MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei 53G plasmid A

Total Repeats: 3565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016833	CCG	2	6	153974	153979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181917
2502	NC_016833	GCA	2	6	154019	154024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181917
2503	NC_016833	CACG	2	8	154033	154040	25 %	0 %	25 %	50 %	383181917
2504	NC_016833	CTGT	2	8	154251	154258	0 %	50 %	25 %	25 %	383181918
2505	NC_016833	CTT	2	6	154337	154342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181918
2506	NC_016833	TACT	2	8	154371	154378	25 %	50 %	0 %	25 %	383181918
2507	NC_016833	GGT	2	6	154405	154410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181918
2508	NC_016833	A	7	7	154411	154417	100 %	0 %	0 %	0 %	383181918
2509	NC_016833	CGG	2	6	154424	154429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181918
2510	NC_016833	T	7	7	154509	154515	0 %	100 %	0 %	0 %	383181919
2511	NC_016833	TC	3	6	154610	154615	0 %	50 %	0 %	50 %	383181919
2512	NC_016833	TTGCC	2	10	154617	154626	0 %	40 %	20 %	40 %	383181919
2513	NC_016833	ATG	2	6	154672	154677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181919
2514	NC_016833	TTG	2	6	154688	154693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181919
2515	NC_016833	CAT	2	6	154746	154751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181919
2516	NC_016833	CCG	2	6	154827	154832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181919
2517	NC_016833	ACGCC	2	10	154865	154874	20 %	0 %	20 %	60 %	383181919
2518	NC_016833	CTG	2	6	154900	154905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181919
2519	NC_016833	GT	3	6	154916	154921	0 %	50 %	50 %	0 %	383181919
2520	NC_016833	CTG	2	6	155041	155046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181919
2521	NC_016833	GAA	2	6	155070	155075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181919
2522	NC_016833	TTA	2	6	155148	155153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181919
2523	NC_016833	GAT	2	6	155205	155210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181919
2524	NC_016833	ATC	2	6	155264	155269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181919
2525	NC_016833	A	6	6	155301	155306	100 %	0 %	0 %	0 %	383181919
2526	NC_016833	CTG	2	6	155341	155346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181919
2527	NC_016833	CTG	2	6	155377	155382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181919
2528	NC_016833	GACG	2	8	155391	155398	25 %	0 %	50 %	25 %	383181919
2529	NC_016833	GGA	2	6	155413	155418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383181919
2530	NC_016833	GAT	2	6	155583	155588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181919
2531	NC_016833	TGA	2	6	155657	155662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181919
2532	NC_016833	TGA	2	6	155669	155674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181919
2533	NC_016833	CGA	2	6	155753	155758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181919
2534	NC_016833	CAGT	2	8	155830	155837	25 %	25 %	25 %	25 %	383181919
2535	NC_016833	ACTG	2	8	155844	155851	25 %	25 %	25 %	25 %	383181919
2536	NC_016833	GCC	2	6	155860	155865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181920
2537	NC_016833	T	7	7	155873	155879	0 %	100 %	0 %	0 %	383181920
2538	NC_016833	ACC	2	6	155880	155885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181920
2539	NC_016833	AGTA	2	8	155912	155919	50 %	25 %	25 %	0 %	383181920
2540	NC_016833	AAG	2	6	155948	155953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181920
2541	NC_016833	AGCG	2	8	156016	156023	25 %	0 %	50 %	25 %	383181920
2542	NC_016833	GTG	2	6	156046	156051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181920
2543	NC_016833	GCG	2	6	156055	156060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181920
2544	NC_016833	CTG	2	6	156294	156299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181921
2545	NC_016833	ACG	2	6	156419	156424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181922
2546	NC_016833	C	7	7	156428	156434	0 %	0 %	0 %	100 %	383181922
2547	NC_016833	CTT	2	6	156476	156481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181922
2548	NC_016833	CG	3	6	156575	156580	0 %	0 %	50 %	50 %	383181922
2549	NC_016833	CA	3	6	156582	156587	50 %	0 %	0 %	50 %	383181922
2550	NC_016833	T	6	6	156654	156659	0 %	100 %	0 %	0 %	383181922
2551	NC_016833	GA	3	6	156691	156696	50 %	0 %	50 %	0 %	383181922
2552	NC_016833	GCTG	2	8	156697	156704	0 %	25 %	50 %	25 %	383181922
2553	NC_016833	GCG	2	6	156725	156730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181922
2554	NC_016833	GCA	2	6	156736	156741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181922
2555	NC_016833	CA	3	6	156761	156766	50 %	0 %	0 %	50 %	383181922
2556	NC_016833	A	7	7	156799	156805	100 %	0 %	0 %	0 %	383181922
2557	NC_016833	TGA	2	6	156886	156891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181922
2558	NC_016833	CAG	2	6	156929	156934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181922
2559	NC_016833	CCG	2	6	156982	156987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181922
2560	NC_016833	TGA	2	6	156999	157004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181922
2561	NC_016833	GCC	2	6	157008	157013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181922
2562	NC_016833	CAC	2	6	157045	157050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181922
2563	NC_016833	CAG	2	6	157055	157060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181922
2564	NC_016833	GCT	2	6	157092	157097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181922
