MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei 53G plasmid A

Total Repeats: 3565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016833	GCGA	2	8	244	251	25 %	0 %	50 %	25 %	383181733
2	NC_016833	TGC	2	6	314	319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181733
3	NC_016833	CCG	2	6	415	420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181733
4	NC_016833	TTC	2	6	423	428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181733
5	NC_016833	CAA	2	6	433	438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181733
6	NC_016833	GTCA	2	8	499	506	25 %	25 %	25 %	25 %	383181734
7	NC_016833	AAT	2	6	728	733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181734
8	NC_016833	TTG	2	6	774	779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181734
9	NC_016833	TCA	2	6	806	811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181734
10	NC_016833	GAT	2	6	928	933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181734
11	NC_016833	ATA	2	6	1257	1262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181735
12	NC_016833	A	6	6	1271	1276	100 %	0 %	0 %	0 %	383181735
13	NC_016833	TCA	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181735
14	NC_016833	AGC	2	6	1298	1303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181735
15	NC_016833	T	7	7	1309	1315	0 %	100 %	0 %	0 %	383181735
16	NC_016833	GA	3	6	1318	1323	50 %	0 %	50 %	0 %	383181735
17	NC_016833	ATG	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181735
18	NC_016833	TCTA	2	8	1349	1356	25 %	50 %	0 %	25 %	383181735
19	NC_016833	ACA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181735
20	NC_016833	A	6	6	1423	1428	100 %	0 %	0 %	0 %	383181735
21	NC_016833	TAA	2	6	1486	1491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181735
22	NC_016833	ATG	3	9	1495	1503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181735
23	NC_016833	TGC	3	9	1514	1522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181735
24	NC_016833	A	7	7	1535	1541	100 %	0 %	0 %	0 %	383181735
25	NC_016833	TAA	2	6	1583	1588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181735
26	NC_016833	TCA	2	6	1622	1627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181735
27	NC_016833	ACAA	2	8	1658	1665	75 %	0 %	0 %	25 %	383181735
28	NC_016833	CTG	2	6	1771	1776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181735
29	NC_016833	TCTT	2	8	1781	1788	0 %	75 %	0 %	25 %	383181735
30	NC_016833	CT	3	6	1799	1804	0 %	50 %	0 %	50 %	383181735
31	NC_016833	T	7	7	1808	1814	0 %	100 %	0 %	0 %	383181735
32	NC_016833	A	7	7	1844	1850	100 %	0 %	0 %	0 %	383181735
33	NC_016833	CTG	2	6	1969	1974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181735
34	NC_016833	AAG	2	6	1994	1999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181735
35	NC_016833	TAT	2	6	2018	2023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181735
36	NC_016833	TAA	2	6	2024	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181735
37	NC_016833	TCT	2	6	2388	2393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181736
38	NC_016833	T	6	6	2393	2398	0 %	100 %	0 %	0 %	383181736
39	NC_016833	CAA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181736
40	NC_016833	CCG	2	6	2497	2502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181736
41	NC_016833	AGT	2	6	2520	2525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181736
42	NC_016833	CGCT	2	8	2560	2567	0 %	25 %	25 %	50 %	383181736
43	NC_016833	TAC	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181736
44	NC_016833	GTT	2	6	2688	2693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181736
45	NC_016833	TAC	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181736
46	NC_016833	TTAT	2	8	2771	2778	25 %	75 %	0 %	0 %	383181736
47	NC_016833	TTGG	2	8	2855	2862	0 %	50 %	50 %	0 %	383181736
48	NC_016833	GTT	2	6	3007	3012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181736
49	NC_016833	ATA	2	6	3023	3028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181736
50	NC_016833	A	6	6	3061	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	383181736
51	NC_016833	GAA	2	6	3073	3078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181736
52	NC_016833	CAC	2	6	3191	3196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181737
53	NC_016833	GCAGAA	2	12	3250	3261	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383181737
54	NC_016833	TTA	2	6	3267	3272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181737
