MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016832	GC	3	6	598347	598352	0 %	0 %	50 %	50 %	378958672
11002	NC_016832	GCA	2	6	598389	598394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958672
11003	NC_016832	GGT	2	6	598441	598446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958672
11004	NC_016832	CGT	2	6	598545	598550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958672
11005	NC_016832	ATC	2	6	598568	598573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958672
11006	NC_016832	GCT	2	6	598734	598739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958672
11007	NC_016832	CGTAAA	2	12	598773	598784	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378958672
11008	NC_016832	AGA	2	6	598813	598818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958672
11009	NC_016832	TAA	2	6	598845	598850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958672
11010	NC_016832	GCG	2	6	598857	598862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958672
11011	NC_016832	GGT	2	6	598879	598884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958672
11012	NC_016832	CAC	2	6	598945	598950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958672
11013	NC_016832	GCGA	2	8	599017	599024	25 %	0 %	50 %	25 %	378958672
11014	NC_016832	CAC	2	6	599038	599043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958672
11015	NC_016832	CGA	2	6	599052	599057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958672
11016	NC_016832	CAG	2	6	599125	599130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958672
11017	NC_016832	GCC	2	6	599165	599170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958672
11018	NC_016832	TCG	2	6	599189	599194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958672
11019	NC_016832	GCA	2	6	599202	599207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958672
11020	NC_016832	TCAG	2	8	599237	599244	25 %	25 %	25 %	25 %	378958672
11021	NC_016832	CGG	2	6	599260	599265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958672
11022	NC_016832	AG	3	6	599266	599271	50 %	0 %	50 %	0 %	378958672
11023	NC_016832	ACG	2	6	599272	599277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958672
11024	NC_016832	TCA	2	6	599369	599374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958672
11025	NC_016832	GGTGTT	2	12	599422	599433	0 %	50 %	50 %	0 %	378958672
11026	NC_016832	GC	3	6	599488	599493	0 %	0 %	50 %	50 %	378958672
11027	NC_016832	GCC	2	6	599506	599511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958672
11028	NC_016832	CAG	3	9	599515	599523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958672
11029	NC_016832	AAC	2	6	599600	599605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958672
11030	NC_016832	GC	4	8	599644	599651	0 %	0 %	50 %	50 %	378958672
11031	NC_016832	CGG	2	6	599672	599677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958672
11032	NC_016832	ATG	2	6	599699	599704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958672
11033	NC_016832	GTC	2	6	599845	599850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958672
11034	NC_016832	TCA	2	6	599888	599893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958672
11035	NC_016832	TGA	2	6	599913	599918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958672
11036	NC_016832	CGC	2	6	599946	599951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958672
11037	NC_016832	GCT	2	6	599956	599961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958672
11038	NC_016832	CAC	2	6	600115	600120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958672
11039	NC_016832	GAT	2	6	600154	600159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958672
11040	NC_016832	GCC	2	6	600230	600235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958672
11041	NC_016832	CG	3	6	600250	600255	0 %	0 %	50 %	50 %	378958672
11042	NC_016832	GTG	2	6	600263	600268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958672
11043	NC_016832	CGC	2	6	600285	600290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958672
11044	NC_016832	ATA	3	9	600410	600418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958672
11045	NC_016832	TTC	2	6	600542	600547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958673
11046	NC_016832	GTTG	2	8	600548	600555	0 %	50 %	50 %	0 %	378958673
11047	NC_016832	CAC	2	6	600560	600565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958673
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11049	NC_016832	TGA	2	6	600589	600594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958673
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11052	NC_016832	GAC	2	6	600733	600738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958673
11053	NC_016832	TCT	2	6	600813	600818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958673
11054	NC_016832	TGG	2	6	600820	600825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958673
11055	NC_016832	TCAG	2	8	600864	600871	25 %	25 %	25 %	25 %	378958673
11056	NC_016832	CAG	2	6	600875	600880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958673
11057	NC_016832	TGATC	2	10	600907	600916	20 %	40 %	20 %	20 %	378958673
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11059	NC_016832	TTC	2	6	601097	601102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958673
11060	NC_016832	CGA	2	6	601173	601178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958673
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11063	NC_016832	CGC	2	6	601417	601422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958673
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11086	NC_016832	CAT	2	6	602765	602770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958676