2565	NC_016833	CCTGCT	2	12	157447	157458	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383181922
2566	NC_016833	TCA	2	6	157497	157502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181922
2567	NC_016833	CTG	2	6	157583	157588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181922
2568	NC_016833	CAA	2	6	157591	157596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181922
2569	NC_016833	TG	3	6	157606	157611	0 %	50 %	50 %	0 %	383181922
2570	NC_016833	A	6	6	157646	157651	100 %	0 %	0 %	0 %	383181922
2571	NC_016833	CCTG	2	8	157675	157682	0 %	25 %	25 %	50 %	383181922
2572	NC_016833	ATC	2	6	157745	157750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181922
2573	NC_016833	TGCC	2	8	157754	157761	0 %	25 %	25 %	50 %	383181922
2574	NC_016833	CCT	2	6	157816	157821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383181922
2575	NC_016833	GCG	2	6	157837	157842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181922
2576	NC_016833	GTC	2	6	157952	157957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181922
2577	NC_016833	CAGTG	2	10	158066	158075	20 %	20 %	40 %	20 %	383181922
2578	NC_016833	GTG	2	6	158078	158083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181922
2579	NC_016833	TGC	2	6	158136	158141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181922
2580	NC_016833	CAC	2	6	158206	158211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181922
2581	NC_016833	CAGTTG	2	12	158252	158263	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383181922
2582	NC_016833	TCA	2	6	158286	158291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181922
2583	NC_016833	CAT	2	6	158302	158307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181922
2584	NC_016833	TGA	2	6	158334	158339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181922
2585	NC_016833	TCC	2	6	158421	158426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383181922
2586	NC_016833	CTC	2	6	158522	158527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383181922
2587	NC_016833	GCG	2	6	158553	158558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181922
2588	NC_016833	GAAA	2	8	158652	158659	75 %	0 %	25 %	0 %	383181922
2589	NC_016833	AG	3	6	158701	158706	50 %	0 %	50 %	0 %	383181922
2590	NC_016833	CCA	2	6	158719	158724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181922
2591	NC_016833	CAG	2	6	158758	158763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181922
2592	NC_016833	T	6	6	158773	158778	0 %	100 %	0 %	0 %	383181922
2593	NC_016833	CCG	2	6	158806	158811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181922
2594	NC_016833	CAA	2	6	158815	158820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181922
2595	NC_016833	CTG	2	6	158852	158857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181922
2596	NC_016833	ATC	3	9	158858	158866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181922
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2598	NC_016833	TCA	2	6	158982	158987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181922
2599	NC_016833	CAC	2	6	158990	158995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181922
2600	NC_016833	GAA	2	6	159004	159009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181922
2601	NC_016833	AT	3	6	159039	159044	50 %	50 %	0 %	0 %	383181922
2602	NC_016833	T	6	6	159194	159199	0 %	100 %	0 %	0 %	383181922
2603	NC_016833	TAA	2	6	159631	159636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181923
2604	NC_016833	CCG	2	6	159772	159777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181923
2605	NC_016833	AT	3	6	159880	159885	50 %	50 %	0 %	0 %	383181923
2606	NC_016833	A	7	7	159887	159893	100 %	0 %	0 %	0 %	383181923
2607	NC_016833	CGG	2	6	160115	160120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181924
2608	NC_016833	CAT	2	6	160147	160152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181924
2609	NC_016833	CTG	2	6	160268	160273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181924
2610	NC_016833	CA	3	6	160336	160341	50 %	0 %	0 %	50 %	383181924
2611	NC_016833	CCA	2	6	160489	160494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181924
2612	NC_016833	TAA	2	6	160657	160662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181924
2613	NC_016833	CGT	2	6	160721	160726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181924
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2616	NC_016833	A	7	7	160791	160797	100 %	0 %	0 %	0 %	383181924
2617	NC_016833	ATC	2	6	161118	161123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181925
2618	NC_016833	GTCA	2	8	161126	161133	25 %	25 %	25 %	25 %	383181925
2619	NC_016833	AAATG	2	10	161178	161187	60 %	20 %	20 %	0 %	383181925
2620	NC_016833	AAC	2	6	161198	161203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181925
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2989	NC_016833	AGG	2	6	182618	182623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383181947
2990	NC_016833	CGTT	2	8	182846	182853	0 %	50 %	25 %	25 %	383181948
2991	NC_016833	TTG	2	6	182859	182864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181948
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2993	NC_016833	GAT	2	6	182879	182884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181948
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2997	NC_016833	CTG	2	6	182987	182992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181948
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3000	NC_016833	CAGA	2	8	183304	183311	50 %	0 %	25 %	25 %	383181949

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