MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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77002	NC_016832	CA	3	6	4307766	4307771	50 %	0 %	0 %	50 %	378962353
77003	NC_016832	GGC	2	6	4307773	4307778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962353
77004	NC_016832	GGA	2	6	4307809	4307814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378962353
77005	NC_016832	CGC	2	6	4307909	4307914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962353
77006	NC_016832	TGG	2	6	4307915	4307920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962353
77007	NC_016832	TGA	2	6	4307982	4307987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962353
77008	NC_016832	CTAA	2	8	4307992	4307999	50 %	25 %	0 %	25 %	378962353
77009	NC_016832	CGG	2	6	4308032	4308037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962353
77010	NC_016832	AC	3	6	4308150	4308155	50 %	0 %	0 %	50 %	378962353
77011	NC_016832	GAT	2	6	4308262	4308267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962353
77012	NC_016832	GAT	2	6	4308283	4308288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962353
77013	NC_016832	GGA	2	6	4308409	4308414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378962353
77014	NC_016832	GGA	2	6	4308474	4308479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378962353
77015	NC_016832	CGGG	2	8	4308481	4308488	0 %	0 %	75 %	25 %	378962353
77016	NC_016832	CGTC	2	8	4308496	4308503	0 %	25 %	25 %	50 %	378962353
77017	NC_016832	CGC	2	6	4308506	4308511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962353
77018	NC_016832	GCG	2	6	4308569	4308574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962353
77019	NC_016832	GAT	2	6	4308631	4308636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962353
77020	NC_016832	TTC	2	6	4308647	4308652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962353
77021	NC_016832	CGG	2	6	4308663	4308668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962353
77022	NC_016832	TGAC	2	8	4308770	4308777	25 %	25 %	25 %	25 %	378962353
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77024	NC_016832	GTT	2	6	4308828	4308833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962353
77025	NC_016832	GGT	2	6	4308990	4308995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962353
77026	NC_016832	GGC	2	6	4309161	4309166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962353
77027	NC_016832	GATT	2	8	4309236	4309243	25 %	50 %	25 %	0 %	378962353
77028	NC_016832	CG	3	6	4309253	4309258	0 %	0 %	50 %	50 %	378962353
77029	NC_016832	GCG	2	6	4309300	4309305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962353
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77031	NC_016832	GTC	2	6	4309546	4309551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962354
77032	NC_016832	TGG	2	6	4309572	4309577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962354
77033	NC_016832	ATA	2	6	4309793	4309798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962354
77034	NC_016832	GTG	2	6	4309861	4309866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962354
77035	NC_016832	TGT	2	6	4310013	4310018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962354
77036	NC_016832	GATA	2	8	4310019	4310026	50 %	25 %	25 %	0 %	378962354
77037	NC_016832	TGA	2	6	4310130	4310135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962354
77038	NC_016832	CGC	2	6	4310166	4310171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962354
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77040	NC_016832	AC	3	6	4310247	4310252	50 %	0 %	0 %	50 %	378962354
77041	NC_016832	CCCA	2	8	4310353	4310360	25 %	0 %	0 %	75 %	378962354
77042	NC_016832	TGA	2	6	4310370	4310375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962354
77043	NC_016832	TAT	2	6	4310415	4310420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962354
77044	NC_016832	ATG	2	6	4310435	4310440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962354
77045	NC_016832	CA	3	6	4310444	4310449	50 %	0 %	0 %	50 %	378962354
77046	NC_016832	G	6	6	4310494	4310499	0 %	0 %	100 %	0 %	378962354
77047	NC_016832	AAC	2	6	4310646	4310651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962354
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77049	NC_016832	TGA	2	6	4310721	4310726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962354
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77051	NC_016832	CGT	2	6	4310928	4310933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962354
77052	NC_016832	GAC	2	6	4310941	4310946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962354
77053	NC_016832	TAA	2	6	4311078	4311083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962354
77054	NC_016832	TGGA	2	8	4311113	4311120	25 %	25 %	50 %	0 %	378962354
77055	NC_016832	AAATAG	2	12	4311128	4311139	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378962354
77056	NC_016832	TAA	2	6	4311159	4311164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962354
77057	NC_016832	GAT	2	6	4311235	4311240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962354
77058	NC_016832	ATA	2	6	4311260	4311265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962354
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77085	NC_016832	AT	3	6	4312431	4312436	50 %	50 %	0 %	0 %	378962354
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77088	NC_016832	AG	3	6	4312627	4312632	50 %	0 %	50 %	0 %	378962354
77089	NC_016832	TGA	2	6	4312698	4312703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962354
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77092	NC_016832	GTA	2	6	4312871	4312876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962354
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77099	NC_016832	CT	3	6	4313287	4313292	0 %	50 %	0 %	50 %	378962354
77100	NC_016832	GTT	2	6	4313374	4313379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962354
77101	NC_016832	GC	4	8	4313403	4313410	0 %	0 %	50 %	50 %	378962354
77102	NC_016832	CTG	2	6	4313416	4313421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962354
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77106	NC_016832	TGTGCT	2	12	4313667	4313678	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378962354
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77111	NC_016832	AT	4	8	4314178	4314185	50 %	50 %	0 %	0 %	378962354
77112	NC_016832	ACG	2	6	4314193	4314198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962354
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77468	NC_016832	CTG	2	6	4333458	4333463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962369
77469	NC_016832	CG	3	6	4333485	4333490	0 %	0 %	50 %	50 %	378962369
77470	NC_016832	CAA	2	6	4333498	4333503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962369
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77494	NC_016832	GC	3	6	4335244	4335249	0 %	0 %	50 %	50 %	378962371
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