MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 84826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_016832	ACA	2	6	346995	347000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958447
6502	NC_016832	ATG	2	6	347004	347009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958447
6503	NC_016832	CCA	2	6	347013	347018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958447
6504	NC_016832	GCATT	2	10	347265	347274	20 %	40 %	20 %	20 %	378958448
6505	NC_016832	GCTG	2	8	347281	347288	0 %	25 %	50 %	25 %	378958448
6506	NC_016832	CTT	2	6	347309	347314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958448
6507	NC_016832	TCT	2	6	347387	347392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958448
6508	NC_016832	CG	3	6	347411	347416	0 %	0 %	50 %	50 %	378958448
6509	NC_016832	TGG	2	6	347551	347556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958448
6510	NC_016832	CTT	2	6	347576	347581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958448
6511	NC_016832	CAC	2	6	347584	347589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958448
6512	NC_016832	TGT	2	6	347782	347787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958448
6513	NC_016832	GCC	2	6	347801	347806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958448
6514	NC_016832	CAG	2	6	347823	347828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958448
6515	NC_016832	TGG	2	6	347860	347865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958448
6516	NC_016832	TGC	2	6	347899	347904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958448
6517	NC_016832	CGC	2	6	347915	347920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958448
6518	NC_016832	CTA	2	6	347921	347926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958448
6519	NC_016832	GGCT	2	8	347954	347961	0 %	25 %	50 %	25 %	378958448
6520	NC_016832	CGG	2	6	347971	347976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958448
6521	NC_016832	GTG	2	6	348000	348005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958448
6522	NC_016832	CCG	2	6	348044	348049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958448
6523	NC_016832	CTG	2	6	348079	348084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958448
6524	NC_016832	TG	3	6	348083	348088	0 %	50 %	50 %	0 %	378958448
6525	NC_016832	GGC	2	6	348267	348272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958448
6526	NC_016832	GCG	3	9	348322	348330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958448
6527	NC_016832	TGG	2	6	348349	348354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958448
6528	NC_016832	CTTC	2	8	348368	348375	0 %	50 %	0 %	50 %	378958448
6529	NC_016832	CTG	3	9	348420	348428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958449
6530	NC_016832	GCG	2	6	348485	348490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958449
6531	NC_016832	CGC	2	6	348518	348523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958449
6532	NC_016832	TGC	2	6	348601	348606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958449
6533	NC_016832	CAT	2	6	348626	348631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958449
6534	NC_016832	TC	3	6	348657	348662	0 %	50 %	0 %	50 %	378958449
6535	NC_016832	CCA	2	6	348707	348712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958449
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6537	NC_016832	TAT	2	6	348827	348832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958449
6538	NC_016832	TCG	2	6	348907	348912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958449
6539	NC_016832	GCA	2	6	348944	348949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958449
6540	NC_016832	TGC	2	6	348976	348981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958449
6541	NC_016832	TCGGG	2	10	349004	349013	0 %	20 %	60 %	20 %	378958449
6542	NC_016832	GAC	2	6	349094	349099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958449
6543	NC_016832	CTG	2	6	349146	349151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958449
6544	NC_016832	CGG	2	6	349258	349263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958449
6545	NC_016832	TGA	2	6	349274	349279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958449
6546	NC_016832	CG	3	6	349312	349317	0 %	0 %	50 %	50 %	378958449
6547	NC_016832	GCT	2	6	349325	349330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958449
6548	NC_016832	T	6	6	349339	349344	0 %	100 %	0 %	0 %	378958449
6549	NC_016832	AAAGGC	2	12	349412	349423	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378958449
6550	NC_016832	TGT	2	6	349470	349475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958449
6551	NC_016832	GAT	2	6	349487	349492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958449
6552	NC_016832	ATC	3	9	349539	349547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958449
6553	NC_016832	GC	3	6	349559	349564	0 %	0 %	50 %	50 %	378958449
6554	NC_016832	GCG	2	6	349623	349628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958449
6555	NC_016832	TGG	2	6	349650	349655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958449
6556	NC_016832	CAT	2	6	349668	349673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958449
6557	NC_016832	GAG	2	6	349764	349769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958450
6558	NC_016832	GGC	3	9	349855	349863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958450
6559	NC_016832	GGT	2	6	349897	349902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958450
6560	NC_016832	CCG	2	6	349962	349967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958450
6561	NC_016832	CTG	2	6	349970	349975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958450
6562	NC_016832	GGC	2	6	350023	350028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958450
6563	NC_016832	GCA	2	6	350053	350058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958450
6564	NC_016832	GCTG	2	8	350170	350177	0 %	25 %	50 %	25 %	378958450
6565	NC_016832	TTA	2	6	350230	350235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958450
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6570	NC_016832	CGC	2	6	351509	351514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958451
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6574	NC_016832	CG	3	6	351680	351685	0 %	0 %	50 %	50 %	378958451
6575	NC_016832	GCCAG	2	10	351746	351755	20 %	0 %	40 %	40 %	378958451
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6581	NC_016832	CGCCA	2	10	351915	351924	20 %	0 %	20 %	60 %	378958451
6582	NC_016832	CAA	2	6	351974	351979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958451
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6586	NC_016832	GAA	2	6	352172	352177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958451
6587	NC_016832	CAGCG	2	10	352185	352194	20 %	0 %	40 %	40 %	378958451
6588	NC_016832	CCG	2	6	352327	352332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958451
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6593	NC_016832	ATT	2	6	352622	352627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958452
6594	NC_016832	GGC	2	6	352628	352633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958452
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6602	NC_016832	CG	3	6	353094	353099	0 %	0 %	50 %	50 %	378958452
6603	NC_016832	CAA	2	6	353112	353117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958452
6604	NC_016832	GCG	2	6	353169	353174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958452
6605	NC_016832	CGC	2	6	353203	353208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958452
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6621	NC_016832	GGC	2	6	353830	353835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958453
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6988	NC_016832	CGC	2	6	372211	372216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958473
6989	NC_016832	GCC	2	6	372326	372331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958473
6990	NC_016832	AGCC	2	8	372353	372360	25 %	0 %	25 %	50 %	378958473
6991	NC_016832	AGC	2	6	372380	372385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958473
6992	NC_016832	GCG	2	6	372489	372494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958473
6993	NC_016832	CTGGT	2	10	372503	372512	0 %	40 %	40 %	20 %	378958473
6994	NC_016832	TGG	3	9	372549	372557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958473
6995	NC_016832	GCTGGA	2	12	372574	372585	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378958473
6996	NC_016832	CAG	2	6	372604	372609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958473
6997	NC_016832	GCA	2	6	372661	372666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958473
6998	NC_016832	CGA	2	6	372694	372699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958473
6999	NC_016832	CGT	2	6	372715	372720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958473
7000	NC_016832	GC	4	8	372758	372765	0 %	0 %	50 %	50 %	378958473

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