MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016832	TGG	2	6	78994	78999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958205
1502	NC_016832	CTT	2	6	79006	79011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958205
1503	NC_016832	GGC	2	6	79020	79025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958205
1504	NC_016832	CGG	2	6	79078	79083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958205
1505	NC_016832	TGC	2	6	79108	79113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958205
1506	NC_016832	TGA	2	6	79127	79132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958205
1507	NC_016832	GTGGAC	2	12	79143	79154	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378958205
1508	NC_016832	GGCG	2	8	79211	79218	0 %	0 %	75 %	25 %	378958205
1509	NC_016832	CAG	2	6	79290	79295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958205
1510	NC_016832	TGA	2	6	79333	79338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958205
1511	NC_016832	GCG	2	6	79395	79400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958205
1512	NC_016832	GGC	2	6	79451	79456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958205
1513	NC_016832	GC	3	6	79455	79460	0 %	0 %	50 %	50 %	378958205
1514	NC_016832	TAC	2	6	79518	79523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958205
1515	NC_016832	AAG	2	6	79531	79536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958205
1516	NC_016832	CAA	2	6	79550	79555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958205
1517	NC_016832	GAA	2	6	79676	79681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958205
1518	NC_016832	GTG	2	6	79728	79733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958205
1519	NC_016832	GCT	2	6	79748	79753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958205
1520	NC_016832	CCAC	2	8	79777	79784	25 %	0 %	0 %	75 %	378958205
1521	NC_016832	GTC	2	6	79849	79854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958205
1522	NC_016832	CAT	2	6	79895	79900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958205
1523	NC_016832	ACC	2	6	79905	79910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958205
1524	NC_016832	GCC	2	6	79915	79920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958205
1525	NC_016832	CGC	2	6	79947	79952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958205
1526	NC_016832	CGG	2	6	79994	79999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958205
1527	NC_016832	ACG	2	6	80007	80012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958205
1528	NC_016832	TG	3	6	80362	80367	0 %	50 %	50 %	0 %	378958206
1529	NC_016832	GAT	2	6	80411	80416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958206
1530	NC_016832	TTGT	2	8	80524	80531	0 %	75 %	25 %	0 %	378958206
1531	NC_016832	GAT	2	6	80540	80545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958206
1532	NC_016832	TGCCAG	2	12	80571	80582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378958206
1533	NC_016832	GAAA	2	8	80646	80653	75 %	0 %	25 %	0 %	378958206
1534	NC_016832	C	6	6	80691	80696	0 %	0 %	0 %	100 %	378958206
1535	NC_016832	GAT	2	6	80726	80731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958206
1536	NC_016832	CGTC	2	8	80857	80864	0 %	25 %	25 %	50 %	378958207
1537	NC_016832	CGGT	2	8	80879	80886	0 %	25 %	50 %	25 %	378958207
1538	NC_016832	TTC	2	6	80888	80893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958207
1539	NC_016832	GTA	2	6	81007	81012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958207
1540	NC_016832	CG	3	6	81013	81018	0 %	0 %	50 %	50 %	378958207
1541	NC_016832	CAG	2	6	81032	81037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958207
1542	NC_016832	TTGCC	2	10	81038	81047	0 %	40 %	20 %	40 %	378958207
1543	NC_016832	GGC	2	6	81080	81085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958207
1544	NC_016832	CT	3	6	81093	81098	0 %	50 %	0 %	50 %	378958207
1545	NC_016832	CAC	2	6	81158	81163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958207
1546	NC_016832	GGTATC	2	12	81215	81226	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378958207
1547	NC_016832	GCCT	2	8	81266	81273	0 %	25 %	25 %	50 %	378958207
1548	NC_016832	CAC	2	6	81392	81397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958207
1549	NC_016832	TCT	2	6	81603	81608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958208
1550	NC_016832	CGC	2	6	81640	81645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958208
1551	NC_016832	CTT	2	6	81664	81669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958208
1552	NC_016832	CG	3	6	81689	81694	0 %	0 %	50 %	50 %	378958208
1553	NC_016832	GTT	2	6	81742	81747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958208
1554	NC_016832	CG	4	8	81757	81764	0 %	0 %	50 %	50 %	378958208
1555	NC_016832	CTT	2	6	81820	81825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958208
1556	NC_016832	GCA	2	6	81877	81882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958208
1557	NC_016832	CGC	3	9	81901	81909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958208
1558	NC_016832	GCC	2	6	81981	81986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958208
1559	NC_016832	CCA	2	6	82005	82010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958208
1560	NC_016832	GCC	2	6	82079	82084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958208
1561	NC_016832	CGC	2	6	82162	82167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958208
1562	NC_016832	GTC	2	6	82196	82201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958208
1563	NC_016832	GGTC	2	8	82266	82273	0 %	25 %	50 %	25 %	378958208
1564	NC_016832	ACTC	2	8	82318	82325	25 %	25 %	0 %	50 %	378958208
1565	NC_016832	T	8	8	82391	82398	0 %	100 %	0 %	0 %	378958209
1566	NC_016832	ATT	2	6	82400	82405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958209
1567	NC_016832	TCA	2	6	82553	82558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958209
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1569	NC_016832	ATA	2	6	82616	82621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958209
1570	NC_016832	CGC	2	6	82653	82658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958209
1571	NC_016832	CATCCT	2	12	82701	82712	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378958209