55	NC_016833	TGC	2	6	3273	3278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181737
56	NC_016833	GAT	2	6	3289	3294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181737
57	NC_016833	T	6	6	3498	3503	0 %	100 %	0 %	0 %	383181738
58	NC_016833	A	6	6	3507	3512	100 %	0 %	0 %	0 %	383181738
59	NC_016833	CATTG	2	10	3539	3548	20 %	40 %	20 %	20 %	383181738
60	NC_016833	T	6	6	3584	3589	0 %	100 %	0 %	0 %	383181738
61	NC_016833	ATT	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181738
62	NC_016833	TAAG	2	8	3655	3662	50 %	25 %	25 %	0 %	383181738
63	NC_016833	CAT	2	6	3670	3675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181738
64	NC_016833	TTG	2	6	3693	3698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181738
65	NC_016833	AAATT	2	10	3735	3744	60 %	40 %	0 %	0 %	383181738
66	NC_016833	TAAA	2	8	3752	3759	75 %	25 %	0 %	0 %	383181738
67	NC_016833	T	6	6	3773	3778	0 %	100 %	0 %	0 %	383181738
68	NC_016833	TGA	2	6	3804	3809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181738
69	NC_016833	T	7	7	3814	3820	0 %	100 %	0 %	0 %	383181738
70	NC_016833	GAT	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181739
71	NC_016833	CA	3	6	4007	4012	50 %	0 %	0 %	50 %	383181739
72	NC_016833	CAG	2	6	4032	4037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181739
73	NC_016833	AGC	2	6	4088	4093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181739
74	NC_016833	AGGA	2	8	4126	4133	50 %	0 %	50 %	0 %	383181739
75	NC_016833	CTG	2	6	4141	4146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181739
76	NC_016833	GCC	2	6	4149	4154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181739
77	NC_016833	GTT	2	6	4164	4169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181739
78	NC_016833	TGC	2	6	4184	4189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181739
79	NC_016833	CTC	2	6	4251	4256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383181739
80	NC_016833	AAG	2	6	4258	4263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181739
81	NC_016833	A	6	6	4283	4288	100 %	0 %	0 %	0 %	383181739
82	NC_016833	TGGA	2	8	4400	4407	25 %	25 %	50 %	0 %	383181740
83	NC_016833	GCC	2	6	4410	4415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181740
84	NC_016833	GTC	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181740
85	NC_016833	TGA	2	6	4429	4434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181740
86	NC_016833	TCG	2	6	4492	4497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181740
87	NC_016833	CTG	2	6	4608	4613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181740
88	NC_016833	GAAA	2	8	4654	4661	75 %	0 %	25 %	0 %	383181740
89	NC_016833	CTG	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181740
90	NC_016833	GA	4	8	4710	4717	50 %	0 %	50 %	0 %	383181740
91	NC_016833	CTG	2	6	4741	4746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181740
92	NC_016833	GCACT	2	10	4757	4766	20 %	20 %	20 %	40 %	383181740
93	NC_016833	CGG	2	6	4780	4785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181740
94	NC_016833	CGC	2	6	4832	4837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181740
95	NC_016833	CGT	2	6	4854	4859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181740
96	NC_016833	AGTGG	2	10	4864	4873	20 %	20 %	60 %	0 %	383181740
97	NC_016833	GAA	2	6	4945	4950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181740
98	NC_016833	CGG	2	6	4953	4958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181740
99	NC_016833	AG	3	6	4987	4992	50 %	0 %	50 %	0 %	383181740
100	NC_016833	GCA	2	6	5054	5059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181740
101	NC_016833	TCGC	2	8	5122	5129	0 %	25 %	25 %	50 %	383181740
102	NC_016833	A	6	6	5677	5682	100 %	0 %	0 %	0 %	383181741
103	NC_016833	TATT	2	8	5693	5700	25 %	75 %	0 %	0 %	383181741
104	NC_016833	T	7	7	5714	5720	0 %	100 %	0 %	0 %	383181741
105	NC_016833	TCT	2	6	5723	5728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181741
106	NC_016833	TAT	2	6	5775	5780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181741
107	NC_016833	TAC	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181741
108	NC_016833	TTA	2	6	5851	5856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181741
109	NC_016833	T	6	6	5902	5907	0 %	100 %	0 %	0 %	383181741
110	NC_016833	T	6	6	5986	5991	0 %	100 %	0 %	0 %	383181741
111	NC_016833	ATA	2	6	5996	6001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181741
112	NC_016833	TA	3	6	6009	6014	50 %	50 %	0 %	0 %	383181741
