MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016832	GTA	2	6	546256	546261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958619
10002	NC_016832	GGT	2	6	546265	546270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958619
10003	NC_016832	CGG	2	6	546330	546335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958619
10004	NC_016832	CGC	2	6	546480	546485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958619
10005	NC_016832	CG	5	10	546769	546778	0 %	0 %	50 %	50 %	378958619
10006	NC_016832	GCC	2	6	546883	546888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958619
10007	NC_016832	C	6	6	546942	546947	0 %	0 %	0 %	100 %	378958619
10008	NC_016832	CGA	2	6	547031	547036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958619
10009	NC_016832	CAT	2	6	547149	547154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958619
10010	NC_016832	GAA	2	6	547199	547204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958619
10011	NC_016832	GAT	2	6	547246	547251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958619
10012	NC_016832	ACTGCG	2	12	547256	547267	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378958619
10013	NC_016832	TGA	2	6	547690	547695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958620
10014	NC_016832	TGC	2	6	547706	547711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958620
10015	NC_016832	CAT	2	6	547729	547734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958620
10016	NC_016832	GGC	2	6	547804	547809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958620
10017	NC_016832	TGG	2	6	548262	548267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958621
10018	NC_016832	GCT	2	6	548275	548280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958621
10019	NC_016832	GC	3	6	548282	548287	0 %	0 %	50 %	50 %	378958621
10020	NC_016832	GTA	2	6	548333	548338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958621
10021	NC_016832	GC	3	6	548363	548368	0 %	0 %	50 %	50 %	378958621
10022	NC_016832	GAAT	2	8	548388	548395	50 %	25 %	25 %	0 %	378958621
10023	NC_016832	CCA	2	6	548433	548438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958621
10024	NC_016832	CG	3	6	548489	548494	0 %	0 %	50 %	50 %	378958621
10025	NC_016832	GGC	2	6	548504	548509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958621
10026	NC_016832	TCG	3	9	548516	548524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958621
10027	NC_016832	GAC	2	6	548587	548592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958621
10028	NC_016832	T	6	6	548610	548615	0 %	100 %	0 %	0 %	378958621
10029	NC_016832	CTG	2	6	548636	548641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958621
10030	NC_016832	TCC	2	6	548647	548652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958621
10031	NC_016832	CCG	2	6	548694	548699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958621
10032	NC_016832	CAG	2	6	548735	548740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958621
10033	NC_016832	GC	3	6	548767	548772	0 %	0 %	50 %	50 %	378958621
10034	NC_016832	GAA	2	6	548804	548809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958621
10035	NC_016832	TGA	2	6	548811	548816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958621
10036	NC_016832	GCC	2	6	548827	548832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958621
10037	NC_016832	AGA	2	6	548851	548856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958621
10038	NC_016832	CAA	2	6	548857	548862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958621
10039	NC_016832	CCG	2	6	548937	548942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958621
10040	NC_016832	GCC	2	6	548972	548977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958621
10041	NC_016832	TGA	2	6	548985	548990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958621
10042	NC_016832	GGCC	2	8	549087	549094	0 %	0 %	50 %	50 %	378958621
10043	NC_016832	CGC	2	6	549102	549107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958621
10044	NC_016832	CATG	2	8	549157	549164	25 %	25 %	25 %	25 %	378958621
10045	NC_016832	CTG	2	6	549200	549205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958621
10046	NC_016832	CGG	2	6	549286	549291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958621
10047	NC_016832	GC	3	6	549327	549332	0 %	0 %	50 %	50 %	378958621
10048	NC_016832	GAT	2	6	549334	549339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958621
10049	NC_016832	GCG	2	6	549419	549424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958621
10050	NC_016832	AAT	2	6	549441	549446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958621
10051	NC_016832	GCGT	2	8	549473	549480	0 %	25 %	50 %	25 %	378958622
10052	NC_016832	GTT	2	6	549607	549612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958622
10053	NC_016832	CAA	2	6	549715	549720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958622
10054	NC_016832	CGC	2	6	549759	549764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958622
10055	NC_016832	G	6	6	549783	549788	0 %	0 %	100 %	0 %	378958622
10056	NC_016832	TGG	2	6	549917	549922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958622
10057	NC_016832	TGA	2	6	549999	550004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958622
10058	NC_016832	A	6	6	550051	550056	100 %	0 %	0 %	0 %	378958622
10059	NC_016832	GC	4	8	550116	550123	0 %	0 %	50 %	50 %	378958622
10060	NC_016832	A	6	6	550157	550162	100 %	0 %	0 %	0 %	378958622
10061	NC_016832	GCA	2	6	550226	550231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958622
10062	NC_016832	GC	4	8	550252	550259	0 %	0 %	50 %	50 %	378958622
10063	NC_016832	CGC	2	6	550280	550285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958622
10064	NC_016832	GC	3	6	550299	550304	0 %	0 %	50 %	50 %	378958622
