MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_016831	GAA	2	6	2569719	2569724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378956215
44002	NC_016831	CGT	2	6	2569727	2569732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956215
44003	NC_016831	CCG	2	6	2569765	2569770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956215
44004	NC_016831	CA	3	6	2569783	2569788	50 %	0 %	0 %	50 %	378956215
44005	NC_016831	ATG	2	6	2569789	2569794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956215
44006	NC_016831	ATA	2	6	2569816	2569821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378956215
44007	NC_016831	TGG	2	6	2569823	2569828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378956215
44008	NC_016831	GAA	2	6	2569836	2569841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378956215
44009	NC_016831	TCA	2	6	2569880	2569885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956215
44010	NC_016831	CAC	2	6	2569908	2569913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956215
44011	NC_016831	CGG	2	6	2569940	2569945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956215
44012	NC_016831	CGA	2	6	2569994	2569999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956215
44013	NC_016831	GGC	2	6	2570085	2570090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956215
44014	NC_016831	GC	3	6	2570119	2570124	0 %	0 %	50 %	50 %	378956215
44015	NC_016831	AT	3	6	2570131	2570136	50 %	50 %	0 %	0 %	378956215
44016	NC_016831	AAT	2	6	2570151	2570156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378956215
44017	NC_016831	CCG	2	6	2570198	2570203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956215
44018	NC_016831	TTA	2	6	2570284	2570289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378956215
44019	NC_016831	A	6	6	2570325	2570330	100 %	0 %	0 %	0 %	378956215
44020	NC_016831	GTG	2	6	2570350	2570355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378956215
44021	NC_016831	CGC	2	6	2570405	2570410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956216
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44023	NC_016831	GCA	2	6	2570506	2570511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956216
44024	NC_016831	GAT	2	6	2570582	2570587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956216
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44032	NC_016831	CGC	2	6	2570863	2570868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956216
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44034	NC_016831	CGC	2	6	2570900	2570905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956216
44035	NC_016831	CTGA	2	8	2570914	2570921	25 %	25 %	25 %	25 %	378956216
44036	NC_016831	CAAGG	2	10	2570957	2570966	40 %	0 %	40 %	20 %	378956216
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44039	NC_016831	GGCC	2	8	2570998	2571005	0 %	0 %	50 %	50 %	378956216
44040	NC_016831	GC	3	6	2571029	2571034	0 %	0 %	50 %	50 %	378956216
44041	NC_016831	CGC	2	6	2571043	2571048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956216
44042	NC_016831	CGC	2	6	2571056	2571061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956216
44043	NC_016831	AAT	2	6	2571224	2571229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378956216
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44045	NC_016831	CAG	2	6	2571440	2571445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956216
44046	NC_016831	CGC	3	9	2571487	2571495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956216
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44050	NC_016831	GAT	2	6	2571662	2571667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956216
44051	NC_016831	CG	3	6	2571670	2571675	0 %	0 %	50 %	50 %	378956216
44052	NC_016831	GGA	2	6	2571752	2571757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378956217
44053	NC_016831	GCG	2	6	2571765	2571770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956217
44054	NC_016831	T	6	6	2571771	2571776	0 %	100 %	0 %	0 %	378956217
44055	NC_016831	GCG	2	6	2571810	2571815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956217
44056	NC_016831	GCA	2	6	2572135	2572140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956218
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44061	NC_016831	GCT	2	6	2572447	2572452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956218
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44104	NC_016831	TCG	2	6	2574719	2574724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956221
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44116	NC_016831	CGG	2	6	2575058	2575063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956221
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44230	NC_016831	AAAC	2	8	2580170	2580177	75 %	0 %	0 %	25 %	378956224
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44232	NC_016831	CCG	2	6	2580229	2580234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956224
44233	NC_016831	AAT	2	6	2580354	2580359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378956224
44234	NC_016831	TTC	2	6	2580468	2580473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378956224
44235	NC_016831	CATC	2	8	2580494	2580501	25 %	25 %	0 %	50 %	378956224
44236	NC_016831	GCC	2	6	2580543	2580548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956224
44237	NC_016831	CGC	2	6	2580581	2580586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956224
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44239	NC_016831	GAC	2	6	2580701	2580706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956224
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44242	NC_016831	AATGCC	2	12	2580795	2580806	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378956224
44243	NC_016831	TCC	2	6	2580883	2580888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378956224
44244	NC_016831	GCT	2	6	2580917	2580922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956224
44245	NC_016831	CAT	2	6	2580929	2580934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956224
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44250	NC_016831	GC	4	8	2581311	2581318	0 %	0 %	50 %	50 %	378956225
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44255	NC_016831	TCAG	2	8	2581479	2581486	25 %	25 %	25 %	25 %	378956225
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44260	NC_016831	GGC	2	6	2581721	2581726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956225
44261	NC_016831	CG	3	6	2581733	2581738	0 %	0 %	50 %	50 %	378956225
44262	NC_016831	CGA	2	6	2581759	2581764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956225
44263	NC_016831	GCA	2	6	2581819	2581824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956225
44264	NC_016831	TGA	2	6	2581953	2581958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956225
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44324	NC_016831	CGC	2	6	2584916	2584921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956232
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44329	NC_016831	TGTTTA	2	12	2585164	2585175	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378956232
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44332	NC_016831	GAA	2	6	2585358	2585363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378956232
44333	NC_016831	GCC	2	6	2585457	2585462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956233
44334	NC_016831	CTTTG	2	10	2585489	2585498	0 %	60 %	20 %	20 %	378956233
44335	NC_016831	CCACGC	2	12	2585563	2585574	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	378956233
44336	NC_016831	GCG	2	6	2585593	2585598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956233
44337	NC_016831	TCG	2	6	2585694	2585699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956233
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44339	NC_016831	ATA	2	6	2585763	2585768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378956233
44340	NC_016831	CAT	2	6	2585782	2585787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956233
44341	NC_016831	CAA	2	6	2585834	2585839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378956233
44342	NC_016831	TGG	2	6	2585853	2585858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378956233
44343	NC_016831	TAA	2	6	2585885	2585890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378956233
44344	NC_016831	CAG	2	6	2586008	2586013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956233
44345	NC_016831	ACA	2	6	2586019	2586024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378956233
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44347	NC_016831	CGA	2	6	2586056	2586061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956233
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