MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei 53G plasmid A

Total Repeats: 3565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016833	GGAT	2	8	35256	35263	25 %	25 %	50 %	0 %	383181774
502	NC_016833	TG	3	6	35343	35348	0 %	50 %	50 %	0 %	383181774
503	NC_016833	CCG	2	6	35365	35370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181774
504	NC_016833	GAA	2	6	35401	35406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181774
505	NC_016833	CG	3	6	35410	35415	0 %	0 %	50 %	50 %	383181774
506	NC_016833	CTG	2	6	35426	35431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181774
507	NC_016833	T	6	6	35710	35715	0 %	100 %	0 %	0 %	383181775
508	NC_016833	ATA	2	6	35749	35754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181775
509	NC_016833	CAT	2	6	35811	35816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181775
510	NC_016833	TGC	2	6	35848	35853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181775
511	NC_016833	ATG	2	6	35854	35859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181775
512	NC_016833	AAG	2	6	35872	35877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181775
513	NC_016833	TTG	2	6	35881	35886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181775
514	NC_016833	TCT	2	6	35973	35978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181775
515	NC_016833	T	7	7	35984	35990	0 %	100 %	0 %	0 %	383181775
516	NC_016833	CAA	2	6	35991	35996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181775
517	NC_016833	AGA	2	6	36025	36030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181775
518	NC_016833	TATCGA	2	12	36034	36045	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383181775
519	NC_016833	TA	3	6	36048	36053	50 %	50 %	0 %	0 %	383181775
520	NC_016833	TCA	2	6	36062	36067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181775
521	NC_016833	TCTT	2	8	36102	36109	0 %	75 %	0 %	25 %	383181775
522	NC_016833	CCT	3	9	36156	36164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383181775
523	NC_016833	AG	3	6	36166	36171	50 %	0 %	50 %	0 %	383181775
524	NC_016833	T	7	7	36180	36186	0 %	100 %	0 %	0 %	383181775
525	NC_016833	ATT	2	6	36242	36247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181775
526	NC_016833	TAA	2	6	36249	36254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181775
527	NC_016833	TAA	3	9	36259	36267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181775
528	NC_016833	T	7	7	36313	36319	0 %	100 %	0 %	0 %	383181775
529	NC_016833	ATA	2	6	36431	36436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181775
530	NC_016833	CAT	2	6	36487	36492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181775
531	NC_016833	CCA	2	6	36974	36979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181776
532	NC_016833	AAC	2	6	36994	36999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181776
533	NC_016833	TCG	2	6	37200	37205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181776
534	NC_016833	A	6	6	37258	37263	100 %	0 %	0 %	0 %	383181776
535	NC_016833	CTG	2	6	37337	37342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181776
536	NC_016833	GGGCAT	2	12	37388	37399	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383181776
537	NC_016833	GAT	2	6	37408	37413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181776
538	NC_016833	TCT	2	6	37446	37451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181776
539	NC_016833	CGT	2	6	37564	37569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181776
540	NC_016833	AGA	2	6	37575	37580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181776
541	NC_016833	GGCA	2	8	37583	37590	25 %	0 %	50 %	25 %	383181776
542	NC_016833	AGG	2	6	37619	37624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383181776
543	NC_016833	GTA	2	6	37651	37656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181776
544	NC_016833	TTA	2	6	37688	37693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181776
545	NC_016833	GCA	2	6	37814	37819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181776
546	NC_016833	A	6	6	37910	37915	100 %	0 %	0 %	0 %	383181776
547	NC_016833	CCCCG	2	10	37930	37939	0 %	0 %	20 %	80 %	383181776
548	NC_016833	TTG	2	6	38027	38032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181776
549	NC_016833	TGTC	2	8	38084	38091	0 %	50 %	25 %	25 %	383181776
550	NC_016833	CAA	2	6	38095	38100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181776
551	NC_016833	A	6	6	38117	38122	100 %	0 %	0 %	0 %	383181776
552	NC_016833	AG	3	6	38603	38608	50 %	0 %	50 %	0 %	383181777
553	NC_016833	ACG	2	6	38627	38632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181777
554	NC_016833	CAGT	2	8	38634	38641	25 %	25 %	25 %	25 %	383181777
555	NC_016833	GAAG	2	8	38686	38693	50 %	0 %	50 %	0 %	383181777
556	NC_016833	TC	3	6	38794	38799	0 %	50 %	0 %	50 %	383181777
557	NC_016833	ATC	2	6	39069	39074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181778
558	NC_016833	TAT	3	9	39094	39102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181778
559	NC_016833	TAC	2	6	39113	39118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181778
560	NC_016833	A	6	6	39141	39146	100 %	0 %	0 %	0 %	383181778
561	NC_016833	TA	3	6	39152	39157	50 %	50 %	0 %	0 %	383181778
562	NC_016833	CTG	2	6	39172	39177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181778
563	NC_016833	TTG	2	6	39250	39255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181778
