MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_016832	ATC	2	6	675585	675590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958740
12502	NC_016832	CTG	2	6	675603	675608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958740
12503	NC_016832	CTC	2	6	675662	675667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958740
12504	NC_016832	CG	3	6	675742	675747	0 %	0 %	50 %	50 %	378958740
12505	NC_016832	TGA	2	6	675766	675771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958740
12506	NC_016832	TGG	2	6	675799	675804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958740
12507	NC_016832	CAG	2	6	675882	675887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958740
12508	NC_016832	TGC	2	6	675943	675948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958740
12509	NC_016832	GGT	2	6	676019	676024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958740
12510	NC_016832	CTT	2	6	676040	676045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958740
12511	NC_016832	ATG	2	6	676122	676127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958740
12512	NC_016832	GC	3	6	676198	676203	0 %	0 %	50 %	50 %	378958740
12513	NC_016832	CTG	2	6	676244	676249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958740
12514	NC_016832	TGGC	2	8	676251	676258	0 %	25 %	50 %	25 %	378958740
12515	NC_016832	CTT	2	6	676270	676275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958740
12516	NC_016832	GCG	2	6	676309	676314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958740
12517	NC_016832	CGC	2	6	676346	676351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958740
12518	NC_016832	GCG	2	6	676404	676409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958740
12519	NC_016832	GTC	2	6	676410	676415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958740
12520	NC_016832	GCC	2	6	676420	676425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958740
12521	NC_016832	CGA	2	6	676561	676566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958740
12522	NC_016832	GAC	2	6	676590	676595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958740
12523	NC_016832	ATG	2	6	676596	676601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958740
12524	NC_016832	ATC	2	6	676618	676623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958740
12525	NC_016832	CGC	2	6	676632	676637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958740
12526	NC_016832	ATG	2	6	676687	676692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958740
12527	NC_016832	GTC	2	6	676818	676823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958740
12528	NC_016832	AAC	2	6	676855	676860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958740
12529	NC_016832	A	6	6	676969	676974	100 %	0 %	0 %	0 %	378958740
12530	NC_016832	TGTC	2	8	677081	677088	0 %	50 %	25 %	25 %	378958741
12531	NC_016832	AG	3	6	677106	677111	50 %	0 %	50 %	0 %	378958741
12532	NC_016832	AGC	2	6	677119	677124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958741
12533	NC_016832	TCA	2	6	677150	677155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958741
12534	NC_016832	TCT	2	6	677165	677170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958741
12535	NC_016832	GCT	2	6	677172	677177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958741
12536	NC_016832	TGC	2	6	677189	677194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958741
12537	NC_016832	CTT	2	6	677202	677207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958741
12538	NC_016832	CT	3	6	677257	677262	0 %	50 %	0 %	50 %	378958741
12539	NC_016832	CAG	2	6	677310	677315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958741
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12541	NC_016832	TTG	2	6	677452	677457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958741
12542	NC_016832	ATA	2	6	677473	677478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958741
12543	NC_016832	GTT	2	6	677592	677597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958741
12544	NC_016832	ACA	2	6	677629	677634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958741
12545	NC_016832	GGT	2	6	677687	677692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958741
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12547	NC_016832	AT	3	6	677777	677782	50 %	50 %	0 %	0 %	378958742
12548	NC_016832	CAGCG	2	10	677902	677911	20 %	0 %	40 %	40 %	378958742
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12552	NC_016832	CCG	2	6	678017	678022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958742
12553	NC_016832	GCT	2	6	678054	678059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958742
12554	NC_016832	GTA	2	6	678072	678077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958742
12555	NC_016832	TCA	2	6	678152	678157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958742
12556	NC_016832	AAGC	2	8	678166	678173	50 %	0 %	25 %	25 %	378958742
12557	NC_016832	GCA	2	6	678282	678287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
12558	NC_016832	CG	3	6	678292	678297	0 %	0 %	50 %	50 %	378958742
12559	NC_016832	CGT	2	6	678333	678338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958742
12560	NC_016832	CAG	2	6	678340	678345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
12561	NC_016832	GC	3	6	678454	678459	0 %	0 %	50 %	50 %	378958742
12562	NC_016832	TCAT	2	8	678521	678528	25 %	50 %	0 %	25 %	378958742
12563	NC_016832	GTC	2	6	678656	678661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958742
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12566	NC_016832	CAG	2	6	678754	678759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
12567	NC_016832	GCA	2	6	678786	678791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
12568	NC_016832	GTG	2	6	678944	678949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958742
12569	NC_016832	GGC	2	6	679018	679023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958742
