MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei 53G plasmid A

Total Repeats: 3565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016833	TAA	2	6	95573	95578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181843
1502	NC_016833	TAA	2	6	95581	95586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181843
1503	NC_016833	TAAAAA	2	12	95615	95626	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383181843
1504	NC_016833	ATT	2	6	95662	95667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181843
1505	NC_016833	ATA	2	6	95671	95676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181843
1506	NC_016833	CAA	2	6	95693	95698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181843
1507	NC_016833	TCA	2	6	95708	95713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181843
1508	NC_016833	AT	3	6	95773	95778	50 %	50 %	0 %	0 %	383181843
1509	NC_016833	TGT	2	6	95808	95813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181843
1510	NC_016833	GA	4	8	95822	95829	50 %	0 %	50 %	0 %	383181843
1511	NC_016833	GTG	2	6	95862	95867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181843
1512	NC_016833	T	6	6	95887	95892	0 %	100 %	0 %	0 %	383181843
1513	NC_016833	A	8	8	95931	95938	100 %	0 %	0 %	0 %	383181843
1514	NC_016833	TGC	2	6	95957	95962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181843
1515	NC_016833	TAA	2	6	95966	95971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181843
1516	NC_016833	GAG	2	6	95976	95981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383181843
1517	NC_016833	GCA	2	6	95991	95996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181843
1518	NC_016833	TA	3	6	95998	96003	50 %	50 %	0 %	0 %	383181843
1519	NC_016833	TTA	2	6	96015	96020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181843
1520	NC_016833	CTTCT	2	10	96067	96076	0 %	60 %	0 %	40 %	383181843
1521	NC_016833	GAGAG	2	10	96100	96109	40 %	0 %	60 %	0 %	383181843
1522	NC_016833	G	6	6	96157	96162	0 %	0 %	100 %	0 %	383181843
1523	NC_016833	ATT	2	6	96173	96178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181843
1524	NC_016833	TCT	2	6	96197	96202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181843
1525	NC_016833	AAG	2	6	96205	96210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181843
1526	NC_016833	GTG	2	6	96228	96233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181843
1527	NC_016833	GGA	2	6	96283	96288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383181843
1528	NC_016833	ATG	2	6	96304	96309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181843
1529	NC_016833	TTG	2	6	96324	96329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181843
1530	NC_016833	A	7	7	96385	96391	100 %	0 %	0 %	0 %	383181843
1531	NC_016833	CCA	2	6	96393	96398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181843
1532	NC_016833	ATG	2	6	96406	96411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181843
1533	NC_016833	AT	3	6	96414	96419	50 %	50 %	0 %	0 %	383181843
1534	NC_016833	AAG	2	6	96450	96455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181843
1535	NC_016833	A	7	7	96460	96466	100 %	0 %	0 %	0 %	383181843
1536	NC_016833	ATA	2	6	96600	96605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181843
1537	NC_016833	AGA	2	6	96656	96661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181843
1538	NC_016833	ATT	2	6	96668	96673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181843
1539	NC_016833	CTA	2	6	96676	96681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181843
1540	NC_016833	A	6	6	96750	96755	100 %	0 %	0 %	0 %	383181843
1541	NC_016833	AT	3	6	96854	96859	50 %	50 %	0 %	0 %	383181844
1542	NC_016833	GAT	2	6	96915	96920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181844
1543	NC_016833	TGA	3	9	96935	96943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181844
1544	NC_016833	AT	4	8	96951	96958	50 %	50 %	0 %	0 %	383181844
1545	NC_016833	AAG	2	6	96964	96969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181844
1546	NC_016833	TAT	2	6	96985	96990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181844
1547	NC_016833	TA	3	6	97028	97033	50 %	50 %	0 %	0 %	383181844
1548	NC_016833	TGA	3	9	97076	97084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181844
1549	NC_016833	ATATT	2	10	97157	97166	40 %	60 %	0 %	0 %	383181844
1550	NC_016833	GAA	2	6	97201	97206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181844
1551	NC_016833	TATT	2	8	97233	97240	25 %	75 %	0 %	0 %	383181845
1552	NC_016833	TTG	2	6	97276	97281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181845
1553	NC_016833	TAA	2	6	97354	97359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181845
1554	NC_016833	TAA	2	6	97375	97380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181845
1555	NC_016833	AAAT	2	8	97410	97417	75 %	25 %	0 %	0 %	383181845
1556	NC_016833	GCA	2	6	97499	97504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181845
1557	NC_016833	TTA	2	6	97508	97513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181845
1558	NC_016833	ATG	3	9	97523	97531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181845
1559	NC_016833	GAAAAA	2	12	97582	97593	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383181845
