MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei 53G plasmid A

Total Repeats: 3565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_016833	GGT	2	6	117738	117743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181870
2002	NC_016833	CTG	2	6	117802	117807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181870
2003	NC_016833	A	6	6	117817	117822	100 %	0 %	0 %	0 %	383181870
2004	NC_016833	CTG	2	6	117901	117906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181870
2005	NC_016833	TCA	2	6	117909	117914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181870
2006	NC_016833	AAC	2	6	117953	117958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181870
2007	NC_016833	CTA	2	6	118002	118007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181870
2008	NC_016833	AAAC	2	8	118048	118055	75 %	0 %	0 %	25 %	383181871
2009	NC_016833	ACG	2	6	118122	118127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181871
2010	NC_016833	CTG	2	6	118154	118159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181871
2011	NC_016833	TGA	2	6	118162	118167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181871
2012	NC_016833	A	6	6	118210	118215	100 %	0 %	0 %	0 %	383181871
2013	NC_016833	TGCC	2	8	118216	118223	0 %	25 %	25 %	50 %	383181871
2014	NC_016833	CTG	2	6	118298	118303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181871
2015	NC_016833	A	6	6	118506	118511	100 %	0 %	0 %	0 %	383181871
2016	NC_016833	AGC	2	6	118607	118612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181871
2017	NC_016833	CAA	2	6	118668	118673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181871
2018	NC_016833	CAG	2	6	118674	118679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181871
2019	NC_016833	CA	3	6	118710	118715	50 %	0 %	0 %	50 %	383181871
2020	NC_016833	AGC	2	6	118766	118771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181871
2021	NC_016833	A	6	6	118773	118778	100 %	0 %	0 %	0 %	383181871
2022	NC_016833	TGG	2	6	119122	119127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181872
2023	NC_016833	GCC	2	6	119227	119232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181872
2024	NC_016833	GTG	2	6	119285	119290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181872
2025	NC_016833	GCC	2	6	119320	119325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181872
2026	NC_016833	CTG	2	6	119358	119363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181872
2027	NC_016833	CCG	2	6	119382	119387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181872
2028	NC_016833	GGA	2	6	119524	119529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383181873
2029	NC_016833	CTGC	2	8	119542	119549	0 %	25 %	25 %	50 %	383181873
2030	NC_016833	TGC	2	6	119622	119627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181873
2031	NC_016833	TGC	2	6	119632	119637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181873
2032	NC_016833	GCA	2	6	119685	119690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181873
2033	NC_016833	T	7	7	119755	119761	0 %	100 %	0 %	0 %	383181873
2034	NC_016833	ATTC	2	8	122116	122123	25 %	50 %	0 %	25 %	383181874
2035	NC_016833	TTC	2	6	122126	122131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181874
2036	NC_016833	T	6	6	122133	122138	0 %	100 %	0 %	0 %	383181874
2037	NC_016833	T	6	6	122195	122200	0 %	100 %	0 %	0 %	383181874
2038	NC_016833	GCC	2	6	122271	122276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181874
2039	NC_016833	TTC	2	6	122290	122295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181875
2040	NC_016833	TCG	2	6	122320	122325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181875
2041	NC_016833	GCT	2	6	122398	122403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181875
2042	NC_016833	TGC	2	6	122428	122433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181875
2043	NC_016833	CAG	2	6	122623	122628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181876
2044	NC_016833	TTC	2	6	122729	122734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181876
2045	NC_016833	GCC	2	6	122756	122761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181876
2046	NC_016833	CCTG	2	8	122895	122902	0 %	25 %	25 %	50 %	383181876
2047	NC_016833	CAC	2	6	123244	123249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181877
2048	NC_016833	A	6	6	123368	123373	100 %	0 %	0 %	0 %	383181877
2049	NC_016833	CTG	2	6	123382	123387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181878
2050	NC_016833	CAT	2	6	123478	123483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181878
2051	NC_016833	GAA	2	6	123525	123530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181878
2052	NC_016833	GTT	2	6	123594	123599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181878
2053	NC_016833	TTAC	2	8	123782	123789	25 %	50 %	0 %	25 %	383181878
2054	NC_016833	AG	3	6	123911	123916	50 %	0 %	50 %	0 %	383181879
2055	NC_016833	CAG	2	6	123944	123949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181879
2056	NC_016833	TCG	2	6	123960	123965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181879
2057	NC_016833	ACGG	2	8	123994	124001	25 %	0 %	50 %	25 %	383181879
2058	NC_016833	GCCA	2	8	124030	124037	25 %	0 %	25 %	50 %	383181879
2059	NC_016833	TGC	2	6	124173	124178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181879
2060	NC_016833	TAC	2	6	124181	124186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181879
2061	NC_016833	CGTC	2	8	124208	124215	0 %	25 %	25 %	50 %	383181879
2062	NC_016833	CGC	2	6	124360	124365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181879
2063	NC_016833	GGT	2	6	124424	124429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181879
