MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_016831	GCG	2	6	2430695	2430700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956083
41502	NC_016831	CGG	2	6	2430721	2430726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956083
41503	NC_016831	CGC	2	6	2430828	2430833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956083
41504	NC_016831	ATC	2	6	2430880	2430885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956083
41505	NC_016831	GCC	2	6	2430891	2430896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956083
41506	NC_016831	A	6	6	2430966	2430971	100 %	0 %	0 %	0 %	378956083
41507	NC_016831	GCG	2	6	2430980	2430985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956083
41508	NC_016831	GC	3	6	2431091	2431096	0 %	0 %	50 %	50 %	378956083
41509	NC_016831	GGC	2	6	2431107	2431112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956083
41510	NC_016831	GAA	2	6	2431140	2431145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378956083
41511	NC_016831	CTG	2	6	2431185	2431190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956083
41512	NC_016831	GCG	2	6	2431217	2431222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956083
41513	NC_016831	TGG	2	6	2431264	2431269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378956083
41514	NC_016831	CAT	2	6	2431299	2431304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956083
41515	NC_016831	CG	3	6	2431458	2431463	0 %	0 %	50 %	50 %	378956083
41516	NC_016831	AGCGCG	2	12	2431585	2431596	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378956083
41517	NC_016831	CGG	2	6	2431683	2431688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956083
41518	NC_016831	GAA	2	6	2431697	2431702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378956083
41519	NC_016831	TTGA	2	8	2431713	2431720	25 %	50 %	25 %	0 %	378956083
41520	NC_016831	TAAT	2	8	2431727	2431734	50 %	50 %	0 %	0 %	378956083
41521	NC_016831	GAA	2	6	2431735	2431740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378956083
41522	NC_016831	CCAG	2	8	2431754	2431761	25 %	0 %	25 %	50 %	378956083
41523	NC_016831	CGA	2	6	2431774	2431779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956083
41524	NC_016831	T	6	6	2431866	2431871	0 %	100 %	0 %	0 %	378956084
41525	NC_016831	CAC	2	6	2431905	2431910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956084
41526	NC_016831	GATG	2	8	2431996	2432003	25 %	25 %	50 %	0 %	378956084
41527	NC_016831	AG	4	8	2432010	2432017	50 %	0 %	50 %	0 %	378956084
41528	NC_016831	GCG	2	6	2432095	2432100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956084
41529	NC_016831	TTG	2	6	2432103	2432108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378956084
41530	NC_016831	CGTTC	2	10	2432128	2432137	0 %	40 %	20 %	40 %	378956084
41531	NC_016831	GCG	2	6	2432182	2432187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956084
41532	NC_016831	GCG	2	6	2432218	2432223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956084
41533	NC_016831	CGG	2	6	2432228	2432233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956084
41534	NC_016831	ACG	2	6	2432251	2432256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956084
41535	NC_016831	TAA	2	6	2432262	2432267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378956084
41536	NC_016831	GC	3	6	2432285	2432290	0 %	0 %	50 %	50 %	378956084
41537	NC_016831	ATC	2	6	2432329	2432334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956084
41538	NC_016831	TGG	2	6	2432383	2432388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378956084
41539	NC_016831	CAT	2	6	2432403	2432408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956084
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41542	NC_016831	CGC	2	6	2432463	2432468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956084
41543	NC_016831	CCG	2	6	2432471	2432476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956084
41544	NC_016831	CCG	2	6	2432485	2432490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956084
41545	NC_016831	CGC	2	6	2432510	2432515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956084
41546	NC_016831	GGCG	2	8	2432570	2432577	0 %	0 %	75 %	25 %	378956084
41547	NC_016831	CGC	2	6	2432679	2432684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956084
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41549	NC_016831	GC	3	6	2432780	2432785	0 %	0 %	50 %	50 %	378956084
41550	NC_016831	CCG	2	6	2432791	2432796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956084
41551	NC_016831	GCG	2	6	2432948	2432953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956084
41552	NC_016831	CAG	2	6	2432994	2432999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956084
41553	NC_016831	ATC	2	6	2433064	2433069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956084
41554	NC_016831	AACG	2	8	2433076	2433083	50 %	0 %	25 %	25 %	378956084
41555	NC_016831	CCG	2	6	2433107	2433112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956084
41556	NC_016831	GCT	2	6	2433210	2433215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956084
41557	NC_016831	CTG	2	6	2433228	2433233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956084
41558	NC_016831	CTT	2	6	2433239	2433244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378956084
41559	NC_016831	CAG	2	6	2433363	2433368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956084
41560	NC_016831	CAT	2	6	2433390	2433395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956084
41561	NC_016831	CAT	2	6	2433404	2433409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956084
41562	NC_016831	ACTC	2	8	2433422	2433429	25 %	25 %	0 %	50 %	378956084
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41569	NC_016831	TTA	2	6	2433609	2433614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378956085
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41582	NC_016831	GC	3	6	2435221	2435226	0 %	0 %	50 %	50 %	378956086
41583	NC_016831	GAA	2	6	2435262	2435267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378956086
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41585	NC_016831	GCA	2	6	2435296	2435301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956086
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41588	NC_016831	CGT	2	6	2435501	2435506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956086
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41591	NC_016831	CAGT	2	8	2435624	2435631	25 %	25 %	25 %	25 %	378956086
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41593	NC_016831	ATCGAT	2	12	2435835	2435846	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378956086
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41595	NC_016831	TG	3	6	2435908	2435913	0 %	50 %	50 %	0 %	378956086
41596	NC_016831	AAC	2	6	2435920	2435925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378956086
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41604	NC_016831	TCG	2	6	2436308	2436313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956087
41605	NC_016831	GGC	2	6	2436340	2436345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956087
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41607	NC_016831	GGC	2	6	2436361	2436366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956087
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41611	NC_016831	CGC	2	6	2436532	2436537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956087
41612	NC_016831	TGGT	2	8	2436565	2436572	0 %	50 %	50 %	0 %	378956087
41613	NC_016831	GCCA	2	8	2436583	2436590	25 %	0 %	25 %	50 %	378956087
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