MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016832	CTG	2	6	698174	698179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
13002	NC_016832	CT	3	6	698237	698242	0 %	50 %	0 %	50 %	378958762
13003	NC_016832	TGG	2	6	698257	698262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958762
13004	NC_016832	GCGG	2	8	698342	698349	0 %	0 %	75 %	25 %	378958762
13005	NC_016832	CGG	2	6	698423	698428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958762
13006	NC_016832	TGC	2	6	698473	698478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
13007	NC_016832	ACA	2	6	698497	698502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958762
13008	NC_016832	TGA	2	6	698515	698520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958762
13009	NC_016832	GGC	2	6	698525	698530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958762
13010	NC_016832	CGG	2	6	698537	698542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958762
13011	NC_016832	CGC	2	6	698561	698566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958762
13012	NC_016832	GAG	2	6	698574	698579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958762
13013	NC_016832	TAC	2	6	698610	698615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958762
13014	NC_016832	G	6	6	698643	698648	0 %	0 %	100 %	0 %	378958762
13015	NC_016832	CTG	2	6	698649	698654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
13016	NC_016832	GGGC	2	8	698663	698670	0 %	0 %	75 %	25 %	378958762
13017	NC_016832	CCG	3	9	698696	698704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958762
13018	NC_016832	TTA	2	6	698744	698749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958763
13019	NC_016832	GCT	2	6	698752	698757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958763
13020	NC_016832	CTG	2	6	698765	698770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958763
13021	NC_016832	GCT	2	6	698782	698787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958763
13022	NC_016832	GC	3	6	698798	698803	0 %	0 %	50 %	50 %	378958763
13023	NC_016832	CGA	2	6	698823	698828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958763
13024	NC_016832	TGC	2	6	698937	698942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958763
13025	NC_016832	GTG	2	6	699023	699028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958763
13026	NC_016832	GAC	2	6	699044	699049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958763
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13028	NC_016832	GGC	2	6	699271	699276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958763
13029	NC_016832	TGATGC	2	12	699302	699313	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378958764
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13032	NC_016832	AGC	2	6	699407	699412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958764
13033	NC_016832	AAC	2	6	699433	699438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958764
13034	NC_016832	GAT	2	6	699459	699464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958764
13035	NC_016832	AGG	2	6	699503	699508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958764
13036	NC_016832	GCC	2	6	699515	699520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958764
13037	NC_016832	ATC	2	6	699526	699531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958764
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13039	NC_016832	CGC	2	6	699575	699580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958764
13040	NC_016832	TGC	2	6	699596	699601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958764
13041	NC_016832	TGC	2	6	699608	699613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958764
13042	NC_016832	GCC	2	6	699619	699624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958764
13043	NC_016832	GGCG	2	8	699630	699637	0 %	0 %	75 %	25 %	378958764
13044	NC_016832	TCG	2	6	699647	699652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958764
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13046	NC_016832	TGCGCC	2	12	699671	699682	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378958764
13047	NC_016832	CGG	2	6	699695	699700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958764
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13049	NC_016832	CG	4	8	699717	699724	0 %	0 %	50 %	50 %	378958764
13050	NC_016832	GCA	2	6	699822	699827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958764
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13052	NC_016832	GAG	3	9	699892	699900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958764
13053	NC_016832	ATG	2	6	699941	699946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958764
13054	NC_016832	GGCT	2	8	699961	699968	0 %	25 %	50 %	25 %	378958764
13055	NC_016832	GCG	2	6	700063	700068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958764
13056	NC_016832	GGA	2	6	700107	700112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958764
13057	NC_016832	CCG	2	6	700116	700121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958764
13058	NC_016832	CGG	2	6	700122	700127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958764
13059	NC_016832	CTG	2	6	700132	700137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958764
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13063	NC_016832	GCT	2	6	700254	700259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958764
13064	NC_016832	CGG	2	6	700262	700267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958764
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13066	NC_016832	CGC	2	6	700403	700408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958765
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13068	NC_016832	TGTT	2	8	700497	700504	0 %	75 %	25 %	0 %	378958765
13069	NC_016832	GC	3	6	700576	700581	0 %	0 %	50 %	50 %	378958765
13070	NC_016832	TCACGC	2	12	700590	700601	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378958765
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13075	NC_016832	GATC	2	8	700876	700883	25 %	25 %	25 %	25 %	378958765
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13078	NC_016832	GTC	2	6	700973	700978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958765
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13085	NC_016832	TTACC	2	10	702453	702462	20 %	40 %	0 %	40 %	378958769
13086	NC_016832	TAT	2	6	702472	702477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958769
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13089	NC_016832	A	7	7	702702	702708	100 %	0 %	0 %	0 %	378958770
13090	NC_016832	GCA	2	6	702761	702766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958771
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13092	NC_016832	CAGC	2	8	702816	702823	25 %	0 %	25 %	50 %	378958771
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13094	NC_016832	CGG	2	6	702849	702854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958771
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13098	NC_016832	A	6	6	703034	703039	100 %	0 %	0 %	0 %	378958772
13099	NC_016832	GGC	2	6	703087	703092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958772
13100	NC_016832	CGC	2	6	703185	703190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958772
13101	NC_016832	ACA	2	6	703214	703219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958772
13102	NC_016832	TGGT	2	8	703254	703261	0 %	50 %	50 %	0 %	378958772
13103	NC_016832	CCA	2	6	703329	703334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958772
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13108	NC_016832	CGT	2	6	703514	703519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958772
13109	NC_016832	CG	3	6	703528	703533	0 %	0 %	50 %	50 %	378958772
13110	NC_016832	TTA	2	6	703551	703556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958772
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13112	NC_016832	GAC	2	6	703579	703584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958772
13113	NC_016832	CTGG	2	8	703600	703607	0 %	25 %	50 %	25 %	378958772
13114	NC_016832	ATC	2	6	703676	703681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958772
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13347	NC_016832	CCAGCG	2	12	718006	718017	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378958785
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13349	NC_016832	CAG	2	6	718182	718187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958786
13350	NC_016832	GACA	2	8	718203	718210	50 %	0 %	25 %	25 %	378958786
13351	NC_016832	GGC	2	6	718215	718220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958786
13352	NC_016832	CCAG	2	8	718226	718233	25 %	0 %	25 %	50 %	378958786
13353	NC_016832	GTT	2	6	718245	718250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958786
13354	NC_016832	AAG	2	6	718263	718268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958786
13355	NC_016832	GA	3	6	718275	718280	50 %	0 %	50 %	0 %	378958786
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