1560	NC_016833	AGC	2	6	97642	97647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181845
1561	NC_016833	AG	3	6	97648	97653	50 %	0 %	50 %	0 %	383181845
1562	NC_016833	AAT	2	6	97661	97666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181845
1563	NC_016833	TTA	2	6	97726	97731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181846
1564	NC_016833	TAT	2	6	97771	97776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181846
1565	NC_016833	CGGA	2	8	97797	97804	25 %	0 %	50 %	25 %	383181846
1566	NC_016833	ATT	2	6	97849	97854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181846
1567	NC_016833	ATTT	2	8	97885	97892	25 %	75 %	0 %	0 %	383181846
1568	NC_016833	ATA	2	6	97907	97912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181846
1569	NC_016833	TGA	2	6	97926	97931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181846
1570	NC_016833	GAGG	2	8	98010	98017	25 %	0 %	75 %	0 %	383181846
1571	NC_016833	T	8	8	98068	98075	0 %	100 %	0 %	0 %	383181846
1572	NC_016833	TTG	2	6	98087	98092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181846
1573	NC_016833	T	6	6	98105	98110	0 %	100 %	0 %	0 %	383181846
1574	NC_016833	CT	3	6	98113	98118	0 %	50 %	0 %	50 %	383181846
1575	NC_016833	AAAG	2	8	98121	98128	75 %	0 %	25 %	0 %	383181846
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1578	NC_016833	TAAA	2	8	98249	98256	75 %	25 %	0 %	0 %	383181846
1579	NC_016833	AT	3	6	98277	98282	50 %	50 %	0 %	0 %	383181846
1580	NC_016833	CAAA	2	8	98291	98298	75 %	0 %	0 %	25 %	383181846
1581	NC_016833	AAAT	2	8	98300	98307	75 %	25 %	0 %	0 %	383181846
1582	NC_016833	CAA	2	6	98314	98319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181846
1583	NC_016833	ATCA	2	8	98323	98330	50 %	25 %	0 %	25 %	383181846
1584	NC_016833	AGTG	2	8	98367	98374	25 %	25 %	50 %	0 %	383181846
1585	NC_016833	AAAG	2	8	98404	98411	75 %	0 %	25 %	0 %	383181846
1586	NC_016833	TTG	2	6	98459	98464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181846
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1588	NC_016833	ATA	2	6	98579	98584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181846
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1590	NC_016833	AT	4	8	98663	98670	50 %	50 %	0 %	0 %	383181846
1591	NC_016833	GAT	3	9	98707	98715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181846
1592	NC_016833	T	8	8	98779	98786	0 %	100 %	0 %	0 %	383181846
1593	NC_016833	ATG	2	6	98829	98834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181847
1594	NC_016833	TGA	2	6	98866	98871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181847
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1596	NC_016833	TA	3	6	98985	98990	50 %	50 %	0 %	0 %	383181847
1597	NC_016833	TGC	2	6	99034	99039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181847
1598	NC_016833	ATT	2	6	99041	99046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181847
1599	NC_016833	ATA	2	6	99058	99063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181847
1600	NC_016833	CGT	2	6	99157	99162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181848
1601	NC_016833	AAT	2	6	99214	99219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181848
1602	NC_016833	GAC	2	6	99274	99279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181848
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1604	NC_016833	TTA	2	6	99353	99358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181848
1605	NC_016833	TTTTA	2	10	99390	99399	20 %	80 %	0 %	0 %	383181849
1606	NC_016833	TTG	2	6	99403	99408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181849
1607	NC_016833	ATA	2	6	99478	99483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181849
1608	NC_016833	ATA	2	6	99500	99505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181849
1609	NC_016833	TTGAT	2	10	99581	99590	20 %	60 %	20 %	0 %	383181849
1610	NC_016833	GA	3	6	99616	99621	50 %	0 %	50 %	0 %	383181849
1611	NC_016833	TCT	2	6	99661	99666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181849
1612	NC_016833	TA	3	6	99689	99694	50 %	50 %	0 %	0 %	383181849
1613	NC_016833	TGG	2	6	99735	99740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181849
1614	NC_016833	GAA	2	6	99778	99783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181849
1615	NC_016833	A	7	7	99782	99788	100 %	0 %	0 %	0 %	383181849
1616	NC_016833	AT	3	6	99809	99814	50 %	50 %	0 %	0 %	383181849
1617	NC_016833	TA	3	6	99825	99830	50 %	50 %	0 %	0 %	383181849
1618	NC_016833	TTAG	2	8	99856	99863	25 %	50 %	25 %	0 %	383181849
1619	NC_016833	AT	3	6	99914	99919	50 %	50 %	0 %	0 %	383181849
1620	NC_016833	AGA	2	6	99939	99944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181849
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1622	NC_016833	GGT	2	6	100073	100078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181849
1623	NC_016833	ATGG	2	8	100104	100111	25 %	25 %	50 %	0 %	383181850
1624	NC_016833	A	6	6	100119	100124	100 %	0 %	0 %	0 %	383181850
1625	NC_016833	AAT	2	6	100133	100138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181850
1626	NC_016833	TA	3	6	100155	100160	50 %	50 %	0 %	0 %	383181850
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