MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_016831	GA	3	6	2490255	2490260	50 %	0 %	50 %	0 %	378956133
42503	NC_016831	GACAG	2	10	2490355	2490364	40 %	0 %	40 %	20 %	378956133
42504	NC_016831	ATA	2	6	2490369	2490374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378956133
42505	NC_016831	TAA	2	6	2490388	2490393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378956133
42506	NC_016831	AAT	2	6	2490472	2490477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378956134
42507	NC_016831	AACA	2	8	2490503	2490510	75 %	0 %	0 %	25 %	378956134
42508	NC_016831	CG	3	6	2490579	2490584	0 %	0 %	50 %	50 %	378956135
42509	NC_016831	CAG	2	6	2490612	2490617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956135
42510	NC_016831	CTT	2	6	2490638	2490643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378956135
42511	NC_016831	T	7	7	2490642	2490648	0 %	100 %	0 %	0 %	378956135
42512	NC_016831	AGC	2	6	2490701	2490706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956135
42513	NC_016831	CGC	2	6	2490717	2490722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956135
42514	NC_016831	ACG	2	6	2490723	2490728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956135
42515	NC_016831	CAG	2	6	2490732	2490737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956135
42516	NC_016831	GCA	2	6	2490746	2490751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956135
42517	NC_016831	GCG	2	6	2490888	2490893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956135
42518	NC_016831	TTC	2	6	2490897	2490902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378956135
42519	NC_016831	TCG	2	6	2490958	2490963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956135
42520	NC_016831	CG	3	6	2491073	2491078	0 %	0 %	50 %	50 %	378956135
42521	NC_016831	CAG	2	6	2491085	2491090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956135
42522	NC_016831	TGC	2	6	2491129	2491134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956135
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42524	NC_016831	TTG	2	6	2491185	2491190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378956135
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42527	NC_016831	CAG	2	6	2491452	2491457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956136
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42532	NC_016831	CAA	2	6	2491800	2491805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378956136
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42538	NC_016831	GCA	2	6	2491967	2491972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956136
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42541	NC_016831	GTTC	2	8	2492222	2492229	0 %	50 %	25 %	25 %	378956136
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42543	NC_016831	TCG	2	6	2492359	2492364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956136
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42551	NC_016831	CGA	2	6	2492672	2492677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956137
42552	NC_016831	CCA	2	6	2492683	2492688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956137
42553	NC_016831	TCC	2	6	2492800	2492805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378956137
42554	NC_016831	CAGGTT	2	12	2492875	2492886	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378956137
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42557	NC_016831	ATGCG	2	10	2493110	2493119	20 %	20 %	40 %	20 %	378956137
42558	NC_016831	GCCG	2	8	2493162	2493169	0 %	0 %	50 %	50 %	378956137
42559	NC_016831	GGT	2	6	2493223	2493228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378956137
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42603	NC_016831	GCGATG	2	12	2495083	2495094	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378956137
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42964	NC_016831	CCA	2	6	2513931	2513936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956159
42965	NC_016831	GC	3	6	2513937	2513942	0 %	0 %	50 %	50 %	378956159
42966	NC_016831	ATC	2	6	2513968	2513973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956159
42967	NC_016831	CTC	2	6	2513995	2514000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378956159
42968	NC_016831	T	6	6	2514025	2514030	0 %	100 %	0 %	0 %	378956159
42969	NC_016831	TCA	2	6	2514045	2514050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956159
42970	NC_016831	TCC	2	6	2514062	2514067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378956159
42971	NC_016831	TCA	2	6	2514101	2514106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956159
42972	NC_016831	GGA	2	6	2514139	2514144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378956159
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42974	NC_016831	T	6	6	2514182	2514187	0 %	100 %	0 %	0 %	378956159
42975	NC_016831	CGC	2	6	2514199	2514204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956159
42976	NC_016831	AAAG	2	8	2514236	2514243	75 %	0 %	25 %	0 %	378956159
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42978	NC_016831	CTG	2	6	2514429	2514434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956160
42979	NC_016831	GATTTT	2	12	2514450	2514461	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378956160
42980	NC_016831	TCA	2	6	2514482	2514487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956160
42981	NC_016831	T	6	6	2514540	2514545	0 %	100 %	0 %	0 %	378956160
42982	NC_016831	CAG	2	6	2514588	2514593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956160
42983	NC_016831	ACG	2	6	2514595	2514600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956160
42984	NC_016831	CGCCA	2	10	2514618	2514627	20 %	0 %	20 %	60 %	378956160
42985	NC_016831	TCG	2	6	2514644	2514649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956160
42986	NC_016831	GCC	2	6	2514667	2514672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956160
42987	NC_016831	CGC	2	6	2514732	2514737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956160
42988	NC_016831	CAG	2	6	2514777	2514782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956160
42989	NC_016831	TGT	2	6	2514805	2514810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378956160
42990	NC_016831	TAT	2	6	2514818	2514823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378956160
42991	NC_016831	CAA	2	6	2514902	2514907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378956160
42992	NC_016831	TTGC	2	8	2515108	2515115	0 %	50 %	25 %	25 %	378956160
42993	NC_016831	CTG	2	6	2515131	2515136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956160
42994	NC_016831	GTC	2	6	2515188	2515193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956160
42995	NC_016831	ATC	2	6	2515233	2515238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956160
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42997	NC_016831	GAC	2	6	2515264	2515269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956160
42998	NC_016831	CCAG	2	8	2515343	2515350	25 %	0 %	25 %	50 %	378956160
42999	NC_016831	CGC	2	6	2515358	2515363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956160
43000	NC_016831	GAT	2	6	2515377	2515382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956160

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