MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_016832	CG	3	6	648599	648604	0 %	0 %	50 %	50 %	378958720
12003	NC_016832	TGG	2	6	648611	648616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958720
12004	NC_016832	GTCT	2	8	648630	648637	0 %	50 %	25 %	25 %	378958720
12005	NC_016832	TTA	2	6	648653	648658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958720
12006	NC_016832	TGA	2	6	648689	648694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958720
12007	NC_016832	GCCGGT	2	12	648750	648761	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378958720
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12009	NC_016832	GAA	2	6	648940	648945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958721
12010	NC_016832	GTAC	2	8	648982	648989	25 %	25 %	25 %	25 %	378958721
12011	NC_016832	AGAT	2	8	649038	649045	50 %	25 %	25 %	0 %	378958721
12012	NC_016832	CTG	2	6	649127	649132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958721
12013	NC_016832	CTG	2	6	649175	649180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958721
12014	NC_016832	TC	3	6	649189	649194	0 %	50 %	0 %	50 %	378958721
12015	NC_016832	TGC	2	6	649195	649200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958721
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12017	NC_016832	ATCT	2	8	649286	649293	25 %	50 %	0 %	25 %	378958721
12018	NC_016832	GC	3	6	649353	649358	0 %	0 %	50 %	50 %	378958721
12019	NC_016832	CGC	2	6	649380	649385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958721
12020	NC_016832	CTG	2	6	649397	649402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958721
12021	NC_016832	TGA	2	6	649501	649506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958721
12022	NC_016832	GCA	2	6	649513	649518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958721
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12044	NC_016832	GC	3	6	650538	650543	0 %	0 %	50 %	50 %	378958722
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12057	NC_016832	ATT	2	6	651481	651486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958724
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12091	NC_016832	TCCGG	2	10	653827	653836	0 %	20 %	40 %	40 %	378958725
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12102	NC_016832	CTTCA	2	10	654353	654362	20 %	40 %	0 %	40 %	378958726
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12107	NC_016832	CGTT	2	8	654480	654487	0 %	50 %	25 %	25 %	378958726
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12121	NC_016832	GGA	2	6	655067	655072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958726
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12152	NC_016832	GCA	2	6	656648	656653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958727
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12219	NC_016832	ATAC	2	8	660006	660013	50 %	25 %	0 %	25 %	378958730
12220	NC_016832	AAT	2	6	660069	660074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958730
12221	NC_016832	GAT	2	6	660116	660121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958730
12222	NC_016832	GCAGGC	2	12	660156	660167	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378958730
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12224	NC_016832	CG	3	6	660258	660263	0 %	0 %	50 %	50 %	378958730
12225	NC_016832	CGG	3	9	660287	660295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958730
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12230	NC_016832	GAAA	2	8	660634	660641	75 %	0 %	25 %	0 %	378958731
12231	NC_016832	TAT	2	6	660685	660690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958731
12232	NC_016832	T	6	6	660692	660697	0 %	100 %	0 %	0 %	378958731
12233	NC_016832	T	6	6	660699	660704	0 %	100 %	0 %	0 %	378958731
12234	NC_016832	TTA	2	6	660719	660724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958731
12235	NC_016832	GTGG	2	8	660829	660836	0 %	25 %	75 %	0 %	378958731
12236	NC_016832	CT	3	6	660866	660871	0 %	50 %	0 %	50 %	378958731
12237	NC_016832	T	6	6	660880	660885	0 %	100 %	0 %	0 %	378958731
12238	NC_016832	GCT	2	6	660928	660933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958731
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12480	NC_016832	GCT	2	6	674786	674791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958740
12481	NC_016832	T	6	6	674822	674827	0 %	100 %	0 %	0 %	378958740
12482	NC_016832	TAT	2	6	674858	674863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958740
12483	NC_016832	TGA	2	6	674864	674869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958740
12484	NC_016832	ATT	2	6	674910	674915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958740
12485	NC_016832	TGGTT	2	10	674949	674958	0 %	60 %	40 %	0 %	378958740
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12487	NC_016832	GCC	2	6	674999	675004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958740
12488	NC_016832	CGTATT	2	12	675054	675065	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378958740
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