MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

< Previous12...2627282930313233343536...169170Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_016832	TAAA	2	8	810850	810857	75 %	25 %	0 %	0 %	378958877
15003	NC_016832	TTC	2	6	810929	810934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958877
15004	NC_016832	TTA	2	6	810957	810962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958877
15005	NC_016832	GAT	2	6	810975	810980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958877
15006	NC_016832	GTAT	2	8	810981	810988	25 %	50 %	25 %	0 %	378958877
15007	NC_016832	ATT	2	6	810998	811003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958877
15008	NC_016832	A	6	6	811013	811018	100 %	0 %	0 %	0 %	378958877
15009	NC_016832	AGA	2	6	811037	811042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958877
15010	NC_016832	TCTT	2	8	811055	811062	0 %	75 %	0 %	25 %	378958877
15011	NC_016832	ATG	2	6	811084	811089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958877
15012	NC_016832	ATT	2	6	811139	811144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958877
15013	NC_016832	AAT	2	6	811179	811184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958877
15014	NC_016832	ATT	2	6	811185	811190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958877
15015	NC_016832	TGT	2	6	811320	811325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958877
15016	NC_016832	TGAT	2	8	811399	811406	25 %	50 %	25 %	0 %	378958878
15017	NC_016832	T	7	7	811424	811430	0 %	100 %	0 %	0 %	378958878
15018	NC_016832	T	6	6	811435	811440	0 %	100 %	0 %	0 %	378958878
15019	NC_016832	GGA	2	6	811491	811496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958878
15020	NC_016832	AATT	2	8	811511	811518	50 %	50 %	0 %	0 %	378958878
15021	NC_016832	GTA	2	6	811538	811543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958878
15022	NC_016832	GTA	2	6	811592	811597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958878
15023	NC_016832	AT	3	6	811626	811631	50 %	50 %	0 %	0 %	378958878
15024	NC_016832	GA	3	6	811714	811719	50 %	0 %	50 %	0 %	378958878
15025	NC_016832	TTTTG	2	10	811738	811747	0 %	80 %	20 %	0 %	378958878
15026	NC_016832	AGAA	2	8	811749	811756	75 %	0 %	25 %	0 %	378958878
15027	NC_016832	GTCT	2	8	811767	811774	0 %	50 %	25 %	25 %	378958878
15028	NC_016832	ATT	3	9	811798	811806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958878
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15030	NC_016832	ATTAT	2	10	811841	811850	40 %	60 %	0 %	0 %	378958878
15031	NC_016832	TAA	2	6	811884	811889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958878
15032	NC_016832	TAT	2	6	811933	811938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958878
15033	NC_016832	GGA	2	6	811959	811964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958878
15034	NC_016832	CTT	2	6	812007	812012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958878
15035	NC_016832	A	7	7	812050	812056	100 %	0 %	0 %	0 %	378958878
15036	NC_016832	A	6	6	812062	812067	100 %	0 %	0 %	0 %	378958878
15037	NC_016832	GTT	2	6	812073	812078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958878
15038	NC_016832	ATA	2	6	812101	812106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958879
15039	NC_016832	GCTT	2	8	812135	812142	0 %	50 %	25 %	25 %	378958879
15040	NC_016832	CAGG	2	8	812210	812217	25 %	0 %	50 %	25 %	378958879
15041	NC_016832	TA	3	6	812249	812254	50 %	50 %	0 %	0 %	378958879
15042	NC_016832	AT	3	6	812290	812295	50 %	50 %	0 %	0 %	378958879
15043	NC_016832	AAT	2	6	812306	812311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958879
15044	NC_016832	GAAA	2	8	812316	812323	75 %	0 %	25 %	0 %	378958879
15045	NC_016832	TTA	3	9	812448	812456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958880
15046	NC_016832	CGG	2	6	812464	812469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958880
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15049	NC_016832	AT	3	6	812596	812601	50 %	50 %	0 %	0 %	378958880
15050	NC_016832	GAT	2	6	812609	812614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958880
15051	NC_016832	CAT	2	6	812636	812641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958880
15052	NC_016832	ATG	2	6	812658	812663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958880
15053	NC_016832	ATT	2	6	812669	812674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958880
15054	NC_016832	ATA	2	6	812745	812750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958880
15055	NC_016832	T	6	6	812756	812761	0 %	100 %	0 %	0 %	378958880
15056	NC_016832	TGA	2	6	812833	812838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958880
15057	NC_016832	T	6	6	812842	812847	0 %	100 %	0 %	0 %	378958880
15058	NC_016832	T	6	6	812852	812857	0 %	100 %	0 %	0 %	378958880
15059	NC_016832	ATT	2	6	812887	812892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958880
15060	NC_016832	ATG	2	6	812915	812920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958880
15061	NC_016832	TAA	2	6	812944	812949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958880
15062	NC_016832	A	6	6	812948	812953	100 %	0 %	0 %	0 %	378958880
15063	NC_016832	CATC	2	8	812972	812979	25 %	25 %	0 %	50 %	378958880
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15066	NC_016832	AG	3	6	813295	813300	50 %	0 %	50 %	0 %	378958881
15067	NC_016832	ATG	2	6	813307	813312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958881
