MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 91767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016856	GGCGT	2	10	228839	228848	0 %	20 %	60 %	20 %	378448503
4502	NC_016856	TGG	2	6	228891	228896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448503
4503	NC_016856	CCA	2	6	228940	228945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448503
4504	NC_016856	GCG	2	6	229005	229010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448503
4505	NC_016856	TTG	2	6	229058	229063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448503
4506	NC_016856	GGC	2	6	229141	229146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448503
4507	NC_016856	CTG	2	6	229175	229180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448503
4508	NC_016856	GCT	2	6	229225	229230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448503
4509	NC_016856	CTG	2	6	229256	229261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448503
4510	NC_016856	GC	3	6	229262	229267	0 %	0 %	50 %	50 %	378448503
4511	NC_016856	ATGG	2	8	229342	229349	25 %	25 %	50 %	0 %	378448503
4512	NC_016856	GC	3	6	229383	229388	0 %	0 %	50 %	50 %	378448503
4513	NC_016856	GCT	2	6	229390	229395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448503
4514	NC_016856	GCT	2	6	229402	229407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448503
4515	NC_016856	GC	3	6	229428	229433	0 %	0 %	50 %	50 %	378448503
4516	NC_016856	GC	3	6	229503	229508	0 %	0 %	50 %	50 %	378448503
4517	NC_016856	CTG	3	9	229511	229519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448503
4518	NC_016856	CT	3	6	229535	229540	0 %	50 %	0 %	50 %	378448503
4519	NC_016856	GCT	2	6	229582	229587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448503
4520	NC_016856	GAA	2	6	229589	229594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448503
4521	NC_016856	GGC	2	6	229624	229629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448503
4522	NC_016856	GGCG	2	8	229636	229643	0 %	0 %	75 %	25 %	378448503
4523	NC_016856	TGGCGG	2	12	229650	229661	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378448503
4524	NC_016856	ATT	2	6	229667	229672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448503
4525	NC_016856	GTG	2	6	229742	229747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448503
4526	NC_016856	CTGC	2	8	229790	229797	0 %	25 %	25 %	50 %	378448503
4527	NC_016856	GCG	3	9	229811	229819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448503
4528	NC_016856	CTG	2	6	229823	229828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448503
4529	NC_016856	ATT	2	6	229829	229834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448503
4530	NC_016856	GCC	2	6	229841	229846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448503
4531	NC_016856	GCG	2	6	229851	229856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448503
4532	NC_016856	CGC	2	6	229863	229868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448503
4533	NC_016856	TGC	2	6	229914	229919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448503
4534	NC_016856	ATG	2	6	229922	229927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448503
4535	NC_016856	GCG	2	6	229938	229943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448503
4536	NC_016856	CGC	2	6	230063	230068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448503
4537	NC_016856	GCG	2	6	230091	230096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448503
4538	NC_016856	CG	3	6	230101	230106	0 %	0 %	50 %	50 %	378448503
4539	NC_016856	GCT	2	6	230143	230148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448503
4540	NC_016856	GGC	2	6	230155	230160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448503
4541	NC_016856	CGA	2	6	230178	230183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448503
4542	NC_016856	CGG	2	6	230352	230357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448503
4543	NC_016856	GC	3	6	230379	230384	0 %	0 %	50 %	50 %	378448503
4544	NC_016856	A	8	8	230421	230428	100 %	0 %	0 %	0 %	378448503
4545	NC_016856	CAATAT	2	12	230485	230496	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378448504
4546	NC_016856	CTGTC	2	10	230552	230561	0 %	40 %	20 %	40 %	378448504
4547	NC_016856	AAG	2	6	230598	230603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448504
4548	NC_016856	GC	3	6	230647	230652	0 %	0 %	50 %	50 %	378448504
4549	NC_016856	TA	3	6	231005	231010	50 %	50 %	0 %	0 %	378448505
4550	NC_016856	T	7	7	231032	231038	0 %	100 %	0 %	0 %	378448505
4551	NC_016856	T	7	7	231061	231067	0 %	100 %	0 %	0 %	378448505
4552	NC_016856	CTTG	2	8	231079	231086	0 %	50 %	25 %	25 %	378448505
4553	NC_016856	TTTG	2	8	231088	231095	0 %	75 %	25 %	0 %	378448505
4554	NC_016856	T	6	6	231096	231101	0 %	100 %	0 %	0 %	378448505
4555	NC_016856	TAT	2	6	231118	231123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448505
4556	NC_016856	TAAA	2	8	231142	231149	75 %	25 %	0 %	0 %	378448505
4557	NC_016856	CAG	2	6	231368	231373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448506
4558	NC_016856	TGC	2	6	231387	231392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448506
4559	NC_016856	TGC	2	6	231426	231431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448506
4560	NC_016856	CGA	2	6	231501	231506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448506
4561	NC_016856	CAC	2	6	231609	231614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448506
4562	NC_016856	AAG	2	6	231620	231625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448506
4563	NC_016856	CGG	3	9	231696	231704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448506
4564	NC_016856	ACC	2	6	231737	231742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448506
4565	NC_016856	GCG	3	9	231805	231813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448506
4566	NC_016856	CTG	2	6	231854	231859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448506
4567	NC_016856	CCA	2	6	231860	231865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448506
