MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 91767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016856	CAG	2	6	281744	281749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448552
5502	NC_016856	GC	3	6	281763	281768	0 %	0 %	50 %	50 %	378448552
5503	NC_016856	CGA	2	6	281856	281861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448552
5504	NC_016856	AAT	2	6	281897	281902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448552
5505	NC_016856	GGT	2	6	282013	282018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448553
5506	NC_016856	TAT	2	6	282088	282093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448553
5507	NC_016856	GCCA	2	8	282112	282119	25 %	0 %	25 %	50 %	378448553
5508	NC_016856	GAT	2	6	282133	282138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448553
5509	NC_016856	TCATTA	2	12	282143	282154	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378448553
5510	NC_016856	TCT	2	6	282313	282318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448553
5511	NC_016856	TCG	2	6	282342	282347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448553
5512	NC_016856	ACG	2	6	283236	283241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448554
5513	NC_016856	TCG	2	6	283258	283263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448554
5514	NC_016856	GTC	2	6	283353	283358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448554
5515	NC_016856	GC	4	8	283379	283386	0 %	0 %	50 %	50 %	378448554
5516	NC_016856	AGC	2	6	283521	283526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448554
5517	NC_016856	AGC	2	6	283556	283561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448554
5518	NC_016856	CAA	2	6	283733	283738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448554
5519	NC_016856	AGT	2	6	283775	283780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448554
5520	NC_016856	GGC	2	6	283821	283826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448554
5521	NC_016856	CGAT	2	8	283834	283841	25 %	25 %	25 %	25 %	378448554
5522	NC_016856	ATTA	2	8	283890	283897	50 %	50 %	0 %	0 %	378448554
5523	NC_016856	TCT	2	6	283909	283914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448554
5524	NC_016856	TTCA	2	8	283968	283975	25 %	50 %	0 %	25 %	378448554
5525	NC_016856	CGC	2	6	283985	283990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448554
5526	NC_016856	CAG	2	6	283995	284000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448554
5527	NC_016856	CCA	2	6	284003	284008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448554
5528	NC_016856	CAG	2	6	284040	284045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448554
5529	NC_016856	T	6	6	284057	284062	0 %	100 %	0 %	0 %	378448554
5530	NC_016856	CCA	2	6	284084	284089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448554
5531	NC_016856	CGC	2	6	284142	284147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448554
5532	NC_016856	GC	3	6	284149	284154	0 %	0 %	50 %	50 %	378448554
5533	NC_016856	GCG	2	6	284162	284167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448554
5534	NC_016856	CGC	2	6	284234	284239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448554
5535	NC_016856	GCC	2	6	284274	284279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448554
5536	NC_016856	CG	3	6	284304	284309	0 %	0 %	50 %	50 %	378448554
5537	NC_016856	TCA	2	6	284414	284419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448554
5538	NC_016856	CG	3	6	284426	284431	0 %	0 %	50 %	50 %	378448554
5539	NC_016856	TCA	2	6	284461	284466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448554
5540	NC_016856	GAA	2	6	284487	284492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448554
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5542	NC_016856	GCA	2	6	284603	284608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448554
5543	NC_016856	CT	3	6	284638	284643	0 %	50 %	0 %	50 %	378448554
5544	NC_016856	GGCT	2	8	284655	284662	0 %	25 %	50 %	25 %	378448554
5545	NC_016856	GTT	2	6	284697	284702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448554
5546	NC_016856	CACG	2	8	284711	284718	25 %	0 %	25 %	50 %	378448554
5547	NC_016856	T	6	6	284730	284735	0 %	100 %	0 %	0 %	378448554
5548	NC_016856	TA	3	6	284765	284770	50 %	50 %	0 %	0 %	378448554
5549	NC_016856	ATC	2	6	284791	284796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448554
5550	NC_016856	GC	3	6	284800	284805	0 %	0 %	50 %	50 %	378448554
5551	NC_016856	TGG	2	6	284815	284820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448554
5552	NC_016856	TGT	2	6	284885	284890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448554
5553	NC_016856	AAAT	2	8	285142	285149	75 %	25 %	0 %	0 %	378448555
5554	NC_016856	CGT	2	6	285179	285184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448555
5555	NC_016856	GGC	3	9	285254	285262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448555
