MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_016831	CTG	2	6	2351430	2351435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956001
40003	NC_016831	ACT	2	6	2351527	2351532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956001
40004	NC_016831	GGC	2	6	2351533	2351538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956001
40005	NC_016831	TGG	2	6	2351581	2351586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378956001
40006	NC_016831	TCA	2	6	2351720	2351725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956002
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40008	NC_016831	GCC	2	6	2351782	2351787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956002
40009	NC_016831	CGA	2	6	2351793	2351798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956002
40010	NC_016831	CGC	2	6	2351884	2351889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956002
40011	NC_016831	AGCC	2	8	2351924	2351931	25 %	0 %	25 %	50 %	378956002
40012	NC_016831	CGC	2	6	2351988	2351993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956002
40013	NC_016831	G	7	7	2352150	2352156	0 %	0 %	100 %	0 %	378956002
40014	NC_016831	GC	3	6	2352266	2352271	0 %	0 %	50 %	50 %	378956002
40015	NC_016831	CGT	2	6	2352330	2352335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956002
40016	NC_016831	GAT	2	6	2352435	2352440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956002
40017	NC_016831	CTC	2	6	2352453	2352458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378956002
40018	NC_016831	CAGCCG	2	12	2352469	2352480	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378956002
40019	NC_016831	TAT	2	6	2352507	2352512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378956002
40020	NC_016831	TAT	2	6	2352780	2352785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378956003
40021	NC_016831	TCT	2	6	2352819	2352824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378956003
40022	NC_016831	CG	3	6	2352883	2352888	0 %	0 %	50 %	50 %	378956003
40023	NC_016831	GTC	2	6	2352922	2352927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956003
40024	NC_016831	CGGCG	2	10	2353047	2353056	0 %	0 %	60 %	40 %	378956003
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40028	NC_016831	CG	3	6	2353390	2353395	0 %	0 %	50 %	50 %	378956004
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40031	NC_016831	CGC	3	9	2353591	2353599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956004
40032	NC_016831	CCG	2	6	2353606	2353611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956004
40033	NC_016831	GCT	2	6	2353637	2353642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956004
40034	NC_016831	CGC	2	6	2353726	2353731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956004
40035	NC_016831	GAT	2	6	2353751	2353756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956004
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40045	NC_016831	AGAA	2	8	2353991	2353998	75 %	0 %	25 %	0 %	378956004
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40051	NC_016831	TCG	2	6	2354155	2354160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956004
40052	NC_016831	CGT	2	6	2354170	2354175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956004
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40054	NC_016831	TTC	2	6	2354274	2354279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378956004
40055	NC_016831	CAT	2	6	2354281	2354286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956004
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40106	NC_016831	TCCAG	2	10	2356857	2356866	20 %	20 %	20 %	40 %	378956010
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40224	NC_016831	TAT	2	6	2363875	2363880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378956015
40225	NC_016831	TGA	2	6	2363913	2363918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956015
40226	NC_016831	AT	3	6	2363929	2363934	50 %	50 %	0 %	0 %	378956015
40227	NC_016831	AAT	2	6	2364050	2364055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378956015
40228	NC_016831	TTGT	2	8	2364063	2364070	0 %	75 %	25 %	0 %	378956015
40229	NC_016831	CGA	2	6	2364145	2364150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956015
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40231	NC_016831	AAT	2	6	2364241	2364246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378956015
40232	NC_016831	TGA	2	6	2364267	2364272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956015
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40352	NC_016831	CCA	2	6	2371129	2371134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956020
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40451	NC_016831	CCGTCA	2	12	2375911	2375922	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378956025
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40463	NC_016831	CGT	2	6	2376771	2376776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956026
40464	NC_016831	CGA	2	6	2376813	2376818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956026
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