MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

< Previous12...3435363738394041424344...169170Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_016832	T	6	6	1026235	1026240	0 %	100 %	0 %	0 %	378959093
19002	NC_016832	GAT	3	9	1026657	1026665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959094
19003	NC_016832	CCA	2	6	1026717	1026722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378959094
19004	NC_016832	GAC	2	6	1026723	1026728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959094
19005	NC_016832	ATT	2	6	1026806	1026811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378959094
19006	NC_016832	CAA	2	6	1026883	1026888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378959094
19007	NC_016832	ATT	2	6	1026914	1026919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378959094
19008	NC_016832	A	8	8	1026979	1026986	100 %	0 %	0 %	0 %	378959094
19009	NC_016832	GCA	2	6	1026988	1026993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959094
19010	NC_016832	G	6	6	1027046	1027051	0 %	0 %	100 %	0 %	378959094
19011	NC_016832	AGG	2	6	1027085	1027090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378959094
19012	NC_016832	GAC	2	6	1027186	1027191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959094
19013	NC_016832	GGCG	2	8	1027215	1027222	0 %	0 %	75 %	25 %	378959094
19014	NC_016832	CTGG	2	8	1027337	1027344	0 %	25 %	50 %	25 %	378959094
19015	NC_016832	GCTC	2	8	1027401	1027408	0 %	25 %	25 %	50 %	378959094
19016	NC_016832	TAT	2	6	1027465	1027470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378959094
19017	NC_016832	CGGG	2	8	1027513	1027520	0 %	0 %	75 %	25 %	378959094
19018	NC_016832	GCG	2	6	1027534	1027539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959094
19019	NC_016832	GCA	2	6	1027550	1027555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959094
19020	NC_016832	CG	3	6	1027561	1027566	0 %	0 %	50 %	50 %	378959094
19021	NC_016832	CTG	2	6	1027781	1027786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378959094
19022	NC_016832	GGT	2	6	1027791	1027796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378959094
19023	NC_016832	TAC	2	6	1027860	1027865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378959094
19024	NC_016832	GCTG	2	8	1028055	1028062	0 %	25 %	50 %	25 %	378959094
19025	NC_016832	TA	3	6	1028086	1028091	50 %	50 %	0 %	0 %	378959094
19026	NC_016832	AACGAG	2	12	1028892	1028903	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378959095
19027	NC_016832	GAT	2	6	1028916	1028921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959095
19028	NC_016832	AATAC	2	10	1028932	1028941	60 %	20 %	0 %	20 %	378959095
19029	NC_016832	G	7	7	1029043	1029049	0 %	0 %	100 %	0 %	378959095
19030	NC_016832	CGTA	2	8	1029055	1029062	25 %	25 %	25 %	25 %	378959095
19031	NC_016832	GCC	2	6	1029132	1029137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378959095
19032	NC_016832	TTG	2	6	1029211	1029216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378959095
19033	NC_016832	GAA	2	6	1029321	1029326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378959095
19034	NC_016832	TGG	2	6	1029414	1029419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378959095
19035	NC_016832	ACG	2	6	1029435	1029440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959095
19036	NC_016832	A	6	6	1029510	1029515	100 %	0 %	0 %	0 %	378959095
19037	NC_016832	TGC	2	6	1029525	1029530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378959095
19038	NC_016832	CCAGCG	2	12	1029688	1029699	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378959096
19039	NC_016832	GCC	2	6	1029707	1029712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378959096
19040	NC_016832	AGT	2	6	1029777	1029782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959096
19041	NC_016832	GCG	2	6	1029859	1029864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959096
19042	NC_016832	GCG	2	6	1029911	1029916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959096
19043	NC_016832	AAT	2	6	1029942	1029947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378959096
19044	NC_016832	CGCCAG	2	12	1029974	1029985	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378959096
19045	NC_016832	GCA	2	6	1030048	1030053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959096
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19047	NC_016832	A	6	6	1030132	1030137	100 %	0 %	0 %	0 %	378959096
19048	NC_016832	CTG	2	6	1030286	1030291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378959096
19049	NC_016832	AAG	2	6	1030304	1030309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378959096
19050	NC_016832	ATG	2	6	1030347	1030352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959096
19051	NC_016832	CA	4	8	1030415	1030422	50 %	0 %	0 %	50 %	378959096
19052	NC_016832	CCACC	2	10	1030423	1030432	20 %	0 %	0 %	80 %	378959096
19053	NC_016832	CAA	2	6	1030435	1030440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378959096
19054	NC_016832	CAG	2	6	1030448	1030453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959096
19055	NC_016832	TTA	2	6	1030491	1030496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378959096
19056	NC_016832	GGC	2	6	1030535	1030540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959096
19057	NC_016832	CAT	2	6	1030562	1030567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378959096
19058	NC_016832	AGCCC	2	10	1030621	1030630	20 %	0 %	20 %	60 %	378959096
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19060	NC_016832	TAG	2	6	1030667	1030672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959096
19061	NC_016832	CAA	2	6	1030706	1030711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378959096
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19063	NC_016832	CTA	2	6	1030831	1030836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378959096
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19067	NC_016832	CGG	3	9	1031194	1031202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959097
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19069	NC_016832	GAAAG	2	10	1031225	1031234	60 %	0 %	40 %	0 %	378959097
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19085	NC_016832	TAA	3	9	1032075	1032083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378959099
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19088	NC_016832	A	6	6	1032278	1032283	100 %	0 %	0 %	0 %	378959099
19089	NC_016832	GGCT	2	8	1032325	1032332	0 %	25 %	50 %	25 %	378959099
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19096	NC_016832	AG	3	6	1032996	1033001	50 %	0 %	50 %	0 %	378959100
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19100	NC_016832	GGT	2	6	1033915	1033920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378959102
19101	NC_016832	CAG	2	6	1033970	1033975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959102
19102	NC_016832	TGC	2	6	1033995	1034000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378959102
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19104	NC_016832	CGG	2	6	1034040	1034045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959102
19105	NC_016832	ATG	2	6	1034067	1034072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959102
19106	NC_016832	GGCA	2	8	1034074	1034081	25 %	0 %	50 %	25 %	378959102
19107	NC_016832	AATT	2	8	1034082	1034089	50 %	50 %	0 %	0 %	378959102
19108	NC_016832	CGG	2	6	1034106	1034111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959102
19109	NC_016832	CGT	2	6	1034147	1034152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378959102
19110	NC_016832	TAATT	2	10	1034227	1034236	40 %	60 %	0 %	0 %	378959102
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19116	NC_016832	T	7	7	1035034	1035040	0 %	100 %	0 %	0 %	378959104
19117	NC_016832	GTT	2	6	1035112	1035117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378959104
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19232	NC_016832	GAT	2	6	1040622	1040627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959110
19233	NC_016832	CAG	2	6	1040637	1040642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959110
19234	NC_016832	AGC	2	6	1040656	1040661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959110
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19341	NC_016832	T	7	7	1046174	1046180	0 %	100 %	0 %	0 %	378959115
19342	NC_016832	CGC	2	6	1046223	1046228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378959115
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19344	NC_016832	GAA	2	6	1046271	1046276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378959115
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19346	NC_016832	AGC	2	6	1046425	1046430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959115
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19464	NC_016832	TGG	2	6	1051322	1051327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378959120
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19499	NC_016832	TGA	2	6	1053178	1053183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959122
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