MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
75001	NC_016832	GCA	2	6	4199007	4199012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962236
75002	NC_016832	CGG	2	6	4199039	4199044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962236
75003	NC_016832	TCG	2	6	4199049	4199054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962236
75004	NC_016832	TAT	2	6	4199058	4199063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962236
75005	NC_016832	TGA	2	6	4199064	4199069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962236
75006	NC_016832	GC	3	6	4199138	4199143	0 %	0 %	50 %	50 %	378962236
75007	NC_016832	TC	3	6	4199155	4199160	0 %	50 %	0 %	50 %	378962236
75008	NC_016832	GTG	2	6	4199173	4199178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962236
75009	NC_016832	CGC	2	6	4199218	4199223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962237
75010	NC_016832	GCT	2	6	4199258	4199263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962237
75011	NC_016832	T	6	6	4199298	4199303	0 %	100 %	0 %	0 %	378962237
75012	NC_016832	TTA	2	6	4199325	4199330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962237
75013	NC_016832	ACGCC	2	10	4199473	4199482	20 %	0 %	20 %	60 %	378962237
75014	NC_016832	CGC	2	6	4199502	4199507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962237
75015	NC_016832	ATG	2	6	4199521	4199526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962237
75016	NC_016832	TGC	2	6	4199552	4199557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962238
75017	NC_016832	TACCT	2	10	4199559	4199568	20 %	40 %	0 %	40 %	378962238
75018	NC_016832	TGC	2	6	4199600	4199605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962238
75019	NC_016832	TGC	2	6	4199633	4199638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962238
75020	NC_016832	AGA	2	6	4199724	4199729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962238
75021	NC_016832	GGT	2	6	4199749	4199754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962238
75022	NC_016832	GTC	2	6	4199770	4199775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962238
75023	NC_016832	TA	3	6	4200073	4200078	50 %	50 %	0 %	0 %	378962239
75024	NC_016832	A	6	6	4200090	4200095	100 %	0 %	0 %	0 %	378962239
75025	NC_016832	GGT	2	6	4200165	4200170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962239
75026	NC_016832	TGATCC	2	12	4200199	4200210	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378962239
75027	NC_016832	GC	3	6	4200262	4200267	0 %	0 %	50 %	50 %	378962239
75028	NC_016832	AAGC	2	8	4200294	4200301	50 %	0 %	25 %	25 %	378962239
75029	NC_016832	CGT	2	6	4200440	4200445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962240
75030	NC_016832	CTG	2	6	4200497	4200502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962240
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75032	NC_016832	AATC	2	8	4200552	4200559	50 %	25 %	0 %	25 %	378962240
75033	NC_016832	GC	3	6	4200567	4200572	0 %	0 %	50 %	50 %	378962240
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75037	NC_016832	CGT	2	6	4200716	4200721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962240
75038	NC_016832	GCT	2	6	4200752	4200757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962240
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75042	NC_016832	ACA	2	6	4201010	4201015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962241
75043	NC_016832	ACT	2	6	4201073	4201078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962241
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75046	NC_016832	ACT	2	6	4201202	4201207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962241
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75048	NC_016832	CGCAT	2	10	4201242	4201251	20 %	20 %	20 %	40 %	378962241
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75051	NC_016832	CAAA	2	8	4201389	4201396	75 %	0 %	0 %	25 %	378962241
75052	NC_016832	CGTT	2	8	4201416	4201423	0 %	50 %	25 %	25 %	378962241
75053	NC_016832	GTT	2	6	4201460	4201465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962241
75054	NC_016832	GAA	2	6	4201526	4201531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962241
75055	NC_016832	GTT	2	6	4201544	4201549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962241
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75058	NC_016832	ACTG	2	8	4201726	4201733	25 %	25 %	25 %	25 %	378962241
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75067	NC_016832	GCT	2	6	4202150	4202155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962241
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75088	NC_016832	TGC	2	6	4203312	4203317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962242
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75115	NC_016832	GTT	2	6	4204264	4204269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962242
75116	NC_016832	GAC	2	6	4204294	4204299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962242
75117	NC_016832	GGC	2	6	4204324	4204329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962242
75118	NC_016832	GTT	2	6	4204348	4204353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962242
75119	NC_016832	GTTT	2	8	4204562	4204569	0 %	75 %	25 %	0 %	378962243
75120	NC_016832	A	7	7	4204589	4204595	100 %	0 %	0 %	0 %	378962243
75121	NC_016832	CGCGC	2	10	4204685	4204694	0 %	0 %	40 %	60 %	378962243