12570	NC_016832	CTG	2	6	679030	679035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958742
12571	NC_016832	TTC	2	6	679037	679042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958742
12572	NC_016832	CTT	2	6	679069	679074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958742
12573	NC_016832	AAT	2	6	679105	679110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958742
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12576	NC_016832	TTA	2	6	679169	679174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958742
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12579	NC_016832	CAG	2	6	679303	679308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
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12581	NC_016832	ATT	2	6	679366	679371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958742
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12583	NC_016832	TGA	2	6	679412	679417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958742
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12586	NC_016832	CAG	2	6	679465	679470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
12587	NC_016832	GCA	2	6	679476	679481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
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12589	NC_016832	CGT	2	6	679636	679641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958742
12590	NC_016832	CGG	2	6	679687	679692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958742
12591	NC_016832	CCA	2	6	679722	679727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958742
12592	NC_016832	GCCAG	2	10	679788	679797	20 %	0 %	40 %	40 %	378958742
12593	NC_016832	GAG	2	6	679808	679813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958742
12594	NC_016832	CTG	2	6	679843	679848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958742
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12596	NC_016832	CGA	2	6	679872	679877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
12597	NC_016832	AG	3	6	679909	679914	50 %	0 %	50 %	0 %	378958742
12598	NC_016832	GGTAG	2	10	679925	679934	20 %	20 %	60 %	0 %	378958742
12599	NC_016832	ATA	2	6	680107	680112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958742
12600	NC_016832	TGT	2	6	680178	680183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958742
12601	NC_016832	GTGA	2	8	680236	680243	25 %	25 %	50 %	0 %	378958742
12602	NC_016832	CAG	2	6	680317	680322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
12603	NC_016832	AAG	2	6	680339	680344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958742
12604	NC_016832	GACT	2	8	680399	680406	25 %	25 %	25 %	25 %	378958742
12605	NC_016832	CCT	2	6	681157	681162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958743
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12607	NC_016832	GGCG	2	8	681181	681188	0 %	0 %	75 %	25 %	378958743
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12614	NC_016832	CGG	2	6	681529	681534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958743
12615	NC_016832	GCA	2	6	681562	681567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958743
12616	NC_016832	CTAC	2	8	681585	681592	25 %	25 %	0 %	50 %	378958743
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12618	NC_016832	TGG	2	6	681615	681620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958743
12619	NC_016832	CTG	2	6	681695	681700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958743
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12975	NC_016832	GGC	2	6	697506	697511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958762
12976	NC_016832	TGG	2	6	697512	697517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958762
12977	NC_016832	CCT	2	6	697540	697545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958762
12978	NC_016832	TGGC	2	8	697554	697561	0 %	25 %	50 %	25 %	378958762
12979	NC_016832	CTG	2	6	697572	697577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
12980	NC_016832	GC	3	6	697601	697606	0 %	0 %	50 %	50 %	378958762
12981	NC_016832	GCT	2	6	697625	697630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
12982	NC_016832	CTG	2	6	697659	697664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
12983	NC_016832	GC	3	6	697725	697730	0 %	0 %	50 %	50 %	378958762
12984	NC_016832	CGG	2	6	697766	697771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958762
12985	NC_016832	GCT	3	9	697775	697783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
12986	NC_016832	AAC	2	6	697821	697826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958762
12987	NC_016832	GCT	3	9	697847	697855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
12988	NC_016832	CAA	2	6	697859	697864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958762
12989	NC_016832	CTG	2	6	697869	697874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
12990	NC_016832	GCC	2	6	697878	697883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958762
12991	NC_016832	TGG	2	6	697888	697893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958762
12992	NC_016832	TGC	2	6	697894	697899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
12993	NC_016832	CTG	2	6	697908	697913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
12994	NC_016832	GCTGGG	2	12	697931	697942	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378958762
12995	NC_016832	CTG	3	9	698007	698015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
12996	NC_016832	CTG	2	6	698070	698075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
12997	NC_016832	GCT	2	6	698123	698128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
12998	NC_016832	ATC	2	6	698139	698144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958762
12999	NC_016832	CGG	2	6	698152	698157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958762
13000	NC_016832	GATGGC	2	12	698162	698173	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378958762

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