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15072	NC_016832	CAT	2	6	813472	813477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958881
15073	NC_016832	GAT	2	6	813483	813488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958881
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15081	NC_016832	ATG	3	9	813869	813877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958882
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15087	NC_016832	GA	3	6	814527	814532	50 %	0 %	50 %	0 %	378958883
15088	NC_016832	A	6	6	814554	814559	100 %	0 %	0 %	0 %	378958883
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15090	NC_016832	A	6	6	814610	814615	100 %	0 %	0 %	0 %	378958883
15091	NC_016832	TCT	2	6	814652	814657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958883
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15093	NC_016832	AACT	2	8	815010	815017	50 %	25 %	0 %	25 %	378958884
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15095	NC_016832	TTA	2	6	815094	815099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958884
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15098	NC_016832	AAAT	2	8	815192	815199	75 %	25 %	0 %	0 %	378958884
15099	NC_016832	ATG	2	6	815204	815209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958884
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15101	NC_016832	TAG	2	6	815241	815246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958884
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15103	NC_016832	GTTAT	2	10	815321	815330	20 %	60 %	20 %	0 %	378958884
15104	NC_016832	GGT	2	6	815336	815341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958884
15105	NC_016832	TA	3	6	815404	815409	50 %	50 %	0 %	0 %	378958884
15106	NC_016832	A	6	6	815477	815482	100 %	0 %	0 %	0 %	378958884
15107	NC_016832	AGCG	2	8	815485	815492	25 %	0 %	50 %	25 %	378958884
15108	NC_016832	AGA	2	6	815740	815745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958885
15109	NC_016832	ATC	2	6	815773	815778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958885
15110	NC_016832	GGGT	2	8	815913	815920	0 %	25 %	75 %	0 %	378958885
15111	NC_016832	AGG	2	6	815946	815951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958885
15112	NC_016832	CCG	2	6	815979	815984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958885
15113	NC_016832	GGC	2	6	815996	816001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958885
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15117	NC_016832	ACGG	2	8	816419	816426	25 %	0 %	50 %	25 %	378958886
15118	NC_016832	CGAAA	2	10	816436	816445	60 %	0 %	20 %	20 %	378958886
15119	NC_016832	AGAA	2	8	816454	816461	75 %	0 %	25 %	0 %	378958886
15120	NC_016832	GGT	2	6	816472	816477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958886
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15123	NC_016832	TTG	2	6	816635	816640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958886
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15244	NC_016832	CTG	2	6	822074	822079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958891
15245	NC_016832	T	7	7	822081	822087	0 %	100 %	0 %	0 %	378958891
15246	NC_016832	CG	3	6	822157	822162	0 %	0 %	50 %	50 %	378958891
15247	NC_016832	CGC	2	6	822176	822181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958891
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15354	NC_016832	AAATT	2	10	826990	826999	60 %	40 %	0 %	0 %	378958893
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15357	NC_016832	CTG	2	6	827029	827034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958893
15358	NC_016832	TCATT	2	10	827039	827048	20 %	60 %	0 %	20 %	378958893
15359	NC_016832	CGA	2	6	827094	827099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958893
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15362	NC_016832	TGG	2	6	827237	827242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958893
15363	NC_016832	CCT	2	6	827285	827290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958894
15364	NC_016832	GCC	2	6	827394	827399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958894
15365	NC_016832	CGC	2	6	827478	827483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958894
15366	NC_016832	TCA	2	6	827492	827497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958894
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15369	NC_016832	CGG	2	6	827567	827572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958894
15370	NC_016832	ATC	2	6	827587	827592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958894
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15481	NC_016832	GC	3	6	832248	832253	0 %	0 %	50 %	50 %	378958897
15482	NC_016832	GCTG	2	8	832323	832330	0 %	25 %	50 %	25 %	378958897
15483	NC_016832	GTC	2	6	832345	832350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958897
15484	NC_016832	CT	3	6	832406	832411	0 %	50 %	0 %	50 %	378958897
15485	NC_016832	AGC	2	6	832460	832465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958897
15486	NC_016832	CG	3	6	832487	832492	0 %	0 %	50 %	50 %	378958897
15487	NC_016832	GAC	2	6	832515	832520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958897
15488	NC_016832	CGT	2	6	832557	832562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958897
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15491	NC_016832	CGC	2	6	832620	832625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958897
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