MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

< Previous12...2526272829303132333435...169170Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_016832	ATCG	2	8	781009	781016	25 %	25 %	25 %	25 %	378958845
14503	NC_016832	CG	4	8	781034	781041	0 %	0 %	50 %	50 %	378958845
14504	NC_016832	GC	3	6	781244	781249	0 %	0 %	50 %	50 %	378958846
14505	NC_016832	TGC	4	12	781262	781273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958846
14506	NC_016832	TGGC	2	8	781382	781389	0 %	25 %	50 %	25 %	378958846
14507	NC_016832	GGT	2	6	781414	781419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958846
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14509	NC_016832	GTT	2	6	781545	781550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958846
14510	NC_016832	TCG	2	6	781561	781566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958846
14511	NC_016832	GCA	2	6	781674	781679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958846
14512	NC_016832	CTG	2	6	781687	781692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958846
14513	NC_016832	GTT	2	6	781710	781715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958846
14514	NC_016832	AGC	2	6	781733	781738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958846
14515	NC_016832	ACTTTG	2	12	781739	781750	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378958846
14516	NC_016832	TATC	2	8	781767	781774	25 %	50 %	0 %	25 %	378958846
14517	NC_016832	CG	3	6	781876	781881	0 %	0 %	50 %	50 %	378958846
14518	NC_016832	CAAAG	2	10	781904	781913	60 %	0 %	20 %	20 %	378958846
14519	NC_016832	TGC	3	9	782186	782194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958847
14520	NC_016832	CAG	2	6	782197	782202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958847
14521	NC_016832	TCT	2	6	782318	782323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958847
14522	NC_016832	CG	3	6	782377	782382	0 %	0 %	50 %	50 %	378958847
14523	NC_016832	GGC	2	6	782398	782403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958847
14524	NC_016832	CGG	2	6	782409	782414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958847
14525	NC_016832	GTC	2	6	782419	782424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958847
14526	NC_016832	GGTC	2	8	782433	782440	0 %	25 %	50 %	25 %	378958847
14527	NC_016832	GGC	2	6	782470	782475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958847
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14529	NC_016832	TCG	2	6	782507	782512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958847
14530	NC_016832	GCT	2	6	782517	782522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958847
14531	NC_016832	CGG	2	6	782588	782593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958847
14532	NC_016832	GT	3	6	782604	782609	0 %	50 %	50 %	0 %	378958847
14533	NC_016832	GAT	2	6	782697	782702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958847
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14535	NC_016832	CGC	2	6	782808	782813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958847
14536	NC_016832	CTG	2	6	782929	782934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958847
14537	NC_016832	CGA	2	6	782952	782957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958847
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14540	NC_016832	CGC	2	6	783349	783354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958847
14541	NC_016832	GCCA	2	8	783367	783374	25 %	0 %	25 %	50 %	378958847
14542	NC_016832	T	6	6	783397	783402	0 %	100 %	0 %	0 %	378958847
14543	NC_016832	TTACA	2	10	783560	783569	40 %	40 %	0 %	20 %	378958847
14544	NC_016832	TTG	2	6	783575	783580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958847
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14548	NC_016832	GAT	2	6	783766	783771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958847
14549	NC_016832	ATTAC	2	10	783814	783823	40 %	40 %	0 %	20 %	378958847
14550	NC_016832	GGA	3	9	783834	783842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958847
14551	NC_016832	GAT	2	6	783867	783872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958848
14552	NC_016832	TAG	2	6	784039	784044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958848
14553	NC_016832	T	7	7	784078	784084	0 %	100 %	0 %	0 %	378958848
14554	NC_016832	GAA	2	6	784119	784124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958848
14555	NC_016832	A	6	6	784171	784176	100 %	0 %	0 %	0 %	378958848
14556	NC_016832	GTT	2	6	784220	784225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958848
14557	NC_016832	CAG	2	6	784236	784241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958848
14558	NC_016832	ATTC	2	8	784250	784257	25 %	50 %	0 %	25 %	378958848
14559	NC_016832	TTG	2	6	784284	784289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958848
14560	NC_016832	GAT	2	6	784296	784301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958848
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14563	NC_016832	CGC	2	6	784402	784407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958848
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14584	NC_016832	CTT	3	9	785375	785383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958850
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14587	NC_016832	GTA	2	6	785454	785459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958850
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14590	NC_016832	CAG	2	6	785858	785863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958851
14591	NC_016832	CAG	2	6	785868	785873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958851
14592	NC_016832	GTTT	2	8	785881	785888	0 %	75 %	25 %	0 %	378958851
14593	NC_016832	TTC	2	6	786018	786023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958851
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14596	NC_016832	GTAA	2	8	786162	786169	50 %	25 %	25 %	0 %	378958851
14597	NC_016832	TTC	2	6	786213	786218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958851
14598	NC_016832	CAGC	2	8	786229	786236	25 %	0 %	25 %	50 %	378958851
14599	NC_016832	AG	3	6	786238	786243	50 %	0 %	50 %	0 %	378958851
14600	NC_016832	TCA	2	6	786568	786573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958852
14601	NC_016832	GCGCG	2	10	786651	786660	0 %	0 %	60 %	40 %	378958852
14602	NC_016832	GGC	2	6	786683	786688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958852
14603	NC_016832	CGC	2	6	786749	786754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958852
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14605	NC_016832	TCAA	2	8	786811	786818	50 %	25 %	0 %	25 %	378958852
14606	NC_016832	GCGGCT	2	12	786904	786915	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378958852
14607	NC_016832	CTT	2	6	786923	786928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958852
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14615	NC_016832	TCA	2	6	787462	787467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958852
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14979	NC_016832	GTG	2	6	808393	808398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958873
14980	NC_016832	GAGC	2	8	808440	808447	25 %	0 %	50 %	25 %	378958873
14981	NC_016832	GCT	2	6	808479	808484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958873
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14983	NC_016832	A	6	6	808641	808646	100 %	0 %	0 %	0 %	378958874
14984	NC_016832	TTA	2	6	808704	808709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958874
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14999	NC_016832	A	7	7	810652	810658	100 %	0 %	0 %	0 %	378958876
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