_016856	GGT	3	9	579804	579812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448861
11053	NC_016856	GCG	2	6	580024	580029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448862
11054	NC_016856	ATA	2	6	580106	580111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448862
11055	NC_016856	CTG	2	6	580139	580144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448862
11056	NC_016856	GGC	2	6	580152	580157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448862
11057	NC_016856	GAA	2	6	580192	580197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448862
11058	NC_016856	AAAT	2	8	580256	580263	75 %	25 %	0 %	0 %	378448862
11059	NC_016856	TGG	2	6	580268	580273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448862
11060	NC_016856	AGA	2	6	580359	580364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448862
11061	NC_016856	TTA	2	6	580369	580374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448862
11062	NC_016856	ATTA	2	8	580443	580450	50 %	50 %	0 %	0 %	378448862
11063	NC_016856	ATA	2	6	580466	580471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448862
11064	NC_016856	ATTA	2	8	580609	580616	50 %	50 %	0 %	0 %	378448862
11065	NC_016856	ATG	2	6	580652	580657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448862
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11067	NC_016856	TCG	2	6	581097	581102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448863
11068	NC_016856	CGG	2	6	581236	581241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448863
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11071	NC_016856	ATT	2	6	581351	581356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448863
11072	NC_016856	TCA	2	6	581533	581538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448863
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11084	NC_016856	CTT	2	6	582128	582133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448864
11085	NC_016856	CT	3	6	582154	582159	0 %	50 %	0 %	50 %	378448864
11086	NC_016856	A	6	6	582264	582269	100 %	0 %	0 %	0 %	378448864
11087	NC_016856	CAAACC	2	12	582391	582402	50 %	0 %	0 %	50 %	378448864
11088	NC_016856	CG	3	6	582421	582426	0 %	0 %	50 %	50 %	378448864
11089	NC_016856	TTA	2	6	582486	582491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448864
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11093	NC_016856	GGC	2	6	582672	582677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448864
11094	NC_016856	CTT	2	6	582843	582848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448864
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11098	NC_016856	GCAAC	2	10	582997	583006	40 %	0 %	20 %	40 %	378448864
11099	NC_016856	AG	3	6	583131	583136	50 %	0 %	50 %	0 %	378448865
11100	NC_016856	CAG	2	6	583143	583148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448865
11101	NC_016856	TTA	2	6	583167	583172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448865
11102	NC_016856	ATGG	2	8	583223	583230	25 %	25 %	50 %	0 %	378448865
11103	NC_016856	CGG	2	6	583265	583270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448865
11104	NC_016856	T	7	7	583271	583277	0 %	100 %	0 %	0 %	378448865
11105	NC_016856	ATT	2	6	583314	583319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448865
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11107	NC_016856	GCG	3	9	583338	583346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448865
11108	NC_016856	AATG	2	8	583352	583359	50 %	25 %	25 %	0 %	378448865
11109	NC_016856	GGCA	2	8	583364	583371	25 %	0 %	50 %	25 %	410023158
11110	NC_016856	GC	3	6	583426	583431	0 %	0 %	50 %	50 %	410023158
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11362	NC_016856	GACT	2	8	595454	595461	25 %	25 %	25 %	25 %	378448875
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11482	NC_016856	AC	4	8	601286	601293	50 %	0 %	0 %	50 %	378448882
11483	NC_016856	CGC	2	6	601368	601373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448882
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11485	NC_016856	CTG	2	6	601407	601412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448882
11486	NC_016856	TCG	2	6	601418	601423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448882
11487	NC_016856	GCG	2	6	601516	601521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448882
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