564	NC_016833	CAT	2	6	39694	39699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181779
565	NC_016833	CGT	2	6	39719	39724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181779
566	NC_016833	GTA	2	6	39781	39786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181779
567	NC_016833	GCG	2	6	39812	39817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181779
568	NC_016833	AAC	2	6	39830	39835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181779
569	NC_016833	TTA	2	6	39851	39856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181779
570	NC_016833	AGC	2	6	39928	39933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181779
571	NC_016833	GAG	2	6	39976	39981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383181779
572	NC_016833	AGCGA	2	10	40269	40278	40 %	0 %	40 %	20 %	383181780
573	NC_016833	CCG	2	6	40318	40323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181780
574	NC_016833	ATC	3	9	40424	40432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181780
575	NC_016833	GCGT	2	8	40483	40490	0 %	25 %	50 %	25 %	383181780
576	NC_016833	ATG	2	6	40524	40529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181780
577	NC_016833	GCG	2	6	40580	40585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181780
578	NC_016833	GCTG	2	8	40662	40669	0 %	25 %	50 %	25 %	383181780
579	NC_016833	CAA	2	6	40672	40677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181780
580	NC_016833	CAG	2	6	40679	40684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181780
581	NC_016833	TGT	2	6	40695	40700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181780
582	NC_016833	GTTT	2	8	40726	40733	0 %	75 %	25 %	0 %	383181780
583	NC_016833	TCG	2	6	40734	40739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181780
584	NC_016833	GGC	2	6	40788	40793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181780
585	NC_016833	CA	3	6	40857	40862	50 %	0 %	0 %	50 %	383181781
586	NC_016833	AAT	2	6	40928	40933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181781
587	NC_016833	CCT	2	6	40977	40982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383181781
588	NC_016833	CGT	2	6	41063	41068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181781
589	NC_016833	GTG	3	9	41116	41124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181781
590	NC_016833	TCCT	2	8	41178	41185	0 %	50 %	0 %	50 %	383181782
591	NC_016833	GCGG	2	8	41190	41197	0 %	0 %	75 %	25 %	383181782
592	NC_016833	TGCC	2	8	41333	41340	0 %	25 %	25 %	50 %	383181782
593	NC_016833	A	6	6	41351	41356	100 %	0 %	0 %	0 %	383181782
594	NC_016833	GCT	2	6	41471	41476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181782
595	NC_016833	CTG	2	6	41508	41513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181782
596	NC_016833	GCC	2	6	41517	41522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181782
597	NC_016833	TCT	2	6	41548	41553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181782
598	NC_016833	CGT	2	6	41574	41579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181782
599	NC_016833	ACG	2	6	41763	41768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181782
600	NC_016833	GGA	2	6	41802	41807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383181782
601	NC_016833	A	7	7	41832	41838	100 %	0 %	0 %	0 %	383181782
602	NC_016833	CGGC	2	8	41839	41846	0 %	0 %	50 %	50 %	383181782
603	NC_016833	GGA	2	6	41848	41853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383181782
604	NC_016833	GC	3	6	41859	41864	0 %	0 %	50 %	50 %	383181782
605	NC_016833	GAA	2	6	41882	41887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181782
606	NC_016833	GCC	2	6	41888	41893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181782
607	NC_016833	T	6	6	42039	42044	0 %	100 %	0 %	0 %	383181782
608	NC_016833	GT	3	6	42081	42086	0 %	50 %	50 %	0 %	383181782
609	NC_016833	GA	3	6	42088	42093	50 %	0 %	50 %	0 %	383181782
610	NC_016833	GGAT	2	8	42121	42128	25 %	25 %	50 %	0 %	383181782
611	NC_016833	TG	3	6	42208	42213	0 %	50 %	50 %	0 %	383181782
612	NC_016833	CCG	2	6	42230	42235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181782
613	NC_016833	GAA	2	6	42266	42271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181782
614	NC_016833	CG	3	6	42275	42280	0 %	0 %	50 %	50 %	383181782
615	NC_016833	CTG	2	6	42291	42296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181782
616	NC_016833	GGC	2	6	42574	42579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181783
617	NC_016833	AT	3	6	43223	43228	50 %	50 %	0 %	0 %	383181784
618	NC_016833	TACA	2	8	43286	43293	50 %	25 %	0 %	25 %	383181784
619	NC_016833	CAA	2	6	43330	43335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181784
620	NC_016833	A	7	7	43349	43355	100 %	0 %	0 %	0 %	383181784
621	NC_016833	ATT	2	6	43375	43380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181784
622	NC_016833	AGC	2	6	43404	43409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181784
623	NC_016833	TAG	2	6	43419	43424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181784
624	NC_016833	TC	3	6	43430	43435	0 %	50 %	0 %	50 %	383181784
625	NC_016833	TA	3	6	43537	43542	50 %	50 %	0 %	0 %	383181784
626	NC_016833	ATT	2	6	43603	43608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181784
627	NC_016833	TGA	2	6	43728	43733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181784
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629	NC_016833	T	6	6	43765	43770	0 %	100 %	0 %	0 %	383181784
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