75122	NC_016832	TTC	2	6	4204899	4204904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962244
75123	NC_016832	ATG	2	6	4204944	4204949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962244
75124	NC_016832	TGA	2	6	4204969	4204974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962244
75125	NC_016832	TATTT	2	10	4205005	4205014	20 %	80 %	0 %	0 %	378962244
75126	NC_016832	ATG	2	6	4205177	4205182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962244
75127	NC_016832	CGA	2	6	4205197	4205202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962244
75128	NC_016832	CTGG	2	8	4205218	4205225	0 %	25 %	50 %	25 %	378962244
75129	NC_016832	GAAA	2	8	4205307	4205314	75 %	0 %	25 %	0 %	378962245
75130	NC_016832	GCCA	2	8	4205345	4205352	25 %	0 %	25 %	50 %	378962245
75131	NC_016832	TTA	2	6	4205373	4205378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962245
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75133	NC_016832	GCA	2	6	4205489	4205494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962245
75134	NC_016832	GGCA	2	8	4205618	4205625	25 %	0 %	50 %	25 %	378962245
75135	NC_016832	ACC	2	6	4205644	4205649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962245
75136	NC_016832	CG	3	6	4205693	4205698	0 %	0 %	50 %	50 %	378962245
75137	NC_016832	TAA	2	6	4205713	4205718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962245
75138	NC_016832	ACG	2	6	4205724	4205729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962245
75139	NC_016832	A	6	6	4205733	4205738	100 %	0 %	0 %	0 %	378962245
75140	NC_016832	CAA	2	6	4205754	4205759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962245
75141	NC_016832	ATC	2	6	4206183	4206188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962246
75142	NC_016832	GATC	2	8	4206193	4206200	25 %	25 %	25 %	25 %	378962246
75143	NC_016832	TCG	2	6	4206216	4206221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962246
75144	NC_016832	TC	3	6	4206300	4206305	0 %	50 %	0 %	50 %	378962246
75145	NC_016832	GC	3	6	4206323	4206328	0 %	0 %	50 %	50 %	378962246
75146	NC_016832	A	6	6	4206505	4206510	100 %	0 %	0 %	0 %	378962247
75147	NC_016832	TAC	2	6	4206636	4206641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962247
75148	NC_016832	A	6	6	4206649	4206654	100 %	0 %	0 %	0 %	378962247
75149	NC_016832	GAA	2	6	4206748	4206753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962247
75150	NC_016832	A	6	6	4206799	4206804	100 %	0 %	0 %	0 %	378962247
75151	NC_016832	TAAAGG	2	12	4206825	4206836	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378962247
75152	NC_016832	GTA	2	6	4207015	4207020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962247
75153	NC_016832	CTG	3	9	4207042	4207050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962247
75154	NC_016832	GTG	2	6	4207058	4207063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962247
75155	NC_016832	GC	3	6	4207155	4207160	0 %	0 %	50 %	50 %	378962248
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75162	NC_016832	GCT	2	6	4207522	4207527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962248
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75175	NC_016832	AAG	2	6	4207991	4207996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962249
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75220	NC_016832	AGC	2	6	4210384	4210389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962254
75221	NC_016832	CGT	2	6	4210391	4210396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962254
75222	NC_016832	GTAAAG	2	12	4210491	4210502	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378962254
75223	NC_016832	GCA	2	6	4210601	4210606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962254
75224	NC_016832	ACC	2	6	4210625	4210630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962254
75225	NC_016832	CTG	2	6	4210714	4210719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962255
75226	NC_016832	CGT	2	6	4210792	4210797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962255
75227	NC_016832	ACTG	2	8	4210821	4210828	25 %	25 %	25 %	25 %	378962255
75228	NC_016832	TTG	3	9	4210906	4210914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962256
75229	NC_016832	TCA	2	6	4210954	4210959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962256
75230	NC_016832	AAC	2	6	4210992	4210997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962256
75231	NC_016832	CAT	2	6	4211373	4211378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962257
75232	NC_016832	AAG	2	6	4211393	4211398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962257
75233	NC_016832	A	6	6	4211419	4211424	100 %	0 %	0 %	0 %	378962257
75234	NC_016832	GTG	2	6	4211446	4211451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962257
75235	NC_016832	AAG	2	6	4211458	4211463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962257
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75332	NC_016832	TGC	2	6	4216088	4216093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962267
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75342	NC_016832	GTT	2	6	4216539	4216544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962267
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75492	NC_016832	CTG	2	6	4225089	4225094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962279
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