113	NC_016833	G	6	6	6025	6030	0 %	0 %	100 %	0 %	383181741
114	NC_016833	TG	3	6	6069	6074	0 %	50 %	50 %	0 %	383181741
115	NC_016833	AAC	2	6	6094	6099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181741
116	NC_016833	AAT	2	6	6115	6120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181741
117	NC_016833	ACT	2	6	6135	6140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181741
118	NC_016833	TTA	2	6	6151	6156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181741
119	NC_016833	TGCAA	2	10	6199	6208	40 %	20 %	20 %	20 %	383181741
120	NC_016833	A	6	6	6207	6212	100 %	0 %	0 %	0 %	383181741
121	NC_016833	GCA	2	6	6373	6378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181741
122	NC_016833	AAT	2	6	6441	6446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181741
123	NC_016833	TA	3	6	6471	6476	50 %	50 %	0 %	0 %	383181741
124	NC_016833	ATA	2	6	6572	6577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181741
125	NC_016833	AT	3	6	6606	6611	50 %	50 %	0 %	0 %	383181741
126	NC_016833	TGTT	2	8	6653	6660	0 %	75 %	25 %	0 %	383181741
127	NC_016833	ATC	2	6	6732	6737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181741
128	NC_016833	A	7	7	6738	6744	100 %	0 %	0 %	0 %	383181741
129	NC_016833	AAC	2	6	6837	6842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181741
130	NC_016833	TGG	2	6	6892	6897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181741
131	NC_016833	T	8	8	6937	6944	0 %	100 %	0 %	0 %	383181741
132	NC_016833	A	8	8	6953	6960	100 %	0 %	0 %	0 %	383181741
133	NC_016833	TAA	2	6	6965	6970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181741
134	NC_016833	AAAT	2	8	6997	7004	75 %	25 %	0 %	0 %	383181741
135	NC_016833	T	6	6	7034	7039	0 %	100 %	0 %	0 %	383181741
136	NC_016833	ACAT	2	8	7044	7051	50 %	25 %	0 %	25 %	383181741
137	NC_016833	T	6	6	7051	7056	0 %	100 %	0 %	0 %	383181741
138	NC_016833	AAG	2	6	7077	7082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181741
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140	NC_016833	ATA	2	6	7276	7281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181741
141	NC_016833	TAT	2	6	7298	7303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181741
142	NC_016833	T	6	6	7336	7341	0 %	100 %	0 %	0 %	383181741
143	NC_016833	TTTA	2	8	7368	7375	25 %	75 %	0 %	0 %	383181741
144	NC_016833	ATC	2	6	7821	7826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181742
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147	NC_016833	CTGAT	2	10	8051	8060	20 %	40 %	20 %	20 %	383181742
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153	NC_016833	AT	3	6	8419	8424	50 %	50 %	0 %	0 %	383181742
154	NC_016833	T	6	6	8520	8525	0 %	100 %	0 %	0 %	383181742
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159	NC_016833	TGCTG	2	10	9044	9053	0 %	40 %	40 %	20 %	383181743
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266	NC_016833	GTT	2	6	16733	16738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181753
267	NC_016833	TCA	2	6	16790	16795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181753
268	NC_016833	CAT	2	6	17114	17119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181754
269	NC_016833	AAT	2	6	17175	17180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181754
270	NC_016833	TAA	2	6	17235	17240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181754
271	NC_016833	ATC	2	6	17331	17336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181754
272	NC_016833	AAAT	2	8	17342	17349	75 %	25 %	0 %	0 %	383181754
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275	NC_016833	GGT	2	6	17436	17441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181754
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280	NC_016833	AT	3	6	17715	17720	50 %	50 %	0 %	0 %	383181754
281	NC_016833	TGA	2	6	17782	17787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181754
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283	NC_016833	AAC	2	6	18128	18133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181755
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299	NC_016833	CAC	2	6	19148	19153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181757
300	NC_016833	GGC	2	6	19199	19204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181757
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394	NC_016833	TGA	2	6	26976	26981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181764
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