2064	NC_016833	TG	3	6	124430	124435	0 %	50 %	50 %	0 %	383181879
2065	NC_016833	GAA	2	6	124474	124479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181879
2066	NC_016833	AAC	2	6	124481	124486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181879
2067	NC_016833	GCTG	2	8	124519	124526	0 %	25 %	50 %	25 %	383181879
2068	NC_016833	AAGGT	2	10	124578	124587	40 %	20 %	40 %	0 %	383181879
2069	NC_016833	CTT	2	6	124618	124623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181879
2070	NC_016833	TCAA	2	8	124659	124666	50 %	25 %	0 %	25 %	383181879
2071	NC_016833	TGG	2	6	124843	124848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181879
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2073	NC_016833	TGG	2	6	124944	124949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181879
2074	NC_016833	CTGG	2	8	124977	124984	0 %	25 %	50 %	25 %	383181879
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2076	NC_016833	GTCA	2	8	125024	125031	25 %	25 %	25 %	25 %	383181879
2077	NC_016833	GAG	2	6	125060	125065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383181879
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2082	NC_016833	CAG	2	6	125200	125205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181880
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2084	NC_016833	CTGG	2	8	125335	125342	0 %	25 %	50 %	25 %	383181880
2085	NC_016833	CTG	2	6	125377	125382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181880
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2089	NC_016833	TTC	2	6	125611	125616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181880
2090	NC_016833	CAT	2	6	125649	125654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181880
2091	NC_016833	CAAA	2	8	125663	125670	75 %	0 %	0 %	25 %	383181880
2092	NC_016833	GCT	2	6	125733	125738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181880
2093	NC_016833	GA	3	6	125768	125773	50 %	0 %	50 %	0 %	383181880
2094	NC_016833	TGA	3	9	125835	125843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181880
2095	NC_016833	TGG	2	6	125846	125851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181880
2096	NC_016833	TCA	2	6	125958	125963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181881
2097	NC_016833	GTAT	2	8	126103	126110	25 %	50 %	25 %	0 %	383181881
2098	NC_016833	AC	3	6	126120	126125	50 %	0 %	0 %	50 %	383181881
2099	NC_016833	GTGG	2	8	126283	126290	0 %	25 %	75 %	0 %	383181881
2100	NC_016833	CGA	2	6	126305	126310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181881
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2102	NC_016833	GCAGAA	2	12	126341	126352	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383181881
2103	NC_016833	TTA	2	6	126358	126363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181881
2104	NC_016833	GAT	2	6	126380	126385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181881
2105	NC_016833	CCA	2	6	126456	126461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181882
2106	NC_016833	GTT	2	6	126471	126476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181882
2107	NC_016833	GC	3	6	126532	126537	0 %	0 %	50 %	50 %	383181882
2108	NC_016833	TA	3	6	126544	126549	50 %	50 %	0 %	0 %	383181882
2109	NC_016833	A	6	6	126596	126601	100 %	0 %	0 %	0 %	383181882
2110	NC_016833	GAA	2	6	126607	126612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181882
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2116	NC_016833	TGT	2	6	127102	127107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181883
2117	NC_016833	GGC	2	6	127147	127152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181883
2118	NC_016833	GCT	2	6	127165	127170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181883
2119	NC_016833	CCAG	2	8	127174	127181	25 %	0 %	25 %	50 %	383181883
2120	NC_016833	CTG	2	6	127199	127204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181883
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2367	NC_016833	AC	3	6	144244	144249	50 %	0 %	0 %	50 %	383181901
2368	NC_016833	GTT	2	6	144286	144291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181901
2369	NC_016833	TGC	2	6	144299	144304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181901
2370	NC_016833	TCA	2	6	144322	144327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181901
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2484	NC_016833	CA	3	6	153147	153152	50 %	0 %	0 %	50 %	383181915
2485	NC_016833	TG	3	6	153174	153179	0 %	50 %	50 %	0 %	383181915
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2489	NC_016833	GTT	2	6	153477	153482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181916
2490	NC_016833	TGC	2	6	153514	153519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181916
2491	NC_016833	ATA	2	6	153568	153573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181916
2492	NC_016833	AG	3	6	153575	153580	50 %	0 %	50 %	0 %	383181916
2493	NC_016833	TGAGT	2	10	153611	153620	20 %	40 %	40 %	0 %	383181916
2494	NC_016833	AAAG	2	8	153663	153670	75 %	0 %	25 %	0 %	383181916
2495	NC_016833	A	6	6	153729	153734	100 %	0 %	0 %	0 %	383181916
2496	NC_016833	CGAC	2	8	153749	153756	25 %	0 %	25 %	50 %	383181916
2497	NC_016833	TTA	2	6	153789	153794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181916
2498	NC_016833	GCA	2	6	153934	153939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181917
2499	NC_016833	CAA	2	6	153955	153960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181917
2500	NC_016833	ACC	2	6	153961	153966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181917

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