MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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79002	NC_016832	AAT	2	6	4435464	4435469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962468
79003	NC_016832	TAA	2	6	4435481	4435486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962468
79004	NC_016832	A	6	6	4435501	4435506	100 %	0 %	0 %	0 %	378962468
79005	NC_016832	GAA	2	6	4435542	4435547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962468
79006	NC_016832	AGG	2	6	4435564	4435569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378962468
79007	NC_016832	G	6	6	4435585	4435590	0 %	0 %	100 %	0 %	378962468
79008	NC_016832	GCA	2	6	4435593	4435598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962468
79009	NC_016832	TGA	2	6	4435663	4435668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962468
79010	NC_016832	AGG	2	6	4435727	4435732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378962468
79011	NC_016832	TTG	2	6	4435753	4435758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962468
79012	NC_016832	ATTG	2	8	4435823	4435830	25 %	50 %	25 %	0 %	378962468
79013	NC_016832	TACC	2	8	4435859	4435866	25 %	25 %	0 %	50 %	378962468
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79016	NC_016832	CTGG	2	8	4436921	4436928	0 %	25 %	50 %	25 %	378962469
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79232	NC_016832	TCA	2	6	4450007	4450012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962483
79233	NC_016832	GCT	2	6	4450063	4450068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962483
79234	NC_016832	GCT	2	6	4450105	4450110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962483
79235	NC_016832	TCA	2	6	4450169	4450174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962483
79236	NC_016832	TGT	2	6	4450191	4450196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962483
79237	NC_016832	T	6	6	4450238	4450243	0 %	100 %	0 %	0 %	378962483
79238	NC_016832	CAT	2	6	4450275	4450280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962483
79239	NC_016832	TTCTGA	2	12	4450308	4450319	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378962483
79240	NC_016832	AGT	2	6	4450353	4450358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962483
79241	NC_016832	GCC	2	6	4450366	4450371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962483
79242	NC_016832	AG	3	6	4450396	4450401	50 %	0 %	50 %	0 %	378962483
79243	NC_016832	CAG	2	6	4450559	4450564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962483
79244	NC_016832	AGCTC	2	10	4450582	4450591	20 %	20 %	20 %	40 %	378962483
79245	NC_016832	GCC	2	6	4450597	4450602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962483
79246	NC_016832	GTTT	2	8	4450675	4450682	0 %	75 %	25 %	0 %	378962483
79247	NC_016832	T	7	7	4450680	4450686	0 %	100 %	0 %	0 %	378962483
79248	NC_016832	AGA	2	6	4450701	4450706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962483
79249	NC_016832	CG	3	6	4450712	4450717	0 %	0 %	50 %	50 %	378962483
79250	NC_016832	TCA	2	6	4450718	4450723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962483
79251	NC_016832	AGCC	2	8	4450874	4450881	25 %	0 %	25 %	50 %	378962483
79252	NC_016832	TTA	2	6	4450945	4450950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962483
79253	NC_016832	GCC	2	6	4450989	4450994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962484
79254	NC_016832	TCAG	2	8	4451006	4451013	25 %	25 %	25 %	25 %	378962484
79255	NC_016832	TGG	2	6	4451052	4451057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962484
79256	NC_016832	CCA	2	6	4451067	4451072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962484
79257	NC_016832	CAA	2	6	4451121	4451126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962485
79258	NC_016832	A	6	6	4451125	4451130	100 %	0 %	0 %	0 %	378962485
79259	NC_016832	CAC	2	6	4451133	4451138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962485
79260	NC_016832	CGG	2	6	4451162	4451167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962485
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79262	NC_016832	TCCATA	2	12	4451245	4451256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962485
79263	NC_016832	GC	3	6	4451282	4451287	0 %	0 %	50 %	50 %	378962485
79264	NC_016832	GCA	2	6	4451303	4451308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962485
79265	NC_016832	ATG	2	6	4451338	4451343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962485
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79267	NC_016832	TTC	2	6	4451466	4451471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962486
79268	NC_016832	CGC	2	6	4451483	4451488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962486
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79337	NC_016832	CCA	2	6	4455967	4455972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962491
79338	NC_016832	CGC	2	6	4456031	4456036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962491
79339	NC_016832	GCA	2	6	4456110	4456115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962491
79340	NC_016832	GTC	2	6	4456133	4456138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962491
79341	NC_016832	ATC	2	6	4456166	4456171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962491
79342	NC_016832	ACT	2	6	4456194	4456199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962491
79343	NC_016832	TGC	2	6	4456231	4456236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962491
79344	NC_016832	TCA	2	6	4456341	4456346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962491
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