11087	NC_016832	CGA	2	6	602837	602842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958676
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11089	NC_016832	TGCC	2	8	603017	603024	0 %	25 %	25 %	50 %	378958676
11090	NC_016832	ACC	2	6	603034	603039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958676
11091	NC_016832	ATCA	2	8	603054	603061	50 %	25 %	0 %	25 %	378958676
11092	NC_016832	GAG	2	6	603076	603081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958676
11093	NC_016832	TGGA	2	8	603116	603123	25 %	25 %	50 %	0 %	378958677
11094	NC_016832	GTTG	2	8	603126	603133	0 %	50 %	50 %	0 %	378958677
11095	NC_016832	CG	3	6	603154	603159	0 %	0 %	50 %	50 %	378958677
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11103	NC_016832	CGC	2	6	603647	603652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958677
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11106	NC_016832	AAGA	2	8	603735	603742	75 %	0 %	25 %	0 %	378958677
11107	NC_016832	TGT	2	6	603819	603824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958678
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11115	NC_016832	CTGG	2	8	604065	604072	0 %	25 %	50 %	25 %	378958678
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11119	NC_016832	GTT	2	6	604183	604188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958678
11120	NC_016832	TATGCA	2	12	604200	604211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378958678
11121	NC_016832	TGA	2	6	604229	604234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958678
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11225	NC_016832	TCGG	2	8	610308	610315	0 %	25 %	50 %	25 %	378958684
11226	NC_016832	CCGC	2	8	610318	610325	0 %	0 %	25 %	75 %	378958684
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11235	NC_016832	CTGAT	2	10	610879	610888	20 %	40 %	20 %	20 %	378958685
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11237	NC_016832	CGG	2	6	610997	611002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958685
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11239	NC_016832	TGC	3	9	611110	611118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958685
11240	NC_016832	GTG	2	6	611157	611162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958685
11241	NC_016832	ATC	2	6	611406	611411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958686
11242	NC_016832	TGA	2	6	611413	611418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958686
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11263	NC_016832	CTG	2	6	612485	612490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958686
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11341	NC_016832	GC	3	6	616383	616388	0 %	0 %	50 %	50 %	378958689
11342	NC_016832	CAAAA	2	10	616458	616467	80 %	0 %	0 %	20 %	378958689
11343	NC_016832	A	6	6	616500	616505	100 %	0 %	0 %	0 %	378958689
11344	NC_016832	GGC	2	6	616553	616558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958689
11345	NC_016832	TAT	3	9	616604	616612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958689
11346	NC_016832	ATG	2	6	616647	616652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958689
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11350	NC_016832	CGC	2	6	616763	616768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958689
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11353	NC_016832	CG	3	6	616896	616901	0 %	0 %	50 %	50 %	378958689
11354	NC_016832	CTT	2	6	616907	616912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958689
11355	NC_016832	CTA	2	6	616931	616936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958689
11356	NC_016832	GCTGGC	2	12	616963	616974	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378958689
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11361	NC_016832	GC	3	6	617165	617170	0 %	0 %	50 %	50 %	378958689
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11478	NC_016832	TGA	2	6	621841	621846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958694
11479	NC_016832	GCT	2	6	621959	621964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958694
11480	NC_016832	TTA	2	6	622297	622302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958695
11481	NC_016832	CGG	2	6	622329	622334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958695
11482	NC_016832	GGC	2	6	622441	622446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958695
11483	NC_016832	CCG	2	6	622463	622468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958695
11484	NC_016832	GCT	2	6	622554	622559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958695
11485	NC_016832	TGG	2	6	622562	622567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958695
11486	NC_016832	CTT	2	6	622635	622640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958695
11487	NC_016832	GGC	2	6	622666	622671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958695
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11489	NC_016832	ATG	2	6	622726	622731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958695
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11491	NC_016832	TTC	2	6	622813	622818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958695
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11493	NC_016832	CTG	2	6	622957	622962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958695
11494	NC_016832	CTT	2	6	622971	622976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958695
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11499	NC_016832	CTG	2	6	623104	623109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958695
11500	NC_016832	CGG	2	6	623141	623146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958695

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