10065	NC_016832	T	8	8	550307	550314	0 %	100 %	0 %	0 %	378958622
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10067	NC_016832	GCCCG	2	10	550356	550365	0 %	0 %	40 %	60 %	378958622
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10072	NC_016832	ACA	2	6	550653	550658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958622
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10082	NC_016832	CTGA	2	8	550972	550979	25 %	25 %	25 %	25 %	378958622
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10087	NC_016832	TGT	2	6	551136	551141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958622
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10089	NC_016832	A	6	6	551224	551229	100 %	0 %	0 %	0 %	378958622
10090	NC_016832	GCA	2	6	551289	551294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958622
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10092	NC_016832	CGA	2	6	551346	551351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958622
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10094	NC_016832	CCG	2	6	551410	551415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958622
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10099	NC_016832	CGC	2	6	552171	552176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958623
10100	NC_016832	ACG	2	6	552185	552190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958623
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10103	NC_016832	CAG	2	6	552380	552385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958624
10104	NC_016832	CGC	2	6	552394	552399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958624
10105	NC_016832	TGA	2	6	552417	552422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958624
10106	NC_016832	TGC	2	6	552441	552446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958624
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10108	NC_016832	CATG	2	8	552493	552500	25 %	25 %	25 %	25 %	378958624
10109	NC_016832	A	6	6	552511	552516	100 %	0 %	0 %	0 %	378958624
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10119	NC_016832	GGA	2	6	553231	553236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958625
10120	NC_016832	CG	3	6	553246	553251	0 %	0 %	50 %	50 %	378958625
10121	NC_016832	CGAG	2	8	553282	553289	25 %	0 %	50 %	25 %	378958625
10122	NC_016832	TCG	2	6	553294	553299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958625
10123	NC_016832	TGA	2	6	553369	553374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958625
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10125	NC_016832	TTA	2	6	553434	553439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958625
10126	NC_016832	AT	3	6	553453	553458	50 %	50 %	0 %	0 %	378958625
10127	NC_016832	CATCGC	2	12	553486	553497	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378958625
10128	NC_016832	GCTG	2	8	553555	553562	0 %	25 %	50 %	25 %	378958625
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10224	NC_016832	CAGC	2	8	558434	558441	25 %	0 %	25 %	50 %	378958630
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10229	NC_016832	CATCC	2	10	558580	558589	20 %	20 %	0 %	60 %	378958630
10230	NC_016832	CGC	2	6	558601	558606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958630
10231	NC_016832	GGGCA	2	10	558629	558638	20 %	0 %	60 %	20 %	378958630
10232	NC_016832	GGC	2	6	558689	558694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958630
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10234	NC_016832	GGGC	2	8	558751	558758	0 %	0 %	75 %	25 %	378958630
10235	NC_016832	ATC	2	6	558761	558766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958630
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10237	NC_016832	GCC	3	9	558833	558841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958630
10238	NC_016832	GTT	2	6	558913	558918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958630
10239	NC_016832	GACG	2	8	559000	559007	25 %	0 %	50 %	25 %	378958630
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10482	NC_016832	GAC	2	6	572071	572076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958644
10483	NC_016832	CG	3	6	572102	572107	0 %	0 %	50 %	50 %	378958644
10484	NC_016832	CGG	2	6	572114	572119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958644
10485	NC_016832	AAC	2	6	572120	572125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958644
10486	NC_016832	AGA	2	6	572205	572210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958644
10487	NC_016832	CTG	2	6	572357	572362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958645
10488	NC_016832	TGC	2	6	572395	572400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958645
10489	NC_016832	TGA	2	6	572431	572436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958645
10490	NC_016832	ATG	2	6	572444	572449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958645
10491	NC_016832	GCC	2	6	572479	572484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958645
10492	NC_016832	GGC	2	6	572491	572496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958645
10493	NC_016832	GCGG	2	8	572506	572513	0 %	0 %	75 %	25 %	378958645
10494	NC_016832	AAGCCG	2	12	572615	572626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958645
10495	NC_016832	CGC	2	6	572676	572681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958645
10496	NC_016832	CGA	2	6	572692	572697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958645
10497	NC_016832	GC	3	6	572739	572744	0 %	0 %	50 %	50 %	378958645
10498	NC_016832	CCG	2	6	572790	572795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958645
10499	NC_016832	TCG	2	6	572853	572858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958645
10500	NC_016832	AAGAT	2	10	572874	572883	60 %	20 %	20 %	0 %	378958645

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