4568	NC_016856	CAG	2	6	231885	231890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448506
4569	NC_016856	A	6	6	232019	232024	100 %	0 %	0 %	0 %	378448507
4570	NC_016856	GTG	2	6	232049	232054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448507
4571	NC_016856	GAT	2	6	232136	232141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448507
4572	NC_016856	TC	3	6	232153	232158	0 %	50 %	0 %	50 %	378448507
4573	NC_016856	ATC	2	6	232197	232202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448507
4574	NC_016856	TTA	2	6	232245	232250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448507
4575	NC_016856	ATA	2	6	232263	232268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448507
4576	NC_016856	GCT	2	6	232315	232320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448507
4577	NC_016856	ATT	2	6	232442	232447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448507
4578	NC_016856	TAT	2	6	232521	232526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448507
4579	NC_016856	ATG	2	6	232566	232571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448507
4580	NC_016856	GGTG	2	8	232606	232613	0 %	25 %	75 %	0 %	378448507
4581	NC_016856	GC	3	6	232636	232641	0 %	0 %	50 %	50 %	378448507
4582	NC_016856	GGCG	2	8	232743	232750	0 %	0 %	75 %	25 %	378448507
4583	NC_016856	GGC	2	6	232829	232834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448507
4584	NC_016856	CGA	2	6	232846	232851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448507
4585	NC_016856	AT	3	6	232890	232895	50 %	50 %	0 %	0 %	378448507
4586	NC_016856	GC	3	6	232904	232909	0 %	0 %	50 %	50 %	378448507
4587	NC_016856	GCGG	2	8	232938	232945	0 %	0 %	75 %	25 %	378448507
4588	NC_016856	GAA	2	6	233033	233038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448507
4589	NC_016856	GGC	2	6	233162	233167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448507
4590	NC_016856	CCT	2	6	233187	233192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448507
4591	NC_016856	CGG	2	6	233221	233226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448507
4592	NC_016856	GCT	2	6	233284	233289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448507
4593	NC_016856	TGA	2	6	233404	233409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448507
4594	NC_016856	GAA	2	6	233450	233455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448507
4595	NC_016856	TGA	2	6	233731	233736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448507
4596	NC_016856	CAA	2	6	233770	233775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448507
4597	NC_016856	ACA	3	9	233811	233819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448507
4598	NC_016856	CG	3	6	233882	233887	0 %	0 %	50 %	50 %	378448507
4599	NC_016856	CTA	2	6	233911	233916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448507
4600	NC_016856	CGG	2	6	233983	233988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448507
4601	NC_016856	GCG	2	6	234003	234008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448507
4602	NC_016856	GCACC	2	10	234037	234046	20 %	0 %	20 %	60 %	378448507
4603	NC_016856	CGG	2	6	234055	234060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448507
4604	NC_016856	GCT	2	6	234067	234072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448507
4605	NC_016856	TA	3	6	234126	234131	50 %	50 %	0 %	0 %	378448507
4606	NC_016856	ACT	2	6	234171	234176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448507
4607	NC_016856	CGC	2	6	234278	234283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448507
4608	NC_016856	A	6	6	234302	234307	100 %	0 %	0 %	0 %	378448507
4609	NC_016856	GGC	2	6	234335	234340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448507
4610	NC_016856	CGC	2	6	234342	234347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448507
4611	NC_016856	ACA	2	6	234366	234371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448507
4612	NC_016856	TGC	2	6	234528	234533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448507
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4614	NC_016856	GCG	2	6	234607	234612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448507
4615	NC_016856	CT	3	6	234638	234643	0 %	50 %	0 %	50 %	378448507
4616	NC_016856	ATG	2	6	234682	234687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448508
4617	NC_016856	TGC	2	6	234719	234724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448508
4618	NC_016856	GGC	2	6	234733	234738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448508
4619	NC_016856	GCC	2	6	234754	234759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448508
4620	NC_016856	TCG	2	6	234905	234910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448508
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4622	NC_016856	CCG	2	6	235033	235038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448508
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4987	NC_016856	GTT	2	6	254392	254397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448526
4988	NC_016856	GGT	2	6	254438	254443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448526
4989	NC_016856	T	6	6	254512	254517	0 %	100 %	0 %	0 %	378448526
4990	NC_016856	GC	3	6	254829	254834	0 %	0 %	50 %	50 %	378448527
4991	NC_016856	AC	3	6	254860	254865	50 %	0 %	0 %	50 %	378448527
4992	NC_016856	AAC	2	6	254898	254903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448527
4993	NC_016856	AC	4	8	254902	254909	50 %	0 %	0 %	50 %	378448527
4994	NC_016856	GC	3	6	255099	255104	0 %	0 %	50 %	50 %	378448528
4995	NC_016856	CAT	2	6	255118	255123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448528
4996	NC_016856	CTGAA	2	10	255165	255174	40 %	20 %	20 %	20 %	378448528
4997	NC_016856	AAGCG	2	10	255229	255238	40 %	0 %	40 %	20 %	378448528
4998	NC_016856	GCT	2	6	255248	255253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448528
4999	NC_016856	TTC	2	6	255269	255274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448528
5000	NC_016856	GCTG	2	8	255285	255292	0 %	25 %	50 %	25 %	378448528

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