MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_016831	CG	3	6	2846562	2846567	0 %	0 %	50 %	50 %	378956458
48002	NC_016831	GTA	2	6	2846716	2846721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956458
48003	NC_016831	ATA	2	6	2847012	2847017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378956459
48004	NC_016831	GCA	2	6	2847087	2847092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956459
48005	NC_016831	GAA	2	6	2847116	2847121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378956459
48006	NC_016831	CAT	3	9	2847214	2847222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956459
48007	NC_016831	GAA	2	6	2847233	2847238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378956459
48008	NC_016831	GC	3	6	2847249	2847254	0 %	0 %	50 %	50 %	378956459
48009	NC_016831	CCATCA	2	12	2847328	2847339	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	378956459
48010	NC_016831	GGAAT	2	10	2847343	2847352	40 %	20 %	40 %	0 %	378956459
48011	NC_016831	GGT	2	6	2847358	2847363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378956459
48012	NC_016831	CGGCAA	2	12	2847388	2847399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956459
48013	NC_016831	TGC	2	6	2847426	2847431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956459
48014	NC_016831	ATG	2	6	2847446	2847451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956459
48015	NC_016831	ACG	2	6	2847486	2847491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956459
48016	NC_016831	ACT	2	6	2847504	2847509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956459
48017	NC_016831	CGA	2	6	2847511	2847516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956459
48018	NC_016831	ATG	2	6	2847528	2847533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956459
48019	NC_016831	CTA	2	6	2847571	2847576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956459
48020	NC_016831	GGC	2	6	2847727	2847732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956459
48021	NC_016831	ATG	2	6	2847791	2847796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956459
48022	NC_016831	AAC	2	6	2847938	2847943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378956459
48023	NC_016831	TGA	2	6	2847945	2847950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956459
48024	NC_016831	CTGGT	2	10	2847963	2847972	0 %	40 %	40 %	20 %	378956459
48025	NC_016831	CAA	2	6	2848000	2848005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378956459
48026	NC_016831	GCG	3	9	2848038	2848046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956459
48027	NC_016831	CG	3	6	2848168	2848173	0 %	0 %	50 %	50 %	378956459
48028	NC_016831	CA	3	6	2848204	2848209	50 %	0 %	0 %	50 %	378956459
48029	NC_016831	GAA	2	6	2848226	2848231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378956459
48030	NC_016831	GCC	2	6	2848244	2848249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956459
48031	NC_016831	ATGCA	2	10	2848268	2848277	40 %	20 %	20 %	20 %	378956459
48032	NC_016831	ACG	2	6	2848350	2848355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956459
48033	NC_016831	ATC	2	6	2848441	2848446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956460
48034	NC_016831	ATT	2	6	2848447	2848452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378956460
48035	NC_016831	CGC	2	6	2848464	2848469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956460
48036	NC_016831	GCG	2	6	2848528	2848533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956460
48037	NC_016831	ACA	2	6	2848550	2848555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378956460
48038	NC_016831	GC	3	6	2848590	2848595	0 %	0 %	50 %	50 %	378956460
48039	NC_016831	GAT	2	6	2848597	2848602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956460
48040	NC_016831	GATGCC	2	12	2848681	2848692	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378956460
48041	NC_016831	GGC	2	6	2848752	2848757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956460
48042	NC_016831	GCC	2	6	2848767	2848772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956460
48043	NC_016831	CAG	2	6	2848810	2848815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956460
48044	NC_016831	CGG	3	9	2848869	2848877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956460
48045	NC_016831	CGC	2	6	2848944	2848949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956460
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48048	NC_016831	GCC	2	6	2849125	2849130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956460
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48050	NC_016831	TGC	2	6	2849270	2849275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956460
48051	NC_016831	GGC	2	6	2849329	2849334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956460
48052	NC_016831	CGC	2	6	2849339	2849344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956460
48053	NC_016831	GTCAAA	2	12	2849365	2849376	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378956460
48054	NC_016831	CAGCG	2	10	2849413	2849422	20 %	0 %	40 %	40 %	378956460
48055	NC_016831	GTGA	2	8	2849506	2849513	25 %	25 %	50 %	0 %	378956460
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48059	NC_016831	GCGT	2	8	2852138	2852145	0 %	25 %	50 %	25 %	378956461
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48061	NC_016831	TTG	2	6	2852201	2852206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378956461
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48073	NC_016831	TAAT	2	8	2852891	2852898	50 %	50 %	0 %	0 %	378956463
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48099	NC_016831	TGC	3	9	2854177	2854185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956465
48100	NC_016831	GCGCG	2	10	2854193	2854202	0 %	0 %	60 %	40 %	378956465
48101	NC_016831	TCA	2	6	2854207	2854212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956465
48102	NC_016831	CG	4	8	2854215	2854222	0 %	0 %	50 %	50 %	378956465
48103	NC_016831	GTG	2	6	2854386	2854391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378956465
48104	NC_016831	CTG	2	6	2854419	2854424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956465
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48110	NC_016831	GAC	2	6	2854636	2854641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956466
48111	NC_016831	GC	3	6	2854664	2854669	0 %	0 %	50 %	50 %	378956466
48112	NC_016831	CG	3	6	2854670	2854675	0 %	0 %	50 %	50 %	378956466
48113	NC_016831	GC	3	6	2854750	2854755	0 %	0 %	50 %	50 %	378956466
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48115	NC_016831	CGC	2	6	2854811	2854816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956466
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48227	NC_016831	GCG	3	9	2859603	2859611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956470
48228	NC_016831	TGGCGT	2	12	2859619	2859630	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378956470
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48466	NC_016831	TTA	2	6	2871566	2871571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378956485
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48468	NC_016831	TAT	2	6	2871635	2871640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378956485
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