5556	NC_016856	CCA	2	6	285304	285309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448555
5557	NC_016856	CCA	2	6	285322	285327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448555
5558	NC_016856	CT	3	6	285357	285362	0 %	50 %	0 %	50 %	378448555
5559	NC_016856	GCC	2	6	285487	285492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448555
5560	NC_016856	GCC	2	6	285494	285499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448555
5561	NC_016856	TGA	2	6	285510	285515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448555
5562	NC_016856	CGC	2	6	285601	285606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448555
5563	NC_016856	GACCA	2	10	285617	285626	40 %	0 %	20 %	40 %	378448555
5564	NC_016856	GCT	2	6	285695	285700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448555
5565	NC_016856	AGC	2	6	285750	285755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448556
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5568	NC_016856	CGC	2	6	285891	285896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448556
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5572	NC_016856	TCA	2	6	286278	286283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448557
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5574	NC_016856	CAA	2	6	286378	286383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448557
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5576	NC_016856	TGA	2	6	286435	286440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448557
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5578	NC_016856	CAA	2	6	286498	286503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448557
5579	NC_016856	GCA	4	12	286591	286602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448557
5580	NC_016856	GGTCG	2	10	286619	286628	0 %	20 %	60 %	20 %	378448557
5581	NC_016856	GATTT	2	10	286671	286680	20 %	60 %	20 %	0 %	378448557
5582	NC_016856	T	7	7	286678	286684	0 %	100 %	0 %	0 %	378448557
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5586	NC_016856	TAAA	2	8	287125	287132	75 %	25 %	0 %	0 %	378448558
5587	NC_016856	TCA	2	6	287163	287168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448558
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5589	NC_016856	ACCAG	2	10	287291	287300	40 %	0 %	20 %	40 %	378448558
5590	NC_016856	GCG	2	6	287340	287345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448558
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5592	NC_016856	CCA	2	6	287406	287411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448558
5593	NC_016856	GGCGC	2	10	287426	287435	0 %	0 %	60 %	40 %	378448558
5594	NC_016856	ATT	2	6	287486	287491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448558
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5599	NC_016856	AG	3	6	287560	287565	50 %	0 %	50 %	0 %	378448558
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5601	NC_016856	CAT	2	6	287713	287718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448558
5602	NC_016856	TCT	2	6	287790	287795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448559
5603	NC_016856	CGTGC	2	10	287798	287807	0 %	20 %	40 %	40 %	378448559
5604	NC_016856	CCG	2	6	287838	287843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448559
5605	NC_016856	GC	3	6	287857	287862	0 %	0 %	50 %	50 %	378448559
5606	NC_016856	ATA	2	6	287865	287870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448559
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5609	NC_016856	AGC	2	6	287907	287912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448559
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5620	NC_016856	GTT	2	6	288543	288548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448559
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5988	NC_016856	CTGC	2	8	313616	313623	0 %	25 %	25 %	50 %	378448582
5989	NC_016856	GC	3	6	313656	313661	0 %	0 %	50 %	50 %	378448582
5990	NC_016856	GGCCG	2	10	313741	313750	0 %	0 %	60 %	40 %	378448582
5991	NC_016856	CGCTGG	2	12	313776	313787	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378448582
5992	NC_016856	CGG	2	6	313801	313806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448582
5993	NC_016856	AGG	2	6	313845	313850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448582
5994	NC_016856	GC	3	6	313875	313880	0 %	0 %	50 %	50 %	378448582
5995	NC_016856	GTG	2	6	313908	313913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448582
5996	NC_016856	TGC	2	6	313953	313958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448582
5997	NC_016856	CGA	2	6	313960	313965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448582
5998	NC_016856	GGA	2	6	314029	314034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448582
5999	NC_016856	CAC	2	6	314080	314085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448582
6000	NC_016856	TCA	2	6	314103	314108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448582

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