1572	NC_016832	CGG	2	6	82845	82850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958209
1573	NC_016832	TCG	2	6	82868	82873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958209
1574	NC_016832	CGT	2	6	82922	82927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958209
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1576	NC_016832	CAG	2	6	82987	82992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958209
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1581	NC_016832	CGG	2	6	83217	83222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958209
1582	NC_016832	GCG	2	6	83237	83242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958209
1583	NC_016832	TCA	2	6	83291	83296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958209
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1589	NC_016832	CAGA	2	8	83518	83525	50 %	0 %	25 %	25 %	378958209
1590	NC_016832	CAG	2	6	83596	83601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958209
1591	NC_016832	TTC	2	6	83635	83640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958209
1592	NC_016832	TAA	2	6	83768	83773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958209
1593	NC_016832	A	6	6	83772	83777	100 %	0 %	0 %	0 %	378958209
1594	NC_016832	GTC	2	6	83890	83895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958209
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1597	NC_016832	ATG	2	6	84145	84150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958210
1598	NC_016832	TCAGC	2	10	84269	84278	20 %	20 %	20 %	40 %	378958210
1599	NC_016832	TGC	2	6	84309	84314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958210
1600	NC_016832	CGA	2	6	84338	84343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958210
1601	NC_016832	GATG	2	8	84368	84375	25 %	25 %	50 %	0 %	378958210
1602	NC_016832	GTA	2	6	84516	84521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958210
1603	NC_016832	CGC	2	6	84557	84562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958210
1604	NC_016832	AGT	2	6	84569	84574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958210
1605	NC_016832	CAT	2	6	84576	84581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958210
1606	NC_016832	GCA	2	6	84599	84604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958210
1607	NC_016832	GTC	2	6	84682	84687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958210
1608	NC_016832	CGG	2	6	84710	84715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958210
1609	NC_016832	CTC	2	6	84816	84821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958210
1610	NC_016832	TCA	2	6	84889	84894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958210
1611	NC_016832	CGG	2	6	84904	84909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958210
1612	NC_016832	GGT	2	6	84948	84953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958210
1613	NC_016832	GCG	2	6	85023	85028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958210
1614	NC_016832	A	6	6	85157	85162	100 %	0 %	0 %	0 %	378958210
1615	NC_016832	T	6	6	85231	85236	0 %	100 %	0 %	0 %	378958210
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1621	NC_016832	CCGA	2	8	85794	85801	25 %	0 %	25 %	50 %	378958211
1622	NC_016832	CGT	2	6	85826	85831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958211
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1754	NC_016832	CGC	2	6	92129	92134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958219
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1759	NC_016832	CGC	2	6	92309	92314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958219
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1858	NC_016832	GCGCT	2	10	99207	99216	0 %	20 %	40 %	40 %	378958227
1859	NC_016832	CG	3	6	99221	99226	0 %	0 %	50 %	50 %	378958227
1860	NC_016832	GGCG	2	8	99332	99339	0 %	0 %	75 %	25 %	378958227
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1866	NC_016832	CTG	2	6	99480	99485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958227
1867	NC_016832	TTG	2	6	99486	99491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958227
1868	NC_016832	TTA	2	6	99582	99587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958227
1869	NC_016832	GGCGC	2	10	99621	99630	0 %	0 %	60 %	40 %	378958227
1870	NC_016832	GGC	2	6	99695	99700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958227
1871	NC_016832	TGC	2	6	99718	99723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958227
1872	NC_016832	GC	3	6	99756	99761	0 %	0 %	50 %	50 %	378958227
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1874	NC_016832	AGC	2	6	99784	99789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958227
1875	NC_016832	CTG	2	6	99843	99848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958227
1876	NC_016832	TGG	2	6	99865	99870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958227
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1878	NC_016832	GCGAC	2	10	99934	99943	20 %	0 %	40 %	40 %	378958227
1879	NC_016832	GCG	2	6	99972	99977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958227
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1882	NC_016832	GCTGGG	2	12	100187	100198	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378958227
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1896	NC_016832	GTC	2	6	100770	100775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958229
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1987	NC_016832	GCT	4	12	106046	106057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958235
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1994	NC_016832	AAG	2	6	106375	106380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958235
1995	NC_016832	T	6	6	106550	106555	0 %	100 %	0 %	0 %	378958235
1996	NC_016832	CTG	2	6	106589	106594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958235
1997	NC_016832	GCTTC	2	10	106612	106621	0 %	40 %	20 %	40 %	378958235
1998	NC_016832	GTA	2	6	106772	106777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958235
1999	NC_016832	GCT	2	6	106808	106813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958235
2000	NC_016832	TGCGT	2	10	106899	106908	0 %	40 %	40 